1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' |
...ttagtcttatttatgcatcaaaatatatctagatttaaatcttcttcatgtgttataagctagcaatgttctattccttactggaggtttcctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCTATGCTAGTAGGGCCTGATGCTCCTATTGCATTTGAAAGCAAATTGAGGG
species | Vitis vinifera |
transcript | Vv02s0025g04580.t01 |
intron # | 4 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCG GTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCTEST: gi|110698402|gb|EE075860.1|EE075860
genomic: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCGgtatgaacat ... cctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCT
EST: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCG GTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCTEST: gi|110709565|gb|EE085137.1|EE085137
genomic: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCGgtatgaacat ... cctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCT
EST: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCG GTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCTEST: gi|71860473|gb|DT009528.1|DT009528
genomic: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCGgtatgaacat ... cctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCT
EST: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCG GTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCTEST: gi|351015524|gb|FQ447353.1|FQ447353
genomic: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCGgtatgaacat ... cctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCT
EST: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCG GTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCTEST: gi|110390437|gb|EC955346.1|EC955346
genomic: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCGgtatgaacat ... cctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCT
EST: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCG GTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCTEST: gi|110729426|gb|EE105370.1|EE105370
genomic: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCGgtatgaacat ... cctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCT
EST: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCG GTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCTEST: gi|110699371|gb|EE076321.1|EE076321
genomic: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCGgtatgaacat ... cctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCT
EST: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCG GTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCTEST: gi|110691612|gb|EE069914.1|EE069914
genomic: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCGgtatgaacat ... cctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCT
EST: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCG GTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCTEST: gi|294966823|gb|GW837842.1|GW837842
genomic: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCGgtatgaacat ... cctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCT
EST: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCG GTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCTEST: gi|110374042|gb|EC938533.1|EC938533
genomic: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCGgtatgaacat ... cctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCT
EST: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCG GTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCTEST: gi|110718761|gb|EE095962.1|EE095962
genomic: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCGgtatgaacat ... cctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCT
EST: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCG GTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCTEST: gi|33401501|gb|CF207128.1|CF207128
genomic: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCGgtatgaacat ... cctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCT
EST: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCG GTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCTEST: gi|34545276|gb|CF513508.1|CF513508
genomic: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCGgtatgaacat ... cctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCT
EST: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCG GTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCTEST: gi|352777936|gb|FQ466989.1|FQ466989
genomic: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCGgtatgaacat ... cctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCT
EST: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCG GTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCTEST: gi|110699704|gb|EE076934.1|EE076934
genomic: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCGgtatgaacat ... cctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCT
EST: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCG GTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCTEST: gi|30297572|gb|CB974366.1|CB974366
genomic: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCGgtatgaacat ... cctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCT
EST: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCG GTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCTEST: gi|110383242|gb|EC947601.1|EC947601
genomic: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCGgtatgaacat ... cctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCT
EST: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCG GTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCTEST: gi|71862441|gb|DT011496.1|DT011496
genomic: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCGgtatgaacat ... cctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCT
EST: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCG GTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCTEST: gi|71859989|gb|DT009044.1|DT009044
genomic: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCGgtatgaacat ... cctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCT
EST: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCG GTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCTEST: gi|352785913|gb|FQ475916.1|FQ475916
genomic: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCGgtatgaacat ... cctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCT
EST: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCG GTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCTEST: gi|352794809|gb|FQ475304.1|FQ475304
genomic: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCGgtatgaacat ... cctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCT
EST: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCG GTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCTEST: gi|110730120|gb|EE106836.1|EE106836
genomic: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCGgtatgaacat ... cctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCT
EST: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCG GTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCTEST: gi|110357104|gb|EC920414.1|EC920414
genomic: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCGgtatgaacat ... cctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCT
