1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' |
gtaagtgtttggtgtttatcctattatcattattatcattagaattaatggttttccttcaagtttgccctttggggttggctttcagtttcatctaacaacatgtgtagGCAGTCATGGCCTTTTGCAACAGGGGAATCCTGAATATGATGTCAAGAGGCGGGAACTATATGACTATTATCATCCATTAGAAATCTCCCCAAGTATTCC
species | Vitis vinifera |
transcript | Vv13s0073g00650.t01 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TTTTGATGCCACACTAACAAAGTACTGGGTCAATGGCTGTCGAGGGCAAA GCAGTCATGGCCTTTTGCAACAGGGGAATCCTGAATATGATGTCAAGAGGCEST: gi|71862430|gb|DT011485.1|DT011485
genomic: TTTTGATGCCACACTAACAAAGTACTGGGTCAATGGCTGTCGAGGGCAAAgtaagtgttt ... acatgtgtagGCAGTCATGGCCTTTTGCAACAGGGGAATCCTGAATATGATGTCAAGAGGC
EST: TTTTGATGCCACACTAACAAAGTACTGGGTCAATGGCTGTCGAGGGCAAA GCAGTCATGGCCTTTTGCAACAGGGGAATCCTGAATATGATGTCAAGAGGC
genomic: TTTTGATGCCACACTAACAAAGTACTGGGTCAATGGCTGTCGAGGGCAAAgtaagtgttt ... acatgtgtagGCAGTCATGGCCTTTTGCAACAGGGGAATCCTGAATATGATGTCAAGAGGC
ccttcaagtttgccctttggggttggctttcagtttcatctaacaacatgtgtagGCAGTCATGGCCTTTTGCAACAGGGGAATCCTGAATATGATGTCAAGAGGCGGGAACTATATGACTATTATCATCCATTAGAAATCTCCCCAAGTATTCC
atctaac putative branch site (score: 2)