Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtaaggggctggttaagtttatcttttgctacgcttactaaagtgttggcacacacttatgcgttaatgcatccaatttgtctctgatttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG

Basic information

species Vitis vinifera
transcript Vv07s0005g01530.t01
intron # 3
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: Vv07s0005g01530.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 3
lower sequence: GRMZM2G056373_T02 (Zea mays), 3'ss of exon 1
gtaaggggctggttaagtttat-cttttgctacgcttactaa--agtgttggcacacacttatgcgttaatgcatccaatttgtctctgatttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG
||| |  |    |  | ||| | |   ||    || | || |  ||  | ||   ||     ||  ||      |     |     |     ||||| ||||| || ||||| || |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || ||| |||||||    |||
gtacgatggcactatattttgtacaagtgtgtggcctcctgactaggatgggtttactggattgtattgtgaggtttgtgtgactacatccctctctgcagAGGATTATCCGGTGCGGTGGTCCTGTTGAGGATGATATGGCCAACATCATTGTAGCACAGCTGCTCTACCTGGACGCTATTGATCCCACTAAG

upper sequence: Vv07s0005g01530.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 3
lower sequence: GLYMA02G01510.2 (Glycine max), 3'ss of exon 3
gtaaggggctggttaagtttatcttttgctacgcttactaaagtgttggca--cacacttatgcgttaatgcatcca--atttgtctctgatttc--tcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG
       |  ||  |  |||  || |||||    ||||| || |||||         ||| ||  |||||   || |  |||  |     ||||   | || |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||| |||||
-------gtaggcaatattttcctcttgctg---ttacttaa-tgttgattattctgcttctgt-ttaatctttctagtattaataatgcattttggtatttagAGAATAATTCGGTGTGGTGGAGCAGTTGATGACGATATGGCAAACATCATAGTTGCTCAGCTCCTGTACCTTGATGCTGTTGATCCTAACAAG

upper sequence: Vv07s0005g01530.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 3
lower sequence: GLYMA10G01550.1 (Glycine max), 3'ss of exon 3
gtaaggggctggttaagtttatcttttgctac-gcttactaaagtgttggcacacacttatg-cgttaatgcatccaatttgtctctgatttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG
|||||    |  |||   || |   ||  |   |  || |    | |||    |   || ||   |||||      ||| | | |  |||||      |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || || || || |||||||||||| |||||
gtaagcaattttttacacttgttacttaatgttgaatattctgcttttgtttaatgtttctggtattaat------aatgtattttggattt------agAGGATAATCCGTTGTGGTGGAGCAGTTGATGACGATATGGCAAACATCATAGTTGCTCAGCTCCTGTACCTCGACGCTGTTGATCCTAACAAG

upper sequence: Vv07s0005g01530.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 3
lower sequence: GLYMA19G40480.1 (Glycine max), 3'ss of exon 2
gtaaggggctggttaagtttatcttttgctacgcttactaaagtgttggcacac-acttatgcgttaatgcatccaatttgtctctgatttc-tcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG
             || |    | || |||         |  |||| | ||   |   |||  |  |  | || | | |     | || |||  | || |||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| || |||||||| || ||||||||  | |||||| |||||
------------gtaggccctttttctgccctaa--ggttgagtgctcgccttctgtttagtctgtctttcaactactaacaatatgttttgatatttagAGAATAGTACGTTGTGGGGGAGCTGTAGATGATGATATGTCTAACATCATAGTTGCCCAGCTTCTTTACCTTGATGCCATCGATCCTAACAAG

upper sequence: Vv07s0005g01530.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 3
lower sequence: GLYMA03G37880.1 (Glycine max), 3'ss of exon 2
----gtaaggggctggttaagtttat----cttttgctacgcttactaaagt---gttggcacacacttatgcgttaatgcatccaatttgtctctgatttctctt------cagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG
     ||    |||  || | | | |    |||||  | |     |||| ||   ||   |||   ||  |  ||   ||  |   |  |       || | | ||       |||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||| | |||||| |||| || |||||||| || |||||||       |||| |||||
gttattagatagctttttcaatatctaggccttttttttcttcctctaaggttgagtgttcaccttctatttagtctttgtctttcaactactaacaatatgttttggtatttagAGAATAATACGTTGTGGGGGAGCCGTAGATGATGATATGTCTAACATCTTAGTCGCCCAGCTTCTTTACCTTGATG-------TCCTAACAAG

upper sequence: Vv07s0005g01530.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 3
lower sequence: AT1G02560.1 (Arabidopsis thaliana), 3'ss of exon 3
gtaaggggctggttaagttta-tcttttgctacgcttactaaagtgttggcacacacttatgcgttaatgcatccaatttgtctctgatttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG
        ||  | || | || |||||   || | ||  | |  |  | |     |  |  | ||||||| ||    || || | |  |     || |||| || || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||||||||||||||||   |||
---gtaaacttatgaaatctactctttctttaagattgatta--tcatagtttctagcttagtgttaatgaatg-gtttcgtttgttttgatcttttagAGGATTATTCGCTGTGGTGGTGCTGTGGATGACGATATGGCAAACATAATTGTAGCTCAACTCCTGTATCTTGATGCTGTTGATCCTACTAAG

upper sequence: Vv07s0005g01530.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 3
lower sequence: EFJ24258 (Selaginella moellendorffii), 3'ss of exon 2
gtaaggggctggttaagtttatcttttgctacgcttactaaagtgttggcacacacttatgcgttaatgcatcc---aatttgtctctgatt--tctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG
                                                    |   || |   || ||   |     || || ||  || ||  |   ||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||| || || |||||||||||||| |||||||  |||||  | |||
--------------------------------------------------gtaagtttgtcgtttgatctgttttgtaaattttccttgcttgatactttcagCGGATAATTCGATGCGGTGGAGCTGTTGACGATGATATGGCAAATCTCATTGTTGCGCAGCTTCTCTATCTGGATGCTGCGGATCCAAAGAAG

