Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtatgtcatttacaatgttctttcaataaattagcttgttgcgtgtgaaggagtgttgattataattatgaatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATTGAGACAG

Basic information

species Vitis vinifera
transcript Vv11s0052g00290.t01
intron # 3
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: Vv11s0052g00290.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 3
lower sequence: LOC_Os04g51630.3 (Oryza sativa), 3'ss of exon 2
-----------------gtatgtcatttacaatgtt-ctttcaataaatta---gcttgttgcgtgtgaaggagtgttgattataattatgaatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATTGAGACAG
                  | | |  || | |||||  ||  | ||| || |    || ||||  |||  | |    |   ||| || | ||     | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||| |||
gtaaggaaccacttaagttgtattgtt-ataatgtcactgactatagatgatgatctggttgtatgttgatgctaat--gttacaaatctgttgactgtagTATCAATGCCATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTCTTGCGTTTGAGGCAG

upper sequence: Vv11s0052g00290.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 3
lower sequence: LOC_Os08g13690.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 3
gtatgtcatttacaatgttctttcaataaattagcttgttgcgtgtgaaggagtgttgattata-attatgaatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATTGAGACAG
||  |  | | | |  | |    |   |||||  |||     || || |  ||  ||||   |    ||||  |  | ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||
gtgagaaact-ataccgctacggcttaaaattgtctt----tgtttgcataagcattgacagttcgctatgctttatgtagTATCAATGCCATGCACCCCAAGACCAGGAAGATCTTGCAGCTTCTGCGGTTGAGGCAG

upper sequence: Vv11s0052g00290.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 3
lower sequence: GRMZM2G344279_T02 (Zea mays), 3'ss of exon 4
--gtatgtcatttaca-atgttctttcaataaattagcttgttgcgtgtgaaggag-tgttgattataattatgaatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATTGAGACAG
  |  | |||  | || |||    |   ||| |   | |   |  ||  |     | ||||    ||   | |  |   | ||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||
gtgagtctcaggttcatatgccagtattatacagaggatgaatttgtaggcttatgctgttttccatttctgttgaaactatagTATTAATGCCATGCACCCTAAGACCAGGAAGATCTTGCAGCTTCTGCGATTGAGGCAG

upper sequence: Vv11s0052g00290.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 3
lower sequence: GRMZM2G344279_T01 (Zea mays), 3'ss of exon 3
--gtatgtcatttaca-atgttctttcaataaattagcttgttgcgtgtgaaggag-tgttgattataattatgaatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATTGAGACAG--------------
  |  | |||  | || |||    |   ||| |   | |   |  ||  |     | ||||    ||   | |  |   | ||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||              
gtgagtctcaggttcatatgccagtattatacagaggatgaatttgtaggcttatgctgttttccatttctgttgaaactatagTATTAATGCCATGCACCCTAAGACCAGGAAGATCTTGCAGCTTCTGCGATTGAGGCAGATGTGTTCACTAAT

upper sequence: Vv11s0052g00290.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 3
lower sequence: GRMZM2G094051_T06 (Zea mays), 3'ss of exon 3
-------gtatgt-catttacaatgttctttcaataaattagcttgt-tgcgtgtgaaggagtgttgattataattatgaatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATTGAGACAG
         | || ||| | | |   | || ||    || |  |||| ||| | ||      ||||    ||   | |  |   |  || || || || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||
gtgagtctcaggttcatatgccagtattttacagaggatgaatttgtatgcttatgc-----tgttttccatttctgttgaaactacagTATTAACGCCATGCACCCTAAGACCAGGAAGATCTTGCAGCTTCTGCGATTGAGGCAG

upper sequence: Vv11s0052g00290.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 3
lower sequence: GRMZM5G868433_T02 (Zea mays), 3'ss of exon 3
gtatgtcatttacaatgttctttcaataaattagcttgttgcgtgtgaaggagtgttgattataattatg--aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATTGAGACAG
||  |||        |  |      || |  |||     |  || |||    |  ||| || |||||  |   |   |  || |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||
gtgagtcgcaagtgcttatgccagtattatgtagaggaatttgtatgattatgc-ttgtttttaattccgttgaaactacagTATCAATGCCATGCATCCTAAGACCAGGAAGATATTGCAGCTTCTGCGTTTGAGGCAG

