Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtttgtttgcttgtccttctttttggaaaaaaatttccctgccccaaactctctcagaaaatattttcctcaactatccattgatatgtattatgataatttgtttctgaaagggttaaaaacttctgttcaatgtttttgcagGTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGACCTGACTCTATCAAGACTTTTGGCGAATCTTTAGATACTACCAAAACCA

Basic information

species Vitis vinifera
transcript Vv19s0085g00370.t01
intron # 4
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: Vv19s0085g00370.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 4
lower sequence: LOC_Os06g45710.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 5
gtttgtttgcttgtccttctttttggaaaaaaatttccctgccccaaactctctcagaaaatattttcctcaactatccattgatatgtattatgataatttgtttctgaaagggttaaaaacttctgttcaatgtttttgcagGTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGACCTGACTCTATCAAGACTTTTGGCGAATCTTTAGATACTACCAAAACCA
                       ||| |||    |||      | ||||  | ||||| | || || |  | || || |       || | |    ||   |||       ||   | | ||  |     ||     | |||||  ||| || |||||   ||| || |||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||||||  | ||| |||| ||||||||||| ||  
--------------------gcctggtaaatggattcagcaaac-aaacaatatcagagagtacttgcgactacaattc-------tgcagt----tatcctgt-------agaactgacaatatgaaacca-----tatgcagACTGTTCCAGCATCTGCTATCCCTGATGGTTGGATGGGCCTTGATATTGGCCCAGACTCCATCAAGACTTTCAGTGAAACTTTGGATACTACCAAGACTG
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|110397873|gb|EC963830.1|EC963830
EST:     CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAG                         GTTGTCCCTGCATCCTGTATTC
genomic: CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAGgtttgtttgc ... gtttttgcagGTTGTCCCTGCATCCTGTATTC
EST: gi|349828157|gb|FQ415485.1|FQ415485
EST:     CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAG                         GTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
genomic: CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAGgtttgtttgc ... gtttttgcagGTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
EST: gi|349824307|gb|FQ417718.1|FQ417718
EST:     CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAG                         GTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
genomic: CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAGgtttgtttgc ... gtttttgcagGTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
EST: gi|71883278|gb|DT032333.1|DT032333
EST:     CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAG                         GTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
genomic: CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAGgtttgtttgc ... gtttttgcagGTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
EST: gi|77588624|gb|DV223525.1|DV223525
EST:     CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAG                         GTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
genomic: CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAGgtttgtttgc ... gtttttgcagGTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
EST: gi|30125952|gb|CB911291.1|CB911291
EST:     CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAG                         GTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
genomic: CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAGgtttgtttgc ... gtttttgcagGTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
EST: gi|351053335|gb|FQ459203.1|FQ459203
EST:     CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAG                         GTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
genomic: CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAGgtttgtttgc ... gtttttgcagGTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
EST: gi|71888929|gb|DT037984.1|DT037984
EST:     CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAG                         GTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
genomic: CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAGgtttgtttgc ... gtttttgcagGTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
EST: gi|71881435|gb|DT030490.1|DT030490
EST:     CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAG                         GTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
genomic: CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAGgtttgtttgc ... gtttttgcagGTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
EST: gi|71881347|gb|DT030402.1|DT030402
EST:     CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAG                         GTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
genomic: CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAGgtttgtttgc ... gtttttgcagGTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
EST: gi|71883560|gb|DT032615.1|DT032615
EST:     CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAG                         GTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
genomic: CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAGgtttgtttgc ... gtttttgcagGTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
EST: gi|71881063|gb|DT030118.1|DT030118
EST:     CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAG                         GTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCG
genomic: CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAGgtttgtttgc ... gtttttgcagGTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCG
EST: gi|71885690|gb|DT034745.1|DT034745
EST:     CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAG                         GTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
genomic: CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAGgtttgtttgc ... gtttttgcagGTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
EST: gi|349828158|gb|FQ415486.1|FQ415486
EST:     CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAG                         GTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
genomic: CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAGgtttgtttgc ... gtttttgcagGTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
EST: gi|77578472|gb|DV218021.1|DV218021
EST:     CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAG                         GTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
genomic: CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAGgtttgtttgc ... gtttttgcagGTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
EST: gi|77580822|gb|DV219326.1|DV219326
EST:     CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAG                         GTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
genomic: CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAGgtttgtttgc ... gtttttgcagGTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
EST: gi|30303547|gb|CB980341.1|CB980341
EST:     CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAG                         GTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
genomic: CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAGgtttgtttgc ... gtttttgcagGTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
EST: gi|30132102|gb|CB917441.1|CB917441
EST:     CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAG                         GTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
genomic: CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAGgtttgtttgc ... gtttttgcagGTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
EST: gi|71880236|gb|DT029291.1|DT029291
EST:     CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAG                         GTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
genomic: CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAGgtttgtttgc ... gtttttgcagGTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
EST: gi|71887650|gb|DT036705.1|DT036705
EST:     CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAG                         GTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
