1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' |
gtaagaagtcatatttttattgcttcatactttcaattccatttagcctctaggttcttgtagcagaatcatacatttttatcttggcctctttagGTACAACACTATCCCCTTGGATTGTGACCCTTGATGCTCTAGAGCCCTTTGCTTGTGATGCTCCAAAACAG
species | Vitis vinifera |
transcript | Vv00s0187g00340.t01 |
intron # | 8 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTG GTACAACACTATCCCCTTGGATTGTGACCCTTGATGCTCTAGAGCCCTTTGEST: gi|110398457|gb|EC964831.1|EC964831
genomic: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTGgtaagaagtc ... gcctctttagGTACAACACTATCCCCTTGGATTGTGACCCTTGATGCTCTAGAGCCCTTTG
EST: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTG GTACAACACTATCCCCTTGGATTGTGACCCTTGATGCEST: gi|351044107|gb|FQ452780.1|FQ452780
genomic: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTGgtaagaagtc ... gcctctttagGTACAACACTATCCCCTTGGATTGTGACCCTTGATGC
EST: CAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTG GGACAACACTATCCCCTTGGAEST: gi|161719983|gb|FC067725.1|FC067725
genomic: CAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGG-CCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTGgtaagaagtc ... gcctctttagGTACAACACTATCCCCTTGGA
EST: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTG GTACAACACTATCCCCTTGGATTGTGACCCTTGATGCTCTAGAGCCCTTTGEST: gi|351041887|gb|FQ456097.1|FQ456097
genomic: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTGgtaagaagtc ... gcctctttagGTACAACACTATCCCCTTGGATTGTGACCCTTGATGCTCTAGAGCCCTTTG
EST: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTG GTACAACACTATCCCCTTGGAEST: gi|110363209|gb|EC926783.1|EC926783
genomic: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTGgtaagaagtc ... gcctctttagGTACAACACTATCCCCTTGGA
EST: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTG GTACAACACTATCCCCTTGGATTGTGACCCTTGATGCTCTAGAGCCCTTTGEST: gi|110685821|gb|EE062874.1|EE062874
genomic: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTGgtaagaagtc ... gcctctttagGTACAACACTATCCCCTTGGATTGTGACCCTTGATGCTCTAGAGCCCTTTG
EST: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCTTTTTCTTGGGAAGAGTTTTG GTA-AACACTATCCCCTTGGAATGTGACCCTTGATGCTCTEST: gi|110402111|gb|EC968746.1|EC968746
genomic: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTGgtaagaagtc ... gcctctttagGTACAACACTATCCCCTTGGATTGTGACCCTTGATGCTCT
EST: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTG GTACAACACTATCCCCTTGGATTGTGACCCTTGATGCTCTAGAGCCCTTTGEST: gi|110685834|gb|EE062901.1|EE062901
genomic: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTGgtaagaagtc ... gcctctttagGTACAACACTATCCCCTTGGATTGTGACCCTTGATGCTCTAGAGCCCTTTG
EST: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGGAGAGTTTTG GTACA-CACTATCCCCTTGGATTG-GACCCTTGATGCTCTAAAGCCCTTTGEST: gi|352790319|gb|FQ481518.1|FQ481518
genomic: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTGgtaagaagtc ... gcctctttagGTACAACACTATCCCCTTGGATTGTGACCCTTGATGCTCTAGAGCCCTTTG
EST: CAGGCATGGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTG GGACAACACTATEST: gi|351042501|gb|FQ431099.1|FQ431099
genomic: CAGGCATGGG-AATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTGgtaagaagtc ... gcctctttagGTACAACACTAT
EST: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTG GTACAACACTATCCCCTTGGATTEST: gi|351042415|gb|FQ442882.1|FQ442882
genomic: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTGgtaagaagtc ... gcctctttagGTACAACACTATCCCCTTGGATT
EST: CAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTTCT-GGGAAGAGTTTTG GTACAACACTATCCCCTTGGATTGTGACCCTTGATGCTCTAGAGCCCTTTGEST: gi|110361741|gb|EC925237.1|EC925237
genomic: CAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTT-CTTGGGAAGAGTTTTGgtaagaagtc ... gcctctttagGTACAACACTATCCCCTTGGATTGTGACCCTTGATGCTCTAGAGCCCTTTG
EST: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTG GTACAACACTATCCCCTTGGATTGTGACCCTTGATGCTCTAGAGCCCTTTGEST: gi|161721615|gb|FC070825.1|FC070825
genomic: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTGgtaagaagtc ... gcctctttagGTACAACACTATCCCCTTGGATTGTGACCCTTGATGCTCTAGAGCCCTTTG
EST: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTG GTACAACACTATCCCCTTGGATTGTGACCCTTGATGCTCTAGAGCCCTTTGEST: gi|110359415|gb|EC920866.1|EC920866
genomic: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTGgtaagaagtc ... gcctctttagGTACAACACTATCCCCTTGGATTGTGACCCTTGATGCTCTAGAGCCCTTTG
EST: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTG GTACAACACTATCCCCTTGGATTGTGACCCTTGATGCTCTAGAGCCCTTTGEST: gi|110685064|gb|EE063059.1|EE063059
genomic: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTGgtaagaagtc ... gcctctttagGTACAACACTATCCCCTTGGATTGTGACCCTTGATGCTCTAGAGCCCTTTG
EST: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGGCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTG GTACAACACTATCCCCTTGGATTGTGACCCTTGATGCTCTAGAGCCCTTTGEST: gi|352798557|gb|FQ480582.1|FQ480582
