1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' |
gtaagttgtttttaacctctctctctctctctctctccctctctctctctctcacacacacacacattggaggaatttttccttgagctgggttttaatattggatggcttgtttgaaacagAGGTGTTCCACCTGGTGCTCGATTTGATCCTTATGGCCCACCTGGCGTTCCTGGTTTTGAGCCTAATAGATTTACCAG
species | Vitis vinifera |
transcript | Vv08s0007g01340.t01 |
intron # | 7 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CGCTGGTTTGGTGGAGTAGGTGGAGACCCCAGCTTTCCTGGAGGACAACC AGGTGTTCCACCTGGTGCTCGATTTGAATC-TTATGGCCCACCTGGGCGTTEST: gi|110372149|gb|EC936298.1|EC936298
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genomic: CGCTGGTTTGGTGGAGTAGGTGGAGACCCCAGCTTTCCTGGAGGACAACCgtaagttgtt ... tttgaaacagAGGTGTTCCACCTGGTGCTCGATTTGATCCTTATGGCCCACCTGGCGTTCC
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genomic: CTGGTTTGG-TGGAGTAGGTGG-AGACCCCAGCTTTCCTGGAGGACAACCgtaagttgtt ... tttgaaacagAGGTGTTCCACCTGG
EST: GCTGGTTTGGTGGAGTAGGGTGGAGACCCCAGCTTTCCTGGAGGACAACC AGGTGTTCCACCTGGTGCTCGATTTGATCCTTATGGCCCACCTGGCGTTCCEST: gi|351023717|gb|FQ448268.1|FQ448268
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genomic: CGCTGGTTTGGTGGAGTAGGTGGAGACCCCAGCTTTCCTGGAGGACAACCgtaagttgtt ... tttgaaacagAGGTGTTCCACCTG
EST: CGCTGGTTTGGTGGAGTAGGTGGAGACCCCAGCTTTCCTGGAGGACAACC AGGTGTTCCACCTGGTGCTCGATTTGATCCTTATGGCCCACCTGGCGTTCC
genomic: CGCTGGTTTGGTGGAGTAGGTGGAGACCCCAGCTTTCCTGGAGGACAACCgtaagttgtt ... tttgaaacagAGGTGTTCCACCTGGTGCTCGATTTGATCCTTATGGCCCACCTGGCGTTCC
tggaggaatttttccttgagctgggttttaatattggatggcttgtttgaaacagAGGTGTTCCACCTGGTGCTCGATTTGATCCTTATGGCCCACCTGGCGTTCCTGGTTTTGAGCCTAATAGATTTACCAG
ttttaat putative branch site (score: 3)
cttgttt putative PPT
ttttaatattggat TA-rich tract