EST: GTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCG GTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCTEST: gi|110698626|gb|EE076340.1|EE076340
genomic: GTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCGgtatgaacat ... cctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCT
EST: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCG GTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCTEST: gi|30255111|gb|CB971558.1|CB971558
genomic: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCGgtatgaacat ... cctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCT
EST: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCG GTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCTEST: gi|71862577|gb|DT011632.1|DT011632
genomic: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCGgtatgaacat ... cctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCT
EST: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCG GTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCTEST: gi|110379517|gb|EC944717.1|EC944717
genomic: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCGgtatgaacat ... cctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCT
EST: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCG GTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCTEST: gi|71860705|gb|DT009760.1|DT009760
genomic: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCGgtatgaacat ... cctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCT
EST: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCG GTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCEST: gi|110698484|gb|EE076038.1|EE076038
genomic: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCGgtatgaacat ... cctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGC
EST: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCG GTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCTEST: gi|110385868|gb|EC950425.1|EC950425
genomic: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCGgtatgaacat ... cctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCT
EST: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCG GTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCTEST: gi|161719369|gb|FC064848.1|FC064848
genomic: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCGgtatgaacat ... cctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCT
EST: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCG GTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCTEST: gi|27580267|gb|CB002962.1|CB002962
genomic: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCGgtatgaacat ... cctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCT
EST: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCG GTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCTEST: gi|110727089|gb|EE103473.1|EE103473
genomic: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCGgtatgaacat ... cctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCT
EST: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCG GTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCTEST: gi|30251422|gb|CB969155.1|CB969155
genomic: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCGgtatgaacat ... cctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCT
EST: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCG GTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCTEST: gi|71864766|gb|DT013821.1|DT013821
genomic: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCGgtatgaacat ... cctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCT
EST: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCG GTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCTEST: gi|71862941|gb|DT011996.1|DT011996
genomic: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCGgtatgaacat ... cctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCT
EST: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCG GTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTAEST: gi|349823636|gb|FQ415046.1|FQ415046
genomic: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCGgtatgaacat ... cctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTA
EST: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCG GTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCTEST: gi|71864669|gb|DT013724.1|DT013724
genomic: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCGgtatgaacat ... cctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCT
EST: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTGGTTGTTTGCACAGACAGGGCG GTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCTEST: gi|71864506|gb|DT013561.1|DT013561
genomic: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCGgtatgaacat ... cctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCT
EST: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCG GTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCTEST: gi|71864508|gb|DT013563.1|DT013563
genomic: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCGgtatgaacat ... cctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCT
EST: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCG GTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCTEST: gi|71857514|gb|DT006569.1|DT006569
genomic: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCGgtatgaacat ... cctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCT
EST: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCG GTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCTEST: gi|30255107|gb|CB971554.1|CB971554
genomic: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCGgtatgaacat ... cctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCT
EST: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCG GTCTATGCAGAAGGACCAACTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCTEST: gi|71864646|gb|DT013701.1|DT013701
genomic: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCGgtatgaacat ... cctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCT
EST: GTAGTTCATGGGATGGGCGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCG GTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCTEST: gi|351020029|gb|FQ439846.1|FQ439846
genomic: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCGgtatgaacat ... cctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCT
EST: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCG GTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCT
genomic: GTAGTTCATGGGATGGACGCTATGGACTTGTTGTTTGCACAGACAGTGCGgtatgaacat ... cctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCT
tcatgtgttataagctagcaatgttctattccttactggaggtttcctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCTATGCTAGTAGGGCCTGATGCTCCTATTGCATTTGAAAGCAAATTGAGGG
tccttac putative branch site (score: 2)
tttcctttatc putative PPT
tgttataa TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| ttagtcttatttatgcatcaaaatatatctagatttaaatcttcttcatgtgttataagctagcaatgttctattccttactggaggtttcctttatcagGTTTATGCAGAAGGACCAGCTAGGCCTACTGGAGGAGCAGCTGCTATTGCTATGCTAGTAGGGCCTGATGCTCCTATTGCATTTGAAAGCAAATTGAGGG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGCAA
- - - - - -tatgcat
- - - - - - - - - caaaata
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - catgtgt
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - gctagca