Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtctctctctctctctctctctctctctctctctctctttctttgtggtgtgatgattgtttgtatgaatttgcagATGGGTTTGATGTATGGGTGTTCAGTGGAAGATGTCATCACTGGGTTGGTAATTCAATGCAAGGGTTGGGAACCAGTTTACTATAGTCCCTGTAAAAGGG

Basic information

species Vitis vinifera
transcript Vv19s0015g00730.t01
intron # 6
splice site 3'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|352776476|gb|FQ474778.1|FQ474778
EST:     AAGTCCTTGCCAATTGTAGCTATGAGAAGGGTACTCTATGGGGGCAAGAG                         ATGGGTTTGATGTATGGGTGTTCAGTGGAAGATGTCATCACTGGGTTGGTA
genomic: AAGTCCTTGCCAATTGTAGCTATGAGAAGGGTACTCTATGGGGGCAAGAGgtctctctct ... gaatttgcagATGGGTTTGATGTATGGGTGTTCAGTGGAAGATGTCATCACTGGGTTGGTA






















 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

tctctctctctctctctttctttgtggtgtgatgattgtttgtatgaatttgcagATGGGTTTGATGTATGGGTGTTCAGTGGAAGATGTCATCACTGGGTTGGTAATTCAATGCAAGGGTTGGGAACCAGTTTACTATAGTCCCTGTAAAAGGG
                                          tatgaattt  TA-rich tract