Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtttgcttgccttttaatgaattcaatggttatgtaagtttgaatttaacttaccactaatggcctatttatggtgcagAATATTGATAAGATACCGCTGGTCAAGTGTCCTGTTTTGGTAATTCAT

Basic information

species Vitis vinifera
transcript Vv14s0083g00800.t01
intron # 3
splice site 3'
intron type U2


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

aatggttatgtaagtttgaatttaacttaccactaatggcctatttatggtgcagAATATTGATAAGATACCGCTGGTCAAGTGTCCTGTTTTGGTAATTCAT
                              cactaat  putative branch site (score: 2)
                                       cctattt  putative PPT
          taagtttgaatttaa  TA-rich tract