Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtaatgtgatacaaacttctgatgccagctataagccttctgtctgtattaagaaaataatatcctttattttcatatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTGGATATAGCTCCCAAGGTTCAGGTTCAACACTCATCATGCCTTTCTTGGA

Basic information

species Vitis vinifera
transcript Vv15s0048g00900.t01
intron # 4
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: Vv15s0048g00900.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 4
lower sequence: GLYMA08G39420.2 (Glycine max), 3'ss of exon 2
gtaatgtgatacaaacttctgatgccagctataagccttctgtctgtattaagaaaataatatcctttattttcatatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTGGATATAGCTCCCAAGGTTCAGGTTCAACACTCATCATGCCTTTCTTGGA
||    |  |   | |||   ||||  | |  | ||||  | | ||||||       |  ||     || ||  |  |     ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||||| ||||||||||||||| || ||||| || || ||||| || ||||| ||  | ||
gtgtgctacttttagctttctatgcttgtt-catgcctcat-tttgtatttt-----tgctaattgctacttcaaccttgaatagGAAAGGGATGTGTCTTCACATATGATGCTGTTGGTTCTTATGAGAGGGTTGGATATAGCTCTCAGGGTTCTGGATCCACACTTATTATGCCATTTCTTGA

upper sequence: Vv15s0048g00900.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 4
lower sequence: AT3G60820.1 (Arabidopsis thaliana), 3'ss of exon 4
gtaatgtgatacaaacttctgatgccagctataagccttctgtctgtattaagaaaataatat--cctttattttcatatac-ttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTGGATATAGCTCCCAAGGTTCAGGTTCAACACTCATCATGCCTTTCTTGGA
||||  || | |   ||| |  |  | | ||| |     || |  | |    | |  |  | |   ||||| | |   |||  | ||||||| || |||||||| || ||||| ||||| || || || ||||  ||||||||  |  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||
gtaaaatgctcct--ctttttttctccgttatgatgtgact-ttagaagagggtactttgtgtgatctttagtcttgaatatatccagGAAAAGGGTGTGTCTTTACTTACGACGCTGTTGGCTCATACGAGAGAGTTGGATACGGTGCTCAAGGTTCTGGTTCCACACTCATCATGCCTTTCCTTGA
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|33408415|gb|CF214042.1|CF214042
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|110701338|gb|EE078798.1|EE078798
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|110406409|gb|EC971980.1|EC971980
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|110367163|gb|EC931089.1|EC931089
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|110686517|gb|EE064245.1|EE064245
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|110731955|gb|EE106817.1|EE106817
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|351056417|gb|FQ454278.1|FQ454278
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCCTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|351040709|gb|FQ438253.1|FQ438253
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAAGCGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|161712237|gb|FC061611.1|FC061611
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|351016321|gb|FQ446181.1|FQ446181
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|30133256|gb|CB918595.1|CB918595
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|22008081|gb|BQ793115.1|BQ793115
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|110708375|gb|EE085848.1|EE085848
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|22011829|gb|BQ796863.1|BQ796863
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|110690363|gb|EE067399.1|EE067399
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|71867003|gb|DT016058.1|DT016058
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|110405149|gb|EC970684.1|EC970684
EST:     TGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|110722612|gb|EE098996.1|EE098996
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|110694257|gb|EE071215.1|EE071215
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|110688266|gb|EE066618.1|EE066618
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|110687257|gb|EE064508.1|EE064508
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|110705826|gb|EE083120.1|EE083120
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|30132002|gb|CB917341.1|CB917341
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|77584643|gb|DV221402.1|DV221402
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|161705647|gb|FC056192.1|FC056192
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|29784216|gb|CB344664.2|CB344664
EST:     TTTCTCCCCTTATTATTCTCTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|110701457|gb|EE079053.1|EE079053
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|110695795|gb|EE074220.1|EE074220
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|110379243|gb|EC944426.1|EC944426
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|110420310|gb|EC986580.1|EC986580
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|22011827|gb|BQ796861.1|BQ796861
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|28965578|gb|CB344611.1|CB344611
EST:     TTTCTCCCCTTATTATTCTCTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|110715977|gb|EE090554.1|EE090554
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|110428717|gb|EC995196.1|EC995196
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|110385775|gb|EC950328.1|EC950328
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|110701052|gb|EE078242.1|EE078242
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|110707254|gb|EE083492.1|EE083492
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|110420910|gb|EC987197.1|EC987197
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|110689903|gb|EE066533.1|EE066533
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|34319070|gb|CF371824.1|CF371824
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|110686704|gb|EE064648.1|EE064648
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|30131372|gb|CB916711.1|CB916711
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|30135723|gb|CB921061.1|CB921061
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|110690981|gb|EE068563.1|EE068563
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|351031033|gb|FQ444860.1|FQ444860
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|110701108|gb|EE078347.1|EE078347
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|34415837|gb|CF414591.1|CF414591
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|110700367|gb|EE078323.1|EE078323
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|110688122|gb|EE066314.1|EE066314
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|33408674|gb|CF214301.1|CF214301
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|110401204|gb|EC967806.1|EC967806
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|110398016|gb|EC964077.1|EC964077
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|351018518|gb|FQ424625.1|FQ424625
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|77588152|gb|DV223287.1|DV223287
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
EST: gi|110722795|gb|EE099369.1|EE099369
EST:     TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAG                         GAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG
genomic: TTTCTTCCCTTATTATTCTTTTAACGTTTTAGGTGGCCTTGATAATGAAGgtaatgtgat ... tatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTG


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

ataagccttctgtctgtattaagaaaataatatcctttattttcatatacttcagGAAAGGGTTGTGTCTTCACATACGATGCTGTGGGATCCTATGAGAAGGTTGGATATAGCTCCCAAGGTTCAGGTTCAACACTCATCATGCCTTTCTTGGA
                                tcctttattttcat  CT-rich tract
                tattaagaaaataata  TA-rich tract