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|71868080|gb|DT017135.1|DT017135
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|351043525|gb|FQ430999.1|FQ430999
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|71881526|gb|DT030581.1|DT030581
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCT
EST: gi|110722112|gb|EE098055.1|EE098055
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|349812134|gb|FQ410931.1|FQ410931
EST:     TCCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|351012206|gb|FQ426928.1|FQ426928
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCTAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|351013753|gb|FQ433905.1|FQ433905
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|34542829|gb|CF511061.1|CF511061
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|110725716|gb|EE102533.1|EE102533
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|110689658|gb|EE066085.1|EE066085
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|110685837|gb|EE062904.1|EE062904
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|34548592|gb|CF516824.1|CF516824
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|351014510|gb|FQ437512.1|FQ437512
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCGGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|77580651|gb|DV219229.1|DV219229
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|110722869|gb|EE099531.1|EE099531
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|26266801|gb|CA817864.1|CA817864
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTCCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|37188941|gb|CF608290.1|CF608290
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|87584219|gb|DY473459.1|DY473459
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|161712382|gb|FC061687.1|FC061687
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|33407532|gb|CF213159.1|CF213159
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|30127744|gb|CB913083.1|CB913083
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|30304879|gb|CB981673.1|CB981673
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|29785690|gb|CB342958.2|CB342958
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|34320197|gb|CF372951.1|CF372951
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCCCCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|351032161|gb|FQ460418.1|FQ460418
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|71875336|gb|DT024391.1|DT024391
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|34542742|gb|CF510974.1|CF510974
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|110389408|gb|EC954242.1|EC954242
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|161720606|gb|FC070216.1|FC070216
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|33407447|gb|CF213074.1|CF213074
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|110700111|gb|EE077779.1|EE077779
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|351019405|gb|FQ429540.1|FQ429540
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|351015300|gb|FQ445584.1|FQ445584
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|351024712|gb|FQ433127.1|FQ433127
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|351044035|gb|FQ431466.1|FQ431466
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCGGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|351030503|gb|FQ436929.1|FQ436929
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|34548001|gb|CF516233.1|CF516233
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|351015964|gb|FQ431919.1|FQ431919
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|71888187|gb|DT037242.1|DT037242
EST:     TAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTTGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|110699001|gb|EE077139.1|EE077139
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|110702119|gb|EE080467.1|EE080467
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|110709244|gb|EE084536.1|EE084536
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|161719021|gb|FC067641.1|FC067641
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|30304952|gb|CB981746.1|CB981746
EST:     TTTTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTCGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|30304884|gb|CB981678.1|CB981678
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTCGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|351016367|gb|FQ446227.1|FQ446227
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|110397494|gb|EC963234.1|EC963234
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|26264883|gb|CA815946.1|CA815946
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTCCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|34548504|gb|CF516736.1|CF516736
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|351029873|gb|FQ427713.1|FQ427713
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|351037576|gb|FQ462559.1|FQ462559
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|351021842|gb|FQ437227.1|FQ437227
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGGTT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|77582255|gb|DV220090.1|DV220090
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|26265679|gb|CA816742.1|CA816742
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|87584426|gb|DY473609.1|DY473609
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|351029733|gb|FQ427573.1|FQ427573
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|110700689|gb|EE077563.1|EE077563
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|29784736|gb|CB345836.2|CB345836
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|349826288|gb|FQ416093.1|FQ416093
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|351042582|gb|FQ431180.1|FQ431180
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|71884048|gb|DT033103.1|DT033103
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|33407017|gb|CF212644.1|CF212644
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|110429780|gb|EC996285.1|EC996285
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|110703700|gb|EE080774.1|EE080774
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|161720911|gb|FC070321.1|FC070321
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|110703784|gb|EE080935.1|EE080935
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|351028634|gb|FQ446307.1|FQ446307
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|34320356|gb|CF373110.1|CF373110
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCTCCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|351029952|gb|FQ430694.1|FQ430694
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|26263687|gb|CA814750.1|CA814750
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|33405893|gb|CF211520.1|CF211520
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|351030952|gb|FQ438988.1|FQ438988
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|349824683|gb|FQ413350.1|FQ413350
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|351014750|gb|FQ437950.1|FQ437950
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|110386718|gb|EC951335.1|EC951335
EST:     TAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|27584547|gb|CB007242.1|CB007242
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|294966341|gb|GW837592.1|GW837592
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|351032451|gb|FQ458816.1|FQ458816
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|110379121|gb|EC944297.1|EC944297
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|110420223|gb|EC986488.1|EC986488
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|71879320|gb|DT028375.1|DT028375
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
EST: gi|351048122|gb|FQ442092.1|FQ442092
EST:     TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGG                         GATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT
genomic: TTCTATGTTAGCCCAGAAGCCAAGTTGCTGTTCATTATCAGAATTCGTGGgtatgtcatt ... aatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATT


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

ataaattagcttgttgcgtgtgaaggagtgttgattataattatgaatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATTGAGACAG
                            tgttgat  putative branch site (score: 4)
                                               tctttt  putative PPT
                              ttgattataattatga  TA-rich tract
















Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
gtatgtcatttacaatgttctttcaataaattagcttgttgcgtgtgaaggagtgttgattataattatgaatcttttagGATCAATGCTATGCACCCGAAGACCAGGAAGATTTTGCAGCTTCTACGATTGAGACAG

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  CGAAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCAGCT