1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' |
gtaatatatgaaattgatcattgaatgatttatgtgtgttcttgaattgaatggtattgtttgatttatggattttctgacgtgggaatggaaaattgaatggtttggatccagaatgaatggagcatgtttgtggaatgtaggctaattgtgttgttttctttgagcagATGTTAATGCAAGGGAAGGGTGGTCGCTATACCTCGGTTTTCCAGCAATATCAGCAGAAGGCTGAGTTTTTCATGTGTTCATGCCTGGGAAAGGGCACTA
species | Vitis vinifera |
transcript | Vv02s0025g01380.t01 |
intron # | 7 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: AGTTCGGGTGGGACGCCAAGTATGCTGGGGTTCAGGTTCTTGTGGCTAAG ATGTTAATGCAAGGGAAGGGTGGTCGCTATACCTCGGTTTTCCAGCAATATEST: gi|161717038|gb|FC065898.1|FC065898
genomic: AGTTCGGGTGGGACGCCAAGTATGCTGGGGTTCAGGTTCTTGTGGCTAAGgtaatatatg ... ctttgagcagATGTTAATGCAAGGGAAGGGTGGTCGCTATACCTCGGTTTTCCAGCAATAT
EST: AGTTCGGGTGGGACGCCAAGTATGCTGGGGTTCAGGTTCTTGTGGCTAAG ATGTTAATGCAAGGGAAGGGTGGTCGCTATACCTCGGTTTTCCAGCAATAT
genomic: AGTTCGGGTGGGACGCCAAGTATGCTGGGGTTCAGGTTCTTGTGGCTAAGgtaatatatg ... ctttgagcagATGTTAATGCAAGGGAAGGGTGGTCGCTATACCTCGGTTTTCCAGCAATAT
atgaatggagcatgtttgtggaatgtaggctaattgtgttgttttctttgagcagATGTTAATGCAAGGGAAGGGTGGTCGCTATACCTCGGTTTTCCAGCAATATCAGCAGAAGGCTGAGTTTTTCATGTGTTCATGCCTGGGAAAGGGCACTA
ggctaat putative branch site (score: 3)
ttgttttcttt putative PPT
ttttcttt TA-rich tract