1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
...tatcaactcatttatcaaaaattgtttaagctttataattattattgtgttagcttattattctgttaactgccctgaaacattctctttgaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAGCTGCACCACCAGTAGCAGTCCCCCCCCCAGTAGTTGAAGGTGTTCCTCC
species | Vitis vinifera |
transcript | Vv09s0002g00610.t01 |
intron # | 4 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAGEST: gi|110389336|gb|EC954165.1|EC954165
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAGEST: gi|110398915|gb|EC965395.1|EC965395
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAGEST: gi|110686910|gb|EE063860.1|EE063860
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAGEST: gi|110361246|gb|EC924704.1|EC924704
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAGEST: gi|110410432|gb|EC976115.1|EC976115
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAGEST: gi|110421416|gb|EC987712.1|EC987712
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAGEST: gi|33403267|gb|CF208894.1|CF208894
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGNAATTGGGGGGATGCAG CTCCAATGCCAAGTGCEST: gi|110418119|gb|EC984238.1|EC984238
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGC
EST: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAGEST: gi|34319062|gb|CF371816.1|CF371816
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAGEST: gi|110405324|gb|EC970865.1|EC970865
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAGEST: gi|110358619|gb|EC922961.1|EC922961
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAGEST: gi|77584300|gb|DV221222.1|DV221222
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAGEST: gi|351016834|gb|FQ424261.1|FQ424261
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCATTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCCATTGCCACAGATGGATEST: gi|71866748|gb|DT015803.1|DT015803
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGAT
EST: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAGEST: gi|110684621|gb|EE062112.1|EE062112
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAGEST: gi|45771399|gb|CN007251.1|CN007251
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAGEST: gi|349830243|gb|FQ420503.1|FQ420503
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAGEST: gi|110423447|gb|EC989793.1|EC989793
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAGEST: gi|351030264|gb|FQ432202.1|FQ432202
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG CTCCAATGCCAAGTGCAAGTTC-AATTGCAACAEST: gi|30299183|gb|CB975977.1|CB975977
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCA-GTTCCAATTGCAACA
EST: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAGEST: gi|45770192|gb|CN006044.1|CN006044
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAGEST: gi|110388054|gb|EC952769.1|EC952769
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAGEST: gi|110692344|gb|EE071478.1|EE071478
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAGEST: gi|22015361|gb|BQ800395.1|BQ800395
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAGEST: gi|77587539|gb|DV222935.1|DV222935
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAGEST: gi|110359530|gb|EC921169.1|EC921169
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAGEST: gi|29782971|gb|CB348758.2|CB348758
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAGEST: gi|110403126|gb|EC964326.1|EC964326
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAGEST: gi|110373042|gb|EC937249.1|EC937249
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAGEST: gi|351048419|gb|FQ448693.1|FQ448693
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGAEST: gi|110358191|gb|EC922231.1|EC922231
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGA
EST: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAGEST: gi|110702912|gb|EE079300.1|EE079300
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAGEST: gi|110701387|gb|EE078903.1|EE078903
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCATTTCCAGGAAGCAATTGGAGGGATGCAG CTCCAATGTCAAGTGCAGTTCCEST: gi|71876528|gb|DT025583.1|DT025583
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCC
EST: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAGEST: gi|110358702|gb|EC923113.1|EC923113
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAGEST: gi|77578207|gb|DV217883.1|DV217883
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAGEST: gi|28964615|gb|CB343648.1|CB343648
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAGEST: gi|110358822|gb|EC923315.1|EC923315
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAGEST: gi|45770198|gb|CN006050.1|CN006050
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAGEST: gi|110700247|gb|EE078067.1|EE078067
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGAAAGCAATTGGGGGGATGCAG CTCCAATGCCAAGTGCAGTTTCCA-TTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAEST: gi|352776475|gb|FQ474777.1|FQ474777
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTT-CCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCA
EST: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAGEST: gi|110378066|gb|EC943179.1|EC943179
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAGEST: gi|110424414|gb|EC990775.1|EC990775
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAGEST: gi|34415358|gb|CF414112.1|CF414112
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
EST: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAG CTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
genomic: TGCAGTGGCTCCCATTCCTGCAGTTCCAGGAAGCAATTGGGGGGATGCAGgttagattta ... gaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAG
tgtgttagcttattattctgttaactgccctgaaacattctctttgaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAGCTGCACCACCAGTAGCAGTCCCCCCCCCAGTAGTTGAAGGTGTTCCTCC
tgttaac putative branch site (score: 2)
ttctctttg putative PPT
ttattattctgttaa TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| tatcaactcatttatcaaaaattgtttaagctttataattattattgtgttagcttattattctgttaactgccctgaaacattctctttgaatgtgcagCTCCAATGCCAAGTGCAGTTCCAATTGCAACAGATGGATGGGATGCTGCAGCTGCACCACCAGTAGCAGTCCCCCCCCCAGTAGTTGAAGGTGTTCCTCC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TTGAAG
- -caactca
- - - - - - - -caaaaat
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - actgccc