1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' |
gtaacttaatattaaatatttttaaaaaaaattatatctgtctttttattttcataatttttgtgttcatgtaaactactaatcatgcttgttttgtttttggttgaatgatagATATGGTCATTTGACATGGGAATGGAAGAAGGGAATTCGTAGCTACTTGCATCCGATGGTGTTTGCCTCCCTTTATAAAGTTCTTGCTTTATGTCATCTT
species | Vitis vinifera |
transcript | Vv11s0037g01100.t01 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CCAGATGAACATTGGCAAGCCTTAGAAGTTGCACATAGCATTGCATTTGG ATATGGTCATTTGACATGGGAATGGAAGAAGGGAATTCGTAGCTACTTGCA
genomic: CCAGATGAACATTGGCAAGCCTTAGAAGTTGCACATAGCATTGCATTTGGgtaacttaat ... tgaatgatagATATGGTCATTTGACATGGGAATGGAAGAAGGGAATTCGTAGCTACTTGCA
tttgtgttcatgtaaactactaatcatgcttgttttgtttttggttgaatgatagATATGGTCATTTGACATGGGAATGGAAGAAGGGAATTCGTAGCTACTTGCATCCGATGGTGTTTGCCTCCCTTTATAAAGTTCTTGCTTTATGTCATCTT
tactaat putative branch site (score: 1)
ttttgttttt TA-rich tract