1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' |
gtactgataaacaaagatatggtcagaacactaatttgagttcttggattcttaacttgatggttagctgcagcctgcaaccaaaatagatttcaggggtccaaccttgctgagaagtacattttatgtagaatggatagagcctaatgctttagttgtcattatgttggtatggaacagGAATGGAGCTATCTACGAGGAGGGCTAACAACGGTTGATCGTGACTATGGCTGGTTTAACAACATCCACCATGACATTGGCACCCATGTTATACATCATC
species | Vitis vinifera |
transcript | Vv06s0004g06730.t01 |
intron # | 7 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: ACTTGCATCACCATGGCTATGAGAAAAAACTTCCATGGTATCGGGGCAAG GAATGGAGCTATCTACGAGGAGGGCTAACAACGGTTGATCGTGACTATGGCEST: gi|110377424|gb|EC942487.1|EC942487
genomic: ACTTGCATCACCATGGCTATGAGCAAAAACTTCCATGGTATCGGGGCAAGgtactgataa ... tatggaacagGAATGGAGCTATCTACGAGGAGGGCTAACAACGGTTGATCGTGACTATGGC
EST: ACTTGCATCACCATGGCTATGAGAAAAAACTTCCATGGTATCGGGGCAAG GAATGGAGCTATCTACGAGGAGGGCTAACAACGGTTGATCGTGACTATGGC
genomic: ACTTGCATCACCATGGCTATGAGCAAAAACTTCCATGGTATCGGGGCAAGgtactgataa ... tatggaacagGAATGGAGCTATCTACGAGGAGGGCTAACAACGGTTGATCGTGACTATGGC
atgtagaatggatagagcctaatgctttagttgtcattatgttggtatggaacagGAATGGAGCTATCTACGAGGAGGGCTAACAACGGTTGATCGTGACTATGGCTGGTTTAACAACATCCACCATGACATTGGCACCCATGTTATACATCATC
gcctaat putative branch site (score: 3)
attatgtt TA-rich tract