Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtaagtttctaattcactttctttaattgggtatcaaaagtagaatacatatgaactaatttcgaaggattatgtgtgacttgacaacatatgtatatatagGAGGAAGACTACCAGTGACATGGTATGAAGCTGATTATGTTGATATGCTGCCGATGTCCTCCATGTCACTAAGGCCAGTTGATGAACTAGGCTACCCAGG

Basic information

species Vitis vinifera
transcript Vv05s0020g00520.t01
intron # 6
splice site 3'
intron type U2


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

catatgaactaatttcgaaggattatgtgtgacttgacaacatatgtatatatagGAGGAAGACTACCAGTGACATGGTATGAAGCTGATTATGTTGATATGCTGCCGATGTCCTCCATGTCACTAAGGCCAGTTGATGAACTAGGCTACCCAGG
                                      aacatatgtatatata  TA-rich tract