Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

...ggtatacattttgtgtctgtatttgaatttcctaagtgtccatatgctttaatttccctcagtcttatgaatactcatttttcctctttggatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAGACAGAGGAGGAGAAGAAGGCAGCAGAAGAGAGGGAGGCATCTGTTAAGG

Basic information

species Vitis vinifera
transcript Vv06s0009g02410.t01
intron # 3
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: Vv06s0009g02410.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 3
lower sequence: LOC_Os07g46750.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 3
---ggtatacattttgtgtctgtatttgaatttcctaagtgtccatatgctttaatttccctcagtcttatgaatactcatttttcctctttggatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAGACAGAGGAGGAGAAGAAGGCAGCAGAAGAGAGGGAGGCATCTGTTAAGG---------
    |||||   ||| | |   | |  | |||   | | |  |    || ||   |||  || | |    |   |    ||  | | | |||||   | |||         |||||  || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||| | |  || ||    ||||         
gggagtataacattttttttactgtaagcattgtttgaattgcttggtgtttcccttttgctgact----tagctttgtataatccatttttggccct-ctacagGA----TGCTGATGAAGATGATGATGACCTGGATCTTTTTGGTGATGAGACCGAGGAAGACAAGAAAGCAGCAGATGAGCGTGCAGCTTCC---AAGGCCTCTTCAA

upper sequence: Vv06s0009g02410.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 3
lower sequence: GRMZM2G439201_T04 (Zea mays), 3'ss of exon 2
ggtatacattttgtgtctgtatttgaatttcctaagtgtcca-tatgctttaatt---tccctcagtcttatgaatactcatttttcctctttggatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAGACAGAGGAGGAGAAGAAGGCAGCAGAAGAGAGGGAGGCATCTGTTAAGG------------
  |  || | || ||||  | | ||| ||   |   || | | |||||||||  |   | | ||  | || |    |||   || | || ||     |    ||||||            | || || |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||| | |  ||  |||  ||||            
--tcaacctatt-tgtcgttgtgtga-ttaattgcatgccaagtatgctttatatcaatgcttcttttttgttgtcactgtcttctgcttttaattctcgacagGCTG------------AGGACGATGATGACCTTGATCTTTTTGGTGATGAAACTGAGGAGGACAAGAAGGCAGCTGATGAGCGTGCCGCCGCTGCCAAGGCCTCTTCTAAAA

upper sequence: Vv06s0009g02410.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 3
lower sequence: GRMZM2G439201_T01 (Zea mays), 3'ss of exon 1
ggtatacattttgtgtctgtatttgaatttcctaagtgtccatatgctttaatttccctcagtcttatgaatactcatttttcctctttggatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAGACAGAGGAGGAGAAGAAGGCAGCAGAAGAGAGGGAGGCATCTGTTAAGG---------------------
                                                                                 ||  ||||  |||  || | | |     ||||  || |||||   |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||| | |  ||  |||  ||||                     
---------------------------------------------------------------------------------tctgcttttaatt--ctcgacag-----gctgaggacgatga---tgaccttgatctttttggtgatgaaactgaggaggacaagaaggcagctgatgagcgtgccgccgCTGCCAAGGCCTCTTCTAAAAAGAAAGAAA

upper sequence: Vv06s0009g02410.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 3
lower sequence: GLYMA14G04350.1 (Glycine max), 3'ss of exon 3
ggtatacattttgtgtc-tgtatttgaatttcctaagtgtccatatgctttaatttccctcagtcttatgaatac--tcattttt-cctctttggatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAGACAGAGGAGGAGAAGAAGGCAGCAGAAGAGAGGGAGGCATCTGTTAAGG
    ||| | |||||   ||||    | | |  |   ||| |  | |||   |  |     | |   |  |||    |||||      | |||| ||||   |||||||  |||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  ||   ||| 
----tacttattgtgaaatgtaagatattattgtggttgtactgaagctgctaagtgaactaattcaactaatttgatcattgggatttgtttgaatttgtcagGCTGCCACTGCTGAAGAAGATGATGATGATCTTGATCTCTTTGGTGATGAGACAGAGGAGGATAAGAAGGCAGCAGAGGAAAGGGAGGCTGCTAAAAAGC

