1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' |
gttggttcccattcaaatttattttgaaagtgccttagttatttcttattgatttgtatggtctattgaatctcatatctctctttcttcagGTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTGAGGGGAATGATTTGTACAGAGAAATGATCGAAAGTGGTGTCATTAAGCTTGGCGAGAA
species | Vitis vinifera |
transcript | Vv17s0000g02900.t01 |
intron # | 4 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATG GTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTGAGGGGEST: gi|110732337|gb|EE107534.1|EE107534
genomic: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATGgttggttccc ... ctttcttcagGTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTGAGGGG
EST: GNAAACTGGTCTTATTATGGAACTTATTA-CAATGTTGCTAAAGCTCATG GTGGTTTCTCTGTCTTEST: gi|110724937|gb|EE101202.1|EE101202
genomic: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATGgttggttccc ... ctttcttcagGTGGTTTCTCTGTCTT
EST: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATG GTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTGAGGGGAATGEST: gi|110688264|gb|EE066616.1|EE066616
genomic: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATGgttggttccc ... ctttcttcagGTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTGAGGGGAATG
EST: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATG GTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTGAGGGGAATGEST: gi|161707022|gb|FC055130.1|FC055130
genomic: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATGgttggttccc ... ctttcttcagGTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTGAGGGGAATG
EST: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATG GTGGTTCTCTGTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTGEST: gi|351019677|gb|FQ439494.1|FQ439494
genomic: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATGgttggttccc ... ctttcttcagGTGGTT-TCT--CTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTG
EST: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATG GTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTGAGGGGAATGEST: gi|110688946|gb|EE068082.1|EE068082
genomic: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATGgttggttccc ... ctttcttcagGTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTGAGGGGAATG
EST: GAAA-CTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATG GTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGEST: gi|110389138|gb|EC953954.1|EC953954
genomic: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATGgttggttccc ... ctttcttcagGTGGTTTCTCTGTCTTTGCTG
EST: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATG GTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTGAGGGGAATGEST: gi|110359453|gb|EC920958.1|EC920958
genomic: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATGgttggttccc ... ctttcttcagGTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTGAGGGGAATG
EST: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATG GTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTGAGGGGAATGEST: gi|110702280|gb|EE080812.1|EE080812
genomic: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATGgttggttccc ... ctttcttcagGTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTGAGGGGAATG
EST: AAAAACTGGTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATG GTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTGAGGAGGA-TEST: gi|161721398|gb|FC071064.1|FC071064
genomic: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATGgttggttccc ... ctttcttcagGTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTGAGG-GGAAT
EST: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATG GTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTGAGGGGAATGEST: gi|351027762|gb|FQ446929.1|FQ446929
genomic: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATGgttggttccc ... ctttcttcagGTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTGAGGGGAATG
EST: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATG GTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACCCACTCGTGAGGGGAAATEST: gi|349823703|gb|FQ415113.1|FQ415113
genomic: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATGgttggttccc ... ctttcttcagGTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTGAGGGGAA-T
EST: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATG GTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTGAGGGGAATGEST: gi|351028401|gb|FQ427297.1|FQ427297
genomic: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATGgttggttccc ... ctttcttcagGTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTGAGGGGAATG
EST: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATG GTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTGAGGGGAATGEST: gi|161710369|gb|FC061091.1|FC061091
genomic: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATGgttggttccc ... ctttcttcagGTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTGAGGGGAATG
EST: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATG GTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAAC-CACTCEST: gi|349826477|gb|FQ418568.1|FQ418568
genomic: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATGgttggttccc ... ctttcttcagGTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTC
EST: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATG GTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTGAGGGGGATGEST: gi|352789612|gb|FQ476210.1|FQ476210
genomic: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATGgttggttccc ... ctttcttcagGTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTGAGGGGAATG
EST: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATG GGTGGTTTCTCTGTCCTTTGCEST: gi|349823820|gb|FQ415231.1|FQ415231
genomic: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATGgttggttccc ... ctttcttcagG-TGGTTTCTCTGTC-TTTGC
EST: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAACCTCATG GTGGTTTCTCTGTCTTTGEST: gi|351030186|gb|FQ432124.1|FQ432124
genomic: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATGgttggttccc ... ctttcttcagGTGGTTTCTCTGTCTTTG
EST: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCAGG GTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTGAGGGGAATGEST: gi|161716057|gb|FC065545.1|FC065545
genomic: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATGgttggttccc ... ctttcttcagGTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTGAGGGGAATG
EST: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATG GTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTGAGGGGAATGEST: gi|110356708|gb|EC919733.1|EC919733
genomic: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATGgttggttccc ... ctttcttcagGTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTGAGGGGAATG
EST: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATG GTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTGAGGGGAATGEST: gi|352782351|gb|FQ470254.1|FQ470254
genomic: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATGgttggttccc ... ctttcttcagGTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTGAGGGGAATG
EST: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATG GTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCCTGAGGGGAATGEST: gi|352787189|gb|FQ477809.1|FQ477809
genomic: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATGgttggttccc ... ctttcttcagGTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTGAGGGGAATG
EST: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATG GTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTGAGGGGAATGEST: gi|349826538|gb|FQ418629.1|FQ418629
genomic: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATGgttggttccc ... ctttcttcagGTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTGAGGGGAATG
EST: GAAAACTATTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATG GTGGGTTCTCTGTCTTTGCTGGGTGTGG-AGAACGCACTCGTGAGGGGGATEST: gi|110698394|gb|EE075844.1|EE075844
genomic: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATGgttggttccc ... ctttcttcagGTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGG-TGTGGGAGAACGCACTCGTGAGGGGAAT
EST: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGGTGCTAAAGCTCATG GGGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGGGTGGGAGAACGCACTCGTGGAGGGGA-TEST: gi|351022974|gb|FQ428883.1|FQ428883
genomic: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATGgttggttccc ... ctttcttcagGTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTG-AGGGGAAT
EST: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATG GTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTGAGGGGAATGEST: gi|351040271|gb|FQ425357.1|FQ425357
genomic: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATGgttggttccc ... ctttcttcagGTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTGAGGGGAATG
EST: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATG GTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTGAGGGGAATGEST: gi|352795075|gb|FQ477185.1|FQ477185
genomic: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATGgttggttccc ... ctttcttcagGTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTGAGGGGAATG
EST: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATG GTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTGAGEST: gi|351028760|gb|FQ433190.1|FQ433190
genomic: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATGgttggttccc ... ctttcttcagGTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTGAG
EST: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATG GTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTGAGGEST: gi|71860596|gb|DT009651.1|DT009651
genomic: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATGgttggttccc ... ctttcttcagGTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTGAGG
EST: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATG GTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTGAGGGGAATGEST: gi|349823819|gb|FQ415230.1|FQ415230
genomic: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATGgttggttccc ... ctttcttcagGTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTGAGGGGAATG
EST: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATG GTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTGAGGGGAATG
genomic: GAAAACTGTTCTTATTATGGAACTTATTAACAATGTTGCTAAAGCTCATGgttggttccc ... ctttcttcagGTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTGAGGGGAATG
gttatttcttattgatttgtatggtctattgaatctcatatctctctttcttcagGTGGTTTCTCTGTCTTTGCTGGTGTGGGAGAACGCACTCGTGAGGGGAATGATTTGTACAGAGAAATGATCGAAAGTGGTGTCATTAAGCTTGGCGAGAA
tattgat putative branch site (score: 3)
tctcatatctctcttt putative PPT
ttattgatttgtat TA-rich tract