genomic: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTGgtaagaagtc ... gcctctttagGTACAACACTATCCCCTTGGATTGTGACCCTTGATGCTCTAGAGCCCTTTG
EST: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTG GTACAACACTATCCCCTTGGATTGTGEST: gi|110364853|gb|EC928407.1|EC928407
genomic: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTGgtaagaagtc ... gcctctttagGTACAACACTATCCCCTTGGATTGTG
EST: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTG GTACAACACTATCCCCTTGGATTGTGACCCTTGATGCTCTAGAGCCCTTTGEST: gi|110372453|gb|EC936619.1|EC936619
genomic: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTGgtaagaagtc ... gcctctttagGTACAACACTATCCCCTTGGATTGTGACCCTTGATGCTCTAGAGCCCTTTG
EST: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTG GTACAACACTATCCCCTTGGATTGTGACCCTTGATGCTCTAGAGCCCTTTGEST: gi|351037420|gb|FQ460619.1|FQ460619
genomic: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTGgtaagaagtc ... gcctctttagGTACAACACTATCCCCTTGGATTGTGACCCTTGATGCTCTAGAGCCCTTTG
EST: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTG GTACAACACTATCCCCEST: gi|110392090|gb|EC957263.1|EC957263
genomic: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTGgtaagaagtc ... gcctctttagGTACAACACTATCCCC
EST: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTG GTACAACACTATCCCCTTGGATTGTGACCCTTGATGCTCTAGAGCCCTTTGEST: gi|351054049|gb|FQ441815.1|FQ441815
genomic: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTGgtaagaagtc ... gcctctttagGTACAACACTATCCCCTTGGATTGTGACCCTTGATGCTCTAGAGCCCTTTG
EST: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTG GTACAACACTATCCCCTTGGATTGTGAEST: gi|352795676|gb|FQ480264.1|FQ480264
genomic: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTGgtaagaagtc ... gcctctttagGTACAACACTATCCCCTTGGATTGTGA
EST: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTG GTACAACACTATCCEST: gi|110733040|gb|EE108853.1|EE108853
genomic: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTGgtaagaagtc ... gcctctttagGTACAACACTATCC
EST: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTG GTACAACACTATCCCCTTGGATTGTGACCCTTGATGCTCTAGAGCCCTTTGEST: gi|351037729|gb|FQ464170.1|FQ464170
genomic: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTGgtaagaagtc ... gcctctttagGTACAACACTATCCCCTTGGATTGTGACCCTTGATGCTCTAGAGCCCTTTG
EST: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTG GGTACA-CACTATCCCCCTGGATTGTGACCEST: gi|110702040|gb|EE080300.1|EE080300
genomic: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTGgtaagaagtc ... gcctctttagG-TACAACACTATCCCCTTGGATTGTGACC
EST: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTG GTACAACACTATCCCCTTGGATTGTGACCCTTGATGCTCTAGAGCCCTTTGEST: gi|351044448|gb|FQ442979.1|FQ442979
genomic: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTGgtaagaagtc ... gcctctttagGTACAACACTATCCCCTTGGATTGTGACCCTTGATGCTCTAGAGCCCTTTG
EST: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTGGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTG GTACAACACTATTCCCTTGGATTGTGACCCTTGAEST: gi|110699293|gb|EE076166.1|EE076166
genomic: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTGgtaagaagtc ... gcctctttagGTACAACACTATCCCCTTGGATTGTGACCCTTGA
EST: AGGCATGGGCATATGTGCCTTCT-GGGCCTTTTTCT-GGGAAAAGTTTTG GGACAA-ACCTATCCCCTTGGATTGGGACCCTEST: gi|352794073|gb|FQ479315.1|FQ479315
genomic: AGGCATGGGAATATGTGCCT-CTTGGGCCTTTT-CTTGGGAAGAGTTTTGgtaagaagtc ... gcctctttagGTACAACAC-TATCCCCTTGGATTGTGACCCT
EST: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTG GTACAACACTATCCCCEST: gi|352795679|gb|FQ480267.1|FQ480267
genomic: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTGgtaagaagtc ... gcctctttagGTACAACACTATCCCC
EST: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTG GTACAACACTATCCCCTTGGATTGTEST: gi|110359320|gb|EC920619.1|EC920619
genomic: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTGgtaagaagtc ... gcctctttagGTACAACACTATCCCCTTGGATTGT
EST: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTG GTACAACACTATCCCCCTTGGATTGTGACCCTTGATGCTCTAGAGCCCTTTEST: gi|351038410|gb|FQ461102.1|FQ461102
genomic: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTGgtaagaagtc ... gcctctttagGTACAACACTATCCCC-TTGGATTGTGACCCTTGATGCTCTAGAGCCCTTT
EST: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTG GTAACA-CACTATCCCCTTGEST: gi|352793908|gb|FQ479150.1|FQ479150
genomic: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTGgtaagaagtc ... gcctctttagGTA-CAACACTATCCCCTTG
EST: TCAAGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTG GTACAACACTATCCC
genomic: TCAGGCATGGGAATATGTGCCTCTTGGGCCTTTTCTTGGGAAGAGTTTTGgtaagaagtc ... gcctctttagGTACAACACTATCCC
tttagcctctaggttcttgtagcagaatcatacatttttatcttggcctctttagGTACAACACTATCCCCTTGGATTGTGACCCTTGATGCTCTAGAGCCCTTTGCTTGTGATGCTCCAAAACAG
cctcttt CT-rich tract
aatcatacatttttat TA-rich tract