1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' |
gtagatcatcataacttttgttgttaaagtgaactctgtcacatttatatcatcctgatgtggtaaggttaacatcgaaatgggattccctttggacagGCAGCTGCCTTGGTGAACTCAGGATTATTGCTTATGGCTGTTATGGGTTTAATGTTTCCAGCGGTGCTTCACTTCACACACACAGAGGTGCACTTTGGGA
species | Vitis vinifera |
transcript | Vv09s0018g01840.t01 |
intron # | 5 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TCTTCACTGGCGGGATAAAAAATCACACAAAAGTTCAGGAGTTCAATAAG GCAGCTGCCTTGGTGAACTCAGGATTATTGCTTATGGCTGTTATGGGTTTAEST: gi|161721025|gb|FC069979.1|FC069979
genomic: TCTTCACTGGCGGGATAAAAAATCACACAAAAGTTCAGGAGTTCAATAAGgtagatcatc ... ctttggacagGCAGCTGCCTTGGTGAACTCAGGATTATTGCTTATGGCTGTTATGGGTTTA
EST: TCTTCACTGGCGGGATAAAAAATCACACAAAAGTTCAGGAGTTCAATAAG GCAGCTGCCTTGGTGAACTCAGGATTATTGCTTATGGCTGTTATGGGTTTA
genomic: TCTTCACTGGCGGGATAAAAAATCACACAAAAGTTCAGGAGTTCAATAAGgtagatcatc ... ctttggacagGCAGCTGCCTTGGTGAACTCAGGATTATTGCTTATGGCTGTTATGGGTTTA
ttatatcatcctgatgtggtaaggttaacatcgaaatgggattccctttggacagGCAGCTGCCTTGGTGAACTCAGGATTATTGCTTATGGCTGTTATGGGTTTAATGTTTCCAGCGGTGCTTCACTTCACACACACAGAGGTGCACTTTGGGA
ggttaac putative branch site (score: 3)
ttcccttt putative PPT
ttaacat TA-rich tract