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|71876215|gb|DT025270.1|DT025270
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGACGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|351029243|gb|FQ435443.1|FQ435443
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|32272142|gb|CD721301.1|CD721301
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|110707589|gb|EE084158.1|EE084158
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|351038598|gb|FQ464464.1|FQ464464
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|351024186|gb|FQ423609.1|FQ423609
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|351022198|gb|FQ438783.1|FQ438783
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|351048211|gb|FQ442181.1|FQ442181
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|349815979|gb|FQ403620.1|FQ403620
EST:     CAATGGTGCAGAAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|352798651|gb|FQ480676.1|FQ480676
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|349824782|gb|FQ414640.1|FQ414640
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|351021593|gb|FQ429697.1|FQ429697
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|349814012|gb|FQ414246.1|FQ414246
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCGTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|110362036|gb|EC925543.1|EC925543
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGACGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|351054329|gb|FQ450412.1|FQ450412
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|110691867|gb|EE070457.1|EE070457
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|351024764|gb|FQ430589.1|FQ430589
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|349822594|gb|FQ412858.1|FQ412858
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|30322095|gb|CD005357.1|CD005357
EST:     AATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGTCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGACGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: AATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAG-CTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|351031646|gb|FQ459903.1|FQ459903
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATACGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|352794509|gb|FQ481742.1|FQ481742
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|351047968|gb|FQ441140.1|FQ441140
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|351056306|gb|FQ454167.1|FQ454167
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|34544227|gb|CF512459.1|CF512459
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|30321427|gb|CD004689.1|CD004689
EST:     AATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGACGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: AATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGC-TTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|37188653|gb|CF608002.1|CF608002
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|351047409|gb|FQ451921.1|FQ451921
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|352798669|gb|FQ480694.1|FQ480694
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|351030360|gb|FQ432298.1|FQ432298
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|351021990|gb|FQ437777.1|FQ437777
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|71875459|gb|DT024514.1|DT024514
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|110379552|gb|EC944757.1|EC944757
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|349820976|gb|FQ408684.1|FQ408684
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGCGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|32249589|gb|CD715408.1|CD715408
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|349817517|gb|FQ407307.1|FQ407307
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|110697956|gb|EE075414.1|EE075414
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|349821228|gb|FQ408815.1|FQ408815
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|110712884|gb|EE088319.1|EE088319
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|351049128|gb|FQ449850.1|FQ449850
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|351027334|gb|FQ444583.1|FQ444583
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|349826886|gb|FQ418977.1|FQ418977
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         ACAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|110362844|gb|EC926401.1|EC926401
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGACGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|351029664|gb|FQ427504.1|FQ427504
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|110709053|gb|EE084177.1|EE084177
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|349826319|gb|FQ416124.1|FQ416124
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCCATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|351016793|gb|FQ424220.1|FQ424220
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|351037597|gb|FQ462580.1|FQ462580
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|349811409|gb|FQ407635.1|FQ407635
EST:     CAACGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATGATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|349826256|gb|FQ416061.1|FQ416061
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|351012618|gb|FQ430181.1|FQ430181
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|71859900|gb|DT008955.1|DT008955
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGACGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|349825647|gb|FQ421746.1|FQ421746
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCGGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|349825899|gb|FQ423194.1|FQ423194
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|351023787|gb|FQ448338.1|FQ448338
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|349811516|gb|FQ409512.1|FQ409512
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|349810214|gb|FQ401660.1|FQ401660
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|32267449|gb|CD716412.1|CD716412
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|349826725|gb|FQ418816.1|FQ418816
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|110371862|gb|EC935988.1|EC935988
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|27582740|gb|CB005435.1|CB005435
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|110373638|gb|EC937892.1|EC937892
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGACGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|351040704|gb|FQ438248.1|FQ438248
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|351051863|gb|FQ455277.1|FQ455277
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|349812565|gb|FQ407184.1|FQ407184
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|349817148|gb|FQ405153.1|FQ405153
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|110725852|gb|EE102787.1|EE102787
EST:     CAATGTTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|349819343|gb|FQ412237.1|FQ412237
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|27586643|gb|CB009338.1|CB009338
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|351025638|gb|FQ426652.1|FQ426652
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|32270269|gb|CD719428.1|CD719428
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|110719511|gb|EE094705.1|EE094705
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|110379101|gb|EC944275.1|EC944275
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|351032416|gb|FQ461669.1|FQ461669
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|351037939|gb|FQ465177.1|FQ465177
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|294965795|gb|GW837278.1|GW837278
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGACGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|110379281|gb|EC944466.1|EC944466
EST:     GCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: GCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|29781903|gb|CB346733.2|CB346733
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|110702673|gb|EE078851.1|EE078851
EST:     CAATGGTGCAAGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|349818345|gb|FQ409120.1|FQ409120
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|161712676|gb|FC062248.1|FC062248
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|349830682|gb|FQ416980.1|FQ416980
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|349812329|gb|FQ406350.1|FQ406350
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|349807180|gb|FQ401172.1|FQ401172
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|34544144|gb|CF512376.1|CF512376
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|110385597|gb|EC950139.1|EC950139
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGACGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|28962584|gb|CB341617.1|CB341617
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGACGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|351048277|gb|FQ442247.1|FQ442247
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|349829184|gb|FQ419680.1|FQ419680
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|110720556|gb|EE096582.1|EE096582
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|352798620|gb|FQ480645.1|FQ480645
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|351033794|gb|FQ447832.1|FQ447832
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|351023555|gb|FQ432938.1|FQ432938
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGCGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|110361254|gb|EC924714.1|EC924714
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGACGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|349828833|gb|FQ419166.1|FQ419166
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA
EST: gi|27580053|gb|CB002748.1|CB002748
EST:     CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACAT                         AGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGACGATGATATGGCAAACATCATA
genomic: CAATGGTGCAGGAGCGTTTTCAGAGTGTCGTCAGTCAGCTTTTTCAACATgtaaggggct ... ttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATA


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

tgttggcacacacttatgcgttaatgcatccaatttgtctctgatttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG
                                      ctctgat  putative branch site (score: 4)
                                     tctctgatttctcttc  CT-rich tract
                               aatttgt  TA-rich tract
















Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
gtaaggggctggttaagtttatcttttgctacgcttactaaagtgttggcacacacttatgcgttaatgcatccaatttgtctctgatttctcttcagAGAATAATCCGATGTGGTGGAGCTGTTGATGATGATATGGCAAACATCATAGTGGCTCAGCTTCTCTATCTTGATGCTGTTGATCCTGACAAG

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TCAGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  ATGCTG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  GCTGTT