1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' |
gtaagattaatttccatttgcttttagatgaagggttgatactaattcttttttatccatctcaaagccataattacagccagcttcttttgcttactataatactgtgaattgataaccatcatctcaagtgcttatgtgatgatatcagGGTTTGATGTGGGAGAGCTTTCAGATGATGGTCCAGACGATTTGGATGGTTTAGATGCATCAGCAGCACACATTGCAAACTTGTTGTCAACTGAACCTGC
species | Vitis vinifera |
transcript | Vv09s0002g06010.t01 |
intron # | 5 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TGCTCCTACTCGTCCTGTTGCAGTACTCGGTGGATTTCCTTGCACTGCAT GGTTTGATGTGGGAGAGCTTTCAGATGATGGTCCAGACGATTTGGATGGTTEST: gi|110380838|gb|EC946134.1|EC946134
genomic: TGCTCCTACTCGTCCTGTTGCAGTACTCGGTGGATTTCCTTGCACTGCATgtaagattaa ... atgatatcagGGTTTGATGTGGGAGAGCTTTCAGATGATGGTCCAGACGATTTGGATGGTT
EST: TGCTCCTACTCGTCCTGTTGCAGTACTCGGTGGATTTCCTTGCACTGCAT GGTTTGATGTGGGAGAGCTTTCAGATGATGGTCCAGACGATTTGGATGGTT
genomic: TGCTCCTACTCGTCCTGTTGCAGTACTCGGTGGATTTCCTTGCACTGCATgtaagattaa ... atgatatcagGGTTTGATGTGGGAGAGCTTTCAGATGATGGTCCAGACGATTTGGATGGTT
ctataatactgtgaattgataaccatcatctcaagtgcttatgtgatgatatcagGGTTTGATGTGGGAGAGCTTTCAGATGATGGTCCAGACGATTTGGATGGTTTAGATGCATCAGCAGCACACATTGCAAACTTGTTGTCAACTGAACCTGC
tgataac putative branch site (score: 2)
aattgataa TA-rich tract