1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
...aatttcacactgcacattgttgatattagtttgttataaattatagtggtttataattaagtaaagtagtaagtaagtgtatgtgcaatgttgattgcagAGGGGATGTGGCAACAAATGGCCATGGACAGCGGTGCCACTATGCAACCTGGGTCATATCCTGAGCGACCAGGTGAACCCGACTGCACTTACTATCTCAG
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G087032_T01 |
intron # | 1 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CACTGCTGCCGTCGACAGGTCCTCCCCCGACCCCGACGCGCTCTATGAAG AGGGGATGTGGCAACAGATGGCCATGGACAGCGGTGCCACTATGCAACCTGEST: gi|211213427|gb|FL335733.1|FL335733
genomic: CACTGCTGCCGTCGACAGGTCCTCCCCCGACCCCGACGCGCTCTATGAAGgttagggatt ... ttgattgcagAGGGGATGTGGCAACAAATGGCCATGGACAGCGGTGCCACTATGCAACCTG
EST: CACTGCTGCCGTCGACAGGTCCTCCCCCGACCCCGACGCGCTCTATGAAG AGGGGATGTGGCAACAAATGGCCATGGACAGCGGTGCCACTATGCAACCTGEST: gi|211485765|gb|FL084118.1|FL084118
genomic: CACTGCTGCCGTCGACAGGTCCTCCCCCGACCCCGACGCGCTCTATGAAGgttagggatt ... ttgattgcagAGGGGATGTGGCAACAAATGGCCATGGACAGCGGTGCCACTATGCAACCTG
EST: CACTGCTGCCGTCGACAGGTCCTCCCCCGACCCCGACGCGCTCTATGAAG AGGGGATGTGGCAACAAATGGCCATGGACAGCGGTGCCACTATGCAACCTG
genomic: CACTGCTGCCGTCGACAGGTCCTCCCCCGACCCCGACGCGCTCTATGAAGgttagggatt ... ttgattgcagAGGGGATGTGGCAACAAATGGCCATGGACAGCGGTGCCACTATGCAACCTG
gtggtttataattaagtaaagtagtaagtaagtgtatgtgcaatgttgattgcagAGGGGATGTGGCAACAAATGGCCATGGACAGCGGTGCCACTATGCAACCTGGGTCATATCCTGAGCGACCAGGTGAACCCGACTGCACTTACTATCTCAG
tgttgat putative branch site (score: 4)
ttataattaagtaaag TA-rich tract