genomic: CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAGgtttgtttgc ... gtttttgcagGTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
EST: gi|71877456|gb|DT026511.1|DT026511
EST:     CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAG                         GTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
genomic: CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAGgtttgtttgc ... gtttttgcagGTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
EST: gi|71878631|gb|DT027686.1|DT027686
EST:     CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAG                         GTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
genomic: CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAGgtttgtttgc ... gtttttgcagGTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
EST: gi|110700457|gb|EE078517.1|EE078517
EST:     CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAG                         GTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
genomic: CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAGgtttgtttgc ... gtttttgcagGTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
EST: gi|71890004|gb|DT039059.1|DT039059
EST:     CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAG                         GTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
genomic: CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAGgtttgtttgc ... gtttttgcagGTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
EST: gi|71884116|gb|DT033171.1|DT033171
EST:     CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAG                         GTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
genomic: CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAGgtttgtttgc ... gtttttgcagGTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
EST: gi|71879520|gb|DT028575.1|DT028575
EST:     CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAG                         GTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGGCTGGATATCGG
genomic: CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAGgtttgtttgc ... gtttttgcagGTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGG-CTGGATATCGG
EST: gi|28962808|gb|CB341841.1|CB341841
EST:     CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAG                         GTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGGTGGATGGGGCTGGATATCGGA
genomic: CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAGgtttgtttgc ... gtttttgcagGTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
EST: gi|30305376|gb|CB982170.1|CB982170
EST:     CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAG                         GTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
genomic: CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAGgtttgtttgc ... gtttttgcagGTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
EST: gi|110387417|gb|EC952080.1|EC952080
EST:     CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAG                         GTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATA
genomic: CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAGgtttgtttgc ... gtttttgcagGTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATA
EST: gi|351012744|gb|FQ430307.1|FQ430307
EST:     CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAG                         GTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
genomic: CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAGgtttgtttgc ... gtttttgcagGTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
EST: gi|110731726|gb|EE106391.1|EE106391
EST:     CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAG                         GTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
genomic: CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAGgtttgtttgc ... gtttttgcagGTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
EST: gi|110359104|gb|EC920037.1|EC920037
EST:     CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAG                         GTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCA
genomic: CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAGgtttgtttgc ... gtttttgcagGTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCA
EST: gi|30126615|gb|CB911954.1|CB911954
EST:     CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAG                         GTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
genomic: CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAGgtttgtttgc ... gtttttgcagGTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
EST: gi|30254164|gb|CB971179.1|CB971179
EST:     CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAG                         GTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
genomic: CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAGgtttgtttgc ... gtttttgcagGTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
EST: gi|71888994|gb|DT038049.1|DT038049
EST:     CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAG                         GTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
genomic: CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAGgtttgtttgc ... gtttttgcagGTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
EST: gi|71876777|gb|DT025832.1|DT025832
EST:     CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAG                         GTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
genomic: CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAGgtttgtttgc ... gtttttgcagGTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
EST: gi|22012404|gb|BQ797438.1|BQ797438
EST:     CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAG                         GTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
genomic: CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAGgtttgtttgc ... gtttttgcagGTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
EST: gi|71867965|gb|DT017020.1|DT017020
EST:     CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAG                         GTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
genomic: CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAGgtttgtttgc ... gtttttgcagGTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
EST: gi|71878679|gb|DT027734.1|DT027734
EST:     CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAG                         GTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
genomic: CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAGgtttgtttgc ... gtttttgcagGTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
EST: gi|37187849|gb|CF607202.1|CF607202
EST:     CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAG                         GTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
genomic: CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAGgtttgtttgc ... gtttttgcagGTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
EST: gi|71877959|gb|DT027014.1|DT027014
EST:     CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAG                         GTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
genomic: CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAGgtttgtttgc ... gtttttgcagGTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
EST: gi|351027624|gb|FQ446788.1|FQ446788
EST:     CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAG                         GTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA
genomic: CCGCAGATGTTGTGATTGCTGACAAGTTTGCTGCTGATGCTAACAGCAAGgtttgtttgc ... gtttttgcagGTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGA


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

attatgataatttgtttctgaaagggttaaaaacttctgttcaatgtttttgcagGTTGTCCCTGCATCCTGTATTCCAGATGGTTGGATGGGGCTGGATATCGGACCTGACTCTATCAAGACTTTTGGCGAATCTTTAGATACTACCAAAACCA
                                            tgttttt  CT-rich tract
      ataatttgttt  TA-rich tract