upper sequence: Vv06s0009g02410.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 3
lower sequence: GLYMA02G44460.2 (Glycine max), 3'ss of exon 3
--ggtatacattttgtgtctgtatttgaatttcctaagtgtccatatgctttaatttccctcagtcttatgaat-actcatttttcctctttggatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAGACAGAGGAGGAGAAGAAGGCAGCAGAAGAGAGGGAGGCATCTGTTAAGG
   |  |  ||  | |   || | |  ||  |  ||    | ||  ||   | |     || |||    | | | |   | |||     || ||||||  ||||||||  |||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||  ||   ||| 
tttgacttgatagtatacatgaagtgtaagatattat---tgcagttgtactgaagctgctaagtgaactaattcaactaatttgatcattgggatttgttagGCTGCCACTGCTGAAGAAGATGATGATGATCTTGATCTCTTTGGTGATGAGACAGAGGAAGATAAGAAGGCAGCAGAGGAAAGGGAGGCTGCTAAAAAGC

upper sequence: Vv06s0009g02410.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 3
lower sequence: GLYMA13G04050.1 (Glycine max), 3'ss of exon 3
ggtatacattttgtgtctgtatttgaatttcctaagtgtcca----tatgctttaatttccctcagtctt--atgaatactcatttt----tcctctttggatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAGACAGAGGAGGAGAAGAAGGCAGCAGAAGAGAGGGAGGCATCTGTTAAGG
        |  |||||  ||| ||   || |||| ||| | |    |||    ||||| ||   ||||||  |  | |     | ||    |  | |||| ||||   ||| |||| ||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||  ||   ||| 
-------ttgctgtgttagtactt---ttacctaggtggctaggcttattagctaattacctgaagtcttcaactagtttggttattggggttttatttgaatttgtcagGATGCTTCTGCTGCTGAAGATGATGATGACCTTGATCTCTTTGGCGATGAGACTGAGGAAGACAAAAAGGCAGCAGAGGAAAGGGAGGCTGCTAAGAAGT

upper sequence: Vv06s0009g02410.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 3
lower sequence: AT5G19510.1 (Arabidopsis thaliana), 3'ss of exon 3
ggtatacattttgtgtctg-tatttgaatttcctaagtgtccatatgctttaatttccctcagtct-tatgaatactc-atttttcctctttggatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAGACAGAGGAGGAGAAGAAGGCAGCAGAAGAGAGGGAGGCATCTGTTAAGG
||   ||    | ||| || ||   |||||   |     |   | ||   |  | |   |  || | | ||  ||| | || || | |  |||     |     ||||  |||| |  |||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||| || || || ||||| || ||||| |||||||||||   || |||| 
ggatcacgagctatgtttggtaggggaattgattggagtttggtttggaatgttgtgtgtgtgtgtgtgtgtttacgctatcttgcataattgtcaacagGCACCTGCAGCTGCAGCTGATGATGATGATGACATGGATCTCTTTGGTGACGAGACCGAAGAAGAAAAGAAAGCTGCAGAGGAGAGGGAGGC---TGCTAAGA

