Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtttttcctctaatcttataaaaaatatcagttctaaatatattcatttgaggattattggcataactgatgagctttttgcttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAGCACTACACTAAGGACTTTGGAATTGAGTGTCGCATTGGACGGTTCCATA

Basic information

species Vitis vinifera
transcript Vv05s0020g04510.t01
intron # 3
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: Vv05s0020g04510.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 3
lower sequence: LOC_Os11g37890.2 (Oryza sativa), 3'ss of exon 3
gtttttcctctaatcttataaaaaatatcagttctaa-atatattcatttgaggattattg--gcataactgatgagctttttgcttttg---tttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAGCACTACACTAAGGACTTTGGAATTGAGTGTCGCATTGGACGGTTCCATA
     |     ||  ||   |   ||||  |||||     | ||| || ||   |||||||   || ||| |    | |||  |   ||    ||||||||||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  |||| || || ||||
----gtttctaaactttcccactgatatatgttctgttgcaaattgatatgttaattattgttacaaaacagcactgatttcagtaattaccttttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTGGAAAAACTTGCTACTGAGGAACTGTGCAAGCATTACACAAAGGATTTTGGCATTGAATGTCGGGTTGGCCGCTTTCATA

upper sequence: Vv05s0020g04510.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 3
lower sequence: GRMZM2G138907_T01 (Zea mays), 3'ss of exon 3
----------------gtttttcctctaatcttataaaaaatatcagtt-ctaaatatattcatttgaggattattggcataactgatgagctttttgcttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAGCACTACACTAAGGACTTTGGAATTGAGTGTCGCATTGGACGGTTCCATA
                    || || ||  ||  |   |  | |||  | ||  |  | |   ||        |      |   |  ||| ||  |  ||  | ||||||||||||||||||||||| | || || ||||| ||||||||| | ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || || |
gtttctaataaacttctgcatttctttacgctcgtgttