Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

...tttttctatagctctctgactttctattaaacagcttatgaaaattaactaccattatgcaagttttcaccattagatcatgtcttgatattctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG

Basic information

species Vitis vinifera
transcript Vv07s0005g01530.t01
intron # 4
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: Vv07s0005g01530.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 4
lower sequence: LOC_Os03g19510.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 4
---tttttctatagctctctgactttctattaaacagcttatg-aaaattaactaccattatgcaagttttcaccattagatcatgtcttgatattctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
   ||  ||||       ||||  ||| ||   ||    |||  |  |||   |||    || || ||  ||     | ||     |||  | ||||     |||||||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||
gatttcatctaccaggacctga--ttccatggcaccatatattcatgatttcgtacttacattca-gtactcgattcttgacttcctctcaacattcctg-tagGATATCATTATGTATGTGAATTCTCCTGGAGGATCAGTGACAGCTG

upper sequence: Vv07s0005g01530.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 4
lower sequence: GLYMA02G01510.2 (Glycine max), 3'ss of exon 4
tttttctatagctctctgactttctattaaacagcttatgaaaattaactaccattatgcaagt-tttcaccattagatcatgtcttgat-attctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
||||  | |     | | |  || | |  | ||  | |||||    || |    || |||| |   ||   ||       || |  |||| ||  ||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||
ttttgtttttttgtttttatcttttgt--atcatgtgatgaattcaaaattttcttgtgcatgcacttagtcaactaccaattttctgattatgttgggcagGATATTGTCATGTATGTAAATTCTCCAGGAGGGTCAGTTACAGCTG

upper sequence: Vv07s0005g01530.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 4
lower sequence: GLYMA10G01550.1 (Glycine max), 3'ss of exon 4
tttttctatagctctctgactttctattaaacagcttatgaaaattaactaccattatgcaagt-tttcaccattagatcatgtcttgat-attctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
   |  |  |  | | ||  |   |  ||   |  | |||||    || |    || |||| |   ||   ||       || |  |||| ||  ||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||
-aatgttgaaattttttgtatcgtttgtat-tatgtgatgaactcaaaattttcttgtgcatgcacttagtcaactaccaattttctgattatgttgggcagGATATTGTCATGTATGTAAATTCTCCAGGAGGGTCGGTTACAGCTG

upper sequence: Vv07s0005g01530.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 4
lower sequence: GLYMA03G37880.1 (Glycine max), 3'ss of exon 3
tttttctatagctctctgactttctattaaacagcttatgaaaattaactaccattatgcaagttttcaccattagatcatgtcttgatattctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
              | ||| |    ||||  | |  ||||    || |   | ||  ||  |||        |||    |   ||   |||| ||  ||||||||||||||||| || |  ||||| |||||||||||||||||||
--------------tttgatt----attaccctgtgtatgct--ttgaactcaatgttggtagtgcaaggacttaatcaactactaattattttgttcaggatattgtcatgtacgtaagTTCTCCGGGAGGATCAGTTACAGCTG

upper sequence: Vv07s0005g01530.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 4
lower sequence: GLYMA19G40480.1 (Glycine max), 3'ss of exon 3
tttttctatagctctctgactttctattaaacagcttatgaaaa--ttaactaccattatgcaagttttcaccattagatcatgtcttgatattctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
|||   |||  | || || ||   |  ||| |   || || |    || |   | ||| ||  |||    |   |||    |   ||   |||  ||  ||||||||||||||||| || || ||||  |||||||||||| ||||||
tttgattattaccctttgtctgctt--taatctttttgtgtatgctttgaactcaattttggtagtgcaaagacttaatcaactactaattatgttgttcagGATATTGTCATGTACGTAAATTCTCTGGGAGGATCAGTTGCAGCTG

upper sequence: Vv07s0005g01530.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 4
lower sequence: AT1G02560.1 (Arabidopsis thaliana), 3'ss of exon 4
tttttctatagctctctgactttctattaaacagcttatgaaaattaactaccattatgcaagttttcaccattaga----tcatgtcttgatattctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
                | |  |  | || ||       | |    |   |||  | || ||  | ||   | ||||     | || | |   |||  |||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||
---------------gtcagatattgttgaattctaattcatgtcttgttact-tgattcagatgttttgctttaggattctgatatttgcttatgttgaacagGATATTGTCATGTATGTTAATTCTCCTGGTGGATCAGTTACAGCTG

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|71876215|gb|DT025270.1|DT025270
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|351029243|gb|FQ435443.1|FQ435443
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|32272142|gb|CD721301.1|CD721301
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|110707589|gb|EE084158.1|EE084158
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACTGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|351038598|gb|FQ464464.1|FQ464464
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTCTGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|351024186|gb|FQ423609.1|FQ423609
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|351022198|gb|FQ438783.1|FQ438783
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|351048211|gb|FQ442181.1|FQ442181
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|349815979|gb|FQ403620.1|FQ403620
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|352798651|gb|FQ480676.1|FQ480676
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTCTGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|349824782|gb|FQ414640.1|FQ414640
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|351021593|gb|FQ429697.1|FQ429697
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|349814012|gb|FQ414246.1|FQ414246
EST:     ACATCATAGTGGCTCAACTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCATTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|110362036|gb|EC925543.1|EC925543
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|351054329|gb|FQ450412.1|FQ450412
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTCTGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|110691867|gb|EE070457.1|EE070457
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|351024764|gb|FQ430589.1|FQ430589
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|349822594|gb|FQ412858.1|FQ412858
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|30322095|gb|CD005357.1|CD005357
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|351031646|gb|FQ459903.1|FQ459903
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|352794509|gb|FQ481742.1|FQ481742
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|351047968|gb|FQ441140.1|FQ441140
EST:     ACATCATAGTGGCTCATCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|351056306|gb|FQ454167.1|FQ454167
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|34544227|gb|CF512459.1|CF512459
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|30321427|gb|CD004689.1|CD004689
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|37188653|gb|CF608002.1|CF608002
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGG
EST: gi|351047409|gb|FQ451921.1|FQ451921
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|352798669|gb|FQ480694.1|FQ480694
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|351030360|gb|FQ432298.1|FQ432298
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|351021990|gb|FQ437777.1|FQ437777
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|71875459|gb|DT024514.1|DT024514
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|110379552|gb|EC944757.1|EC944757
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|349820976|gb|FQ408684.1|FQ408684
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|32249589|gb|CD715408.1|CD715408
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|349817517|gb|FQ407307.1|FQ407307
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|110697956|gb|EE075414.1|EE075414
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACTGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|349821228|gb|FQ408815.1|FQ408815
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|110712884|gb|EE088319.1|EE088319
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACTGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|351049128|gb|FQ449850.1|FQ449850
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|351027334|gb|FQ444583.1|FQ444583
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|349826886|gb|FQ418977.1|FQ418977
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|110362844|gb|EC926401.1|EC926401
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|351029664|gb|FQ427504.1|FQ427504
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|110709053|gb|EE084177.1|EE084177
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACTGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|349826319|gb|FQ416124.1|FQ416124
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|351016793|gb|FQ424220.1|FQ424220
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|29781945|gb|CB346812.2|CB346812
EST:     TGCTGTTGATCCTGATCGA-                         TCTATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: TGCTGTTGATCCTGA-CAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|351037597|gb|FQ462580.1|FQ462580
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTAATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|349811409|gb|FQ407635.1|FQ407635
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|349826256|gb|FQ416061.1|FQ416061
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|351012618|gb|FQ430181.1|FQ430181
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|71859900|gb|DT008955.1|DT008955
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACGGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|349825647|gb|FQ421746.1|FQ421746
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|349825899|gb|FQ423194.1|FQ423194
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|351023787|gb|FQ448338.1|FQ448338
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|349811516|gb|FQ409512.1|FQ409512
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|349810214|gb|FQ401660.1|FQ401660
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|32267449|gb|CD716412.1|CD716412
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|349826725|gb|FQ418816.1|FQ418816
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|110371862|gb|EC935988.1|EC935988
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|27582740|gb|CB005435.1|CB005435
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|110373638|gb|EC937892.1|EC937892
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|351040704|gb|FQ438248.1|FQ438248
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|351051863|gb|FQ455277.1|FQ455277
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTCTGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|349812565|gb|FQ407184.1|FQ407184
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|349817148|gb|FQ405153.1|FQ405153
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|110725852|gb|EE102787.1|EE102787
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACTGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|349819343|gb|FQ412237.1|FQ412237
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|27586643|gb|CB009338.1|CB009338
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|351025638|gb|FQ426652.1|FQ426652
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|32270269|gb|CD719428.1|CD719428
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|110719511|gb|EE094705.1|EE094705
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACTGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|110379101|gb|EC944275.1|EC944275
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|351032416|gb|FQ461669.1|FQ461669
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|351037939|gb|FQ465177.1|FQ465177
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGGTCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|294965795|gb|GW837278.1|GW837278
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTCACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|110379281|gb|EC944466.1|EC944466
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|29781903|gb|CB346733.2|CB346733
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|110702673|gb|EE078851.1|EE078851
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACTGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|349818345|gb|FQ409120.1|FQ409120
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|161712676|gb|FC062248.1|FC062248
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|349830682|gb|FQ416980.1|FQ416980
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|349812329|gb|FQ406350.1|FQ406350
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|349807180|gb|FQ401172.1|FQ401172
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|34544144|gb|CF512376.1|CF512376
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|110385597|gb|EC950139.1|EC950139
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|28962584|gb|CB341617.1|CB341617
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCCG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|351048277|gb|FQ442247.1|FQ442247
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|349829184|gb|FQ419680.1|FQ419680
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|110720556|gb|EE096582.1|EE096582
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACTGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|352798620|gb|FQ480645.1|FQ480645
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTCTGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|351033794|gb|FQ447832.1|FQ447832
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|351023555|gb|FQ432938.1|FQ432938
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|110361254|gb|EC924714.1|EC924714
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|349828833|gb|FQ419166.1|FQ419166
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
EST: gi|27580053|gb|CB002748.1|CB002748
EST:     ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG                         GATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
genomic: ACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAGgtccgtatgg ... ttctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

taactaccattatgcaagttttcaccattagatcatgtcttgatattctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG
                                       ttgatatt  TA-rich tract
















Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
tttttctatagctctctgactttctattaaacagcttatgaaaattaactaccattatgcaagttttcaccattagatcatgtcttgatattctgaacagGATATTGTCATGTATGTGAACTCTCCAGGAGGATCAGTTACAGCTG

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  GGAGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGGAT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CAGCTG
- - - - -agctctc
- - - - - - - - - - - - - - aaacagc
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -aaattaa
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - ctaccat
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -tatgcaa
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -tcatgtc