1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' |
gtatatcgcagaaccctccttttgtttgtatgtattacaattcagatgctggtttggactcattcattctcactggctaacattatacggtgttgttgatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTGAGATATTCATGGGTGGGAAGAGCACCATTGTGCTGCACAACACCTGCG
species | Vitis vinifera |
transcript | Vv07s0031g00920.t01 |
intron # | 7 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGACAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|110380224|gb|EC945471.1|EC945471
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGACAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|27581907|gb|CB004602.1|CB004602
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|110371149|gb|EC934944.1|EC934944
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGACAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|18458737|gb|BM437015.1|BM437015
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGNGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGEST: gi|110729372|gb|EE105268.1|EE105268
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAG
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|110703366|gb|EE080147.1|EE080147
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|18458132|gb|BM436410.1|BM436410
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGNGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTAEST: gi|27584208|gb|CB006903.1|CB006903
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTA
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|110392888|gb|EC957465.1|EC957465
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGACAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|33405434|gb|CF211061.1|CF211061
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGACAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|27580032|gb|CB002727.1|CB002727
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|351016826|gb|FQ424253.1|FQ424253
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGACAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|110687646|gb|EE065294.1|EE065294
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|29784522|gb|CB345364.2|CB345364
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGTACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGACAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|30295971|gb|CB972765.1|CB972765
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCG-G AEST: gi|30295971|gb|CB972765.1|CB972765
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcag-
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCG-G AEST: gi|294966526|gb|GW837661.1|GW837661
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcag-
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|34546447|gb|CF514679.1|CF514679
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGACAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTTTEST: gi|110698809|gb|EE076731.1|EE076731
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: GTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|110367003|gb|EC930923.1|EC930923
genomic: GTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGACAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|110686165|gb|EE063519.1|EE063519
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|110715508|gb|EE093637.1|EE093637
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|110699239|gb|EE076063.1|EE076063
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|30327700|gb|CD010962.1|CD010962
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|225387940|gb|GO307571.1|GO307571
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGACAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTEST: gi|110373349|gb|EC937577.1|EC937577
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGT
EST: GAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGACAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|110373310|gb|EC937535.1|EC937535
genomic: GAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGACAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|110685059|gb|EE063046.1|EE063046
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGACAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|156736210|gb|EV240331.1|EV240331
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGAATGAGTACACTTCTEST: gi|110426355|gb|EC992761.1|EC992761
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: ATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|28966389|gb|CB345422.1|CB345422
genomic: ATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGTACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGACAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|18458241|gb|BM436519.1|BM436519
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|110707572|gb|EE084125.1|EE084125
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|33407001|gb|CF212628.1|CF212628
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGACAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|27581095|gb|CB003790.1|CB003790
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|110706220|gb|EE081554.1|EE081554
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|110394196|gb|EC958827.1|EC958827
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGACAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|110393199|gb|EC958269.1|EC958269
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGACAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|83274450|gb|DV938547.1|DV938547
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGACAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|110697958|gb|EE075424.1|EE075424
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGGGGTGGGCATCAAG TATGTGCCATATGGTGGAGATAGCAAGAGAGEST: gi|71871789|gb|DT020844.1|DT020844
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAG
EST: GGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGACAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|27580245|gb|CB002940.1|CB002940
genomic: GGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|30327647|gb|CD010909.1|CD010909
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|34550186|gb|CF518404.1|CF518404
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGACAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|110704772|gb|EE081830.1|EE081830
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|18458286|gb|BM436564.1|BM436564
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|32268348|gb|CD717507.1|CD717507
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|29784589|gb|CB345506.2|CB345506
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGACAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|110699378|gb|EE076322.1|EE076322
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|110426092|gb|EC992489.1|EC992489
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGACAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|110415028|gb|EC980897.1|EC980897
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGACAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|110396188|gb|EC961869.1|EC961869
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGACAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|110730377|gb|EE107389.1|EE107389
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|110398285|gb|EC964538.1|EC964538
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGACAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|32268456|gb|CD717615.1|CD717615
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|110420851|gb|EC987136.1|EC987136
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: GCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGACAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|110390762|gb|EC955689.1|EC955689
genomic: GCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGACAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|34547806|gb|CF516038.1|CF516038
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATTGTTGGGAGACAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTEST: gi|32249601|gb|CD715420.1|CD715420
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATAT-GTTGG-AGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|18459650|gb|BM437928.1|BM437928
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAG TATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATG
genomic: CTATCCTGTATGAGCCTGGGGAGCACCCTGACCATGTGGTGGTCATCAAGgtatatcgca ... gatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATG
tttggactcattcattctcactggctaacattatacggtgttgttgatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTGAGATATTCATGGGTGGGAAGAGCACCATTGTGCTGCACAACACCTGCG
taacattata TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| gtatatcgcagaaccctccttttgtttgtatgtattacaattcagatgctggtttggactcattcattctcactggctaacattatacggtgttgttgatattgcagTATGTGCCATATGTTGGAGATAGCAAGAGAGCCATGGATGAGTACACTTCTGAGATATTCATGGGTGGGAAGAGCACCATTGTGCTGCACAACACCTGCG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGAGCA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGCTGC