1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' |
gtgggtaaaatttagtcatctcatattgatgaactgctggaatttcaagtattttgccttatttgaaaaagactaatagtatgattccacctctgttgcagGTTTTCGTTATGTGGCTGGACTTTGTTACTTACTTGCATCACCATGGCTATGAGCAAAAACTTCCATGGTATCGGGGCAAG
species | Vitis vinifera |
transcript | Vv06s0004g06730.t01 |
intron # | 6 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TTGTAGTGGGTCTTCCCCAAGTGCTTAAGCTCTATGGGGTCCCATATCTG GTTTTCGTTATGTGGCTGGACTTTGTTACTTACTTGCATCACCATGGCEST: gi|110379212|gb|EC944392.1|EC944392
genomic: TTGTAGTGGGTCTTCCCCAAGTGCTTAAGCTCTATGGGGTCCCATATCTGgtgggtaaaa ... tctgttgcagGTTTTCGTTATGTGGCTGGACTTTGTTACTTACTTGCATCACCATGGC
EST: TTGTAGTGGGTCTTCCCCAAGTGCTTAAGCTCTATGGGGTCCCATATCTG GTTTTCGTTATGTGGCTGGACTTTGTTACTTACTTGCATCACCATGGCTATEST: gi|110377424|gb|EC942487.1|EC942487
genomic: TTGTAGTGGGTCTTCCCCAAGTGCTTAAGCTCTATGGGGTCCCATATCTGgtgggtaaaa ... tctgttgcagGTTTTCGTTATGTGGCTGGACTTTGTTACTTACTTGCATCACCATGGCTAT
EST: TTGTAGTGGGTCTTCCCCAAGTGCTTAAGCTCTATGGGGTCCCATATCTG GTTTTCGTTATGTGGCTGGACTTTGTTACTTACTTGCATCACCATGGCTAT
genomic: TTGTAGTGGGTCTTCCCCAAGTGCTTAAGCTCTATGGGGTCCCATATCTGgtgggtaaaa ... tctgttgcagGTTTTCGTTATGTGGCTGGACTTTGTTACTTACTTGCATCACCATGGCTAT
aagtattttgccttatttgaaaaagactaatagtatgattccacctctgttgcagGTTTTCGTTATGTGGCTGGACTTTGTTACTTACTTGCATCACCATGGCTATGAGCAAAAACTTCCATGGTATCGGGGCAAG
gactaat putative branch site (score: 2)
ttccacctct putative PPT
ttatttgaaaaaga TA-rich tract