1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' |
gtattatgcatgtgccctgcacacaacagaggattcaagatcatagatattgagtactggtaataacagtttgtatttattttggcagTCAACTGGAGCTTATAAGGCTGCGTCTCGGCTAGCAAGTGCCACACCACCTCCAGCCCACGTCCTTAGCCGGGGTATCGGCTGGCAG
species | Vitis vinifera |
transcript | Vv10s0003g01460.t01 |
intron # | 8 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CTGGTCATGCTTTTGGAATGATGGCTGCTGTCCTGGTCTCCTTGATTGAG TCAACTGGAGCTTATAAGGCTGCGTCTCGGCTAGCAAGTGCCACACCACCTEST: gi|30252280|gb|CB969831.1|CB969831
genomic: CTGGTCATGCTTTTGGAATGATGGCTGCTGTCCTGGTCTCCTTGATTGAGgtattatgca ... attttggcagTCAACTGGAGCTTATAAGGCTGCGTCTCGGCTAGCAAGTGCCACACCACCT
EST: CTGGTCATGCTTTTGGAATGATGGCTGCTGTCCTGGTCTCCTTGATTGAG TCAACTGGAGCTTATAAGGCTGCGTCTCGGCTAGCAAGTGCCACACCACCTEST: gi|30251875|gb|CB969608.1|CB969608
genomic: CTGGTCATGCTTTTGGAATGATGGCTGCTGTCCTGGTCTCCTTGATTGAGgtattatgca ... attttggcagTCAACTGGAGCTTATAAGGCTGCGTCTCGGCTAGCAAGTGCCACACCACCT
EST: CTGGTCATGCTTTTGGAATGATGGCTGCTGTCCTGGTCTCCTTGATTGAG TCAACTGGAGCTTATAAGGCTGCGTCTCGGCTAGCAAGTGCCACACCACCTEST: gi|30252292|gb|CB969843.1|CB969843
genomic: CTGGTCATGCTTTTGGAATGATGGCTGCTGTCCTGGTCTCCTTGATTGAGgtattatgca ... attttggcagTCAACTGGAGCTTATAAGGCTGCGTCTCGGCTAGCAAGTGCCACACCACCT
EST: CTGGTCATGCTTTTGGAATGATGGCTGCTGTCCTGGTCTCCTTGATTGAG TCAACTGGAGCTTATAAGGCTGCGTCTCGGCTAGCAAGTGCCACACCACCTEST: gi|30252293|gb|CB969844.1|CB969844
genomic: CTGGTCATGCTTTTGGAATGATGGCTGCTGTCCTGGTCTCCTTGATTGAGgtattatgca ... attttggcagTCAACTGGAGCTTATAAGGCTGCGTCTCGGCTAGCAAGTGCCACACCACCT
EST: CTGGTCATGCTTTTGGAATGATGGCTGCTGTCCTGGTCTCCTTGATTGAG TCAACTGGAGCTTATAAGGCTGCGTCTCGGCTAGCAAGTGCCACACCACCTEST: gi|30251886|gb|CB969619.1|CB969619
genomic: CTGGTCATGCTTTTGGAATGATGGCTGCTGTCCTGGTCTCCTTGATTGAGgtattatgca ... attttggcagTCAACTGGAGCTTATAAGGCTGCGTCTCGGCTAGCAAGTGCCACACCACCT
EST: CTGGTCATGCTTTTGGAATGATGGCTGCTGTCCTGGTCTCCTTGATTGAG TCAACTGGAGCTTATAAGGCTGCGTCTCGGCTAGCAAGTGCCACACCACCT
genomic: CTGGTCATGCTTTTGGAATGATGGCTGCTGTCCTGGTCTCCTTGATTGAGgtattatgca ... attttggcagTCAACTGGAGCTTATAAGGCTGCGTCTCGGCTAGCAAGTGCCACACCACCT
ttcaagatcatagatattgagtactggtaataacagtttgtatttattttggcagTCAACTGGAGCTTATAAGGCTGCGTCTCGGCTAGCAAGTGCCACACCACCTCCAGCCCACGTCCTTAGCCGGGGTATCGGCTGGCAG
taataac putative branch site (score: 1)
tttatttt putative PPT
taataacagtttgtat TA-rich tract