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|110733139|gb|EE109067.1|EE109067
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|110688499|gb|EE067123.1|EE067123
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|22014968|gb|BQ800002.1|BQ800002
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|110391715|gb|EC956712.1|EC956712
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|110370729|gb|EC932789.1|EC932789
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|110708007|gb|EE085056.1|EE085056
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|110370946|gb|EC934587.1|EC934587
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|110703547|gb|EE080488.1|EE080488
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|77577569|gb|DV217524.1|DV217524
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|110724589|gb|EE100547.1|EE100547
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|349810721|gb|FQ402964.1|FQ402964
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|110371899|gb|EC936031.1|EC936031
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|22014455|gb|BQ799489.1|BQ799489
EST:     AAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: AAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|30137518|gb|CB922856.1|CB922856
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|110689133|gb|EE065091.1|EE065091
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|110381102|gb|EC946419.1|EC946419
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|110389388|gb|EC954221.1|EC954221
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|110690545|gb|EE067736.1|EE067736
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|110687772|gb|EE065564.1|EE065564
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCT-G-GA-GATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|110377549|gb|EC942622.1|EC942622
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|71874035|gb|DT023090.1|DT023090
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|110691555|gb|EE069793.1|EE069793
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|110390404|gb|EC955311.1|EC955311
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|352790511|gb|FQ478151.1|FQ478151
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCTCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|110361322|gb|EC924788.1|EC924788
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|110694104|gb|EE070916.1|EE070916
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|110697796|gb|EE075187.1|EE075187
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|22014913|gb|BQ799947.1|BQ799947
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|110686577|gb|EE064377.1|EE064377
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|110378542|gb|EC943679.1|EC943679
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|110690480|gb|EE067614.1|EE067614
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|110689894|gb|EE066517.1|EE066517
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|161718733|gb|FC065059.1|FC065059
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGTAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|71867889|gb|DT016944.1|DT016944
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|110690431|gb|EE067523.1|EE067523
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|110698401|gb|EE075859.1|EE075859
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|110707905|gb|EE084834.1|EE084834
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|351031309|gb|FQ445334.1|FQ445334
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCCTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|110419327|gb|EC985545.1|EC985545
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|351036719|gb|FQ457432.1|FQ457432
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|110700089|gb|EE077733.1|EE077733
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|110373587|gb|EC937836.1|EC937836
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|110402109|gb|EC968744.1|EC968744
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|161712089|gb|FC061461.1|FC061461
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|351036543|gb|FQ457256.1|FQ457256
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|110686436|gb|EE064068.1|EE064068
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|161718760|gb|FC068602.1|FC068602
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|110390361|gb|EC955266.1|EC955266
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|110687157|gb|EE064324.1|EE064324
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|161721701|gb|FC070466.1|FC070466
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|110371939|gb|EC936075.1|EC936075
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|351024191|gb|FQ423614.1|FQ423614
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|110722032|gb|EE097905.1|EE097905
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|110411434|gb|EC977147.1|EC977147
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|110388191|gb|EC952915.1|EC952915
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|161713776|gb|FC063776.1|FC063776
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|22014886|gb|BQ799920.1|BQ799920
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|71867540|gb|DT016595.1|DT016595
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|110687043|gb|EE064106.1|EE064106
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|110372033|gb|EC936175.1|EC936175
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|161721107|gb|FC070369.1|FC070369
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|110687120|gb|EE064252.1|EE064252
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|56408248|gb|CX016500.1|CX016500
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
EST: gi|110701576|gb|EE079308.1|EE079308
EST:     TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAG                         GCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG
genomic: TAGGCTGCCAAGCTGCTCCTGTTGAAGCTGCTCCCAAGGAAGTGAAGGAGgtgtgtattg ... gatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAG


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

gctttaatttccctcagtcttatgaatactcatttttcctctttggatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAGACAGAGGAGGAGAAGAAGGCAGCAGAAGAGAGGGAGGCATCTGTTAAGG
 ctttaat  putative branch site (score: 4)
                                tttttcctctttgg  putative PPT
                   ttatgaata  TA-rich tract
















Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
ggtatacattttgtgtctgtatttgaatttcctaagtgtccatatgctttaatttccctcagtcttatgaatactcatttttcctctttggatttactagGCTGCTCCTGCTGGAGATGATGACGATGACCTTGATCTCTTTGGTGATGAGACAGAGGAGGAGAAGAAGGCAGCAGAAGAGAGGGAGGCATCTGTTAAGG

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  AGAGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGGAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  GAGGAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGGAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  GGAGAA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  AAGAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGAGG
- - - - - - -tgtctgt
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - -ccatatg
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -ttccctc