1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' |
gtatgtgatattacctgcatcaattctgatgtctctactgcctattttaatcttcttctttttctttggtttcactatgcagATGACATAGGCTTTATATGTCAACAATGTGGTCTTGTTAGGAACAAAGAGGAGATAAAAAGGCTTGCAAGCGAACTAAAACCACTGTCAGATAAGGCTAC
species | Vitis vinifera |
transcript | Vv18s0001g03730.t01 |
intron # | 9 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GTACAGATGCAAGGATGATAGATGTGATGGTTTTTTGCTTCGTGATTCTG ATGACAAAGGCTTTATATGTCAACAATGTGGTCTTGTTAGGAACAAAGAGGEST: gi|30126004|gb|CB911343.1|CB911343
genomic: GTACAGATGCAAGGATGATAGATGTGATGGTTTTTTGCTTCGTGATTCTGgtatgtgata ... cactatgcagATGACATAGGCTTTATATGTCAACAATGTGGTCTTGTTAGGAACAAAGAGG
EST: GTACAGATGCAAGGATGATAGATGTGATGGTTTTTTGCTTCGTGATTCTG ATGACAAAGGCTTTATATGTCAACAATGTGGTCTTGTTAGGAACAAAGAGG
genomic: GTACAGATGCAAGGATGATAGATGTGATGGTTTTTTGCTTCGTGATTCTGgtatgtgata ... cactatgcagATGACATAGGCTTTATATGTCAACAATGTGGTCTTGTTAGGAACAAAGAGG
gatgtctctactgcctattttaatcttcttctttttctttggtttcactatgcagATGACATAGGCTTTATATGTCAACAATGTGGTCTTGTTAGGAACAAAGAGGAGATAAAAAGGCTTGCAAGCGAACTAAAACCACTGTCAGATAAGGCTAC
ttttaat putative branch site (score: 3)
ttttaatcttcttctt CT-rich tract
tattttaatcttcttc TA-rich tract