1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' |
gtaaatgtatatatattgactctcagatgagatgcttgcttgtgctttaatttgtgaattgttgatatatctaatatttgaatccaacgatttccatgttttttctatacacatgcagACGATTTTAAAAATTTCAGGGTTCACAGATAATTTATTAACTCATCTCCTAGCCGGCCTAGGTGCAGGTTTTTTTGCGGTCTGTATTGGTTCTCCCGTTG
species | Vitis vinifera |
transcript | Vv06s0004g05940.t01 |
intron # | 5 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: ATGCTATCATAAATGCTGCTGAGCTAGCCAGTTATGATCAAATAAAACAA ACGATTTTAAAAATTTCAGGGTTCACAGATAAEST: gi|351051586|gb|FQ450138.1|FQ450138
genomic: ATGCTATCATAAATGCTGCTGAGCTAGCCAGTTATGATCAAATAAAACAGgtaaatgtat ... acacatgcagACGATTTTAAAAATTTCAGGGTTCACAGATAA
EST: TGCTATCATAAATGCTGCTGAGCTAGCCAGTTATGATCAAAATAAA-CAG ACGATTTTAAAAATTTCAGGGTTCACAGATAEST: gi|349821879|gb|FQ413050.1|FQ413050
genomic: TGCTATCATAAATGCTGCTGAGCTAGCCAGTTATGATCAAA-TAAAACAGgtaaatgtat ... acacatgcagACGATTTTAAAAATTTCAGGGTTCACAGATA
EST: ATGCTATCATAAATGCTGCTGAGCTAGCCAGTTATGATCAAATAAAACAG ACGATTTTAAAAATTTCEST: gi|351054855|gb|FQ462885.1|FQ462885
genomic: ATGCTATCATAAATGCTGCTGAGCTAGCCAGTTATGATCAAATAAAACAGgtaaatgtat ... acacatgcagACGATTTTAAAAATTTC
EST: ATGCTATCATAAATGCTGCTGAGCTAGCCAGTTATGATCAAATAAAACAG ACGATTTTAAAAATTTCAGGGTTCACAGATAGTTTATTAACTCATCTCCTA
genomic: ATGCTATCATAAATGCTGCTGAGCTAGCCAGTTATGATCAAATAAAACAGgtaaatgtat ... acacatgcagACGATTTTAAAAATTTCAGGGTTCACAGATAATTTATTAACTCATCTCCTA
gatatatctaatatttgaatccaacgatttccatgttttttctatacacatgcagACGATTTTAAAAATTTCAGGGTTCACAGATAATTTATTAACTCATCTCCTAGCCGGCCTAGGTGCAGGTTTTTTTGCGGTCTGTATTGGTTCTCCCGTTG
atctaat putative branch site (score: 3)
atctaatatttgaat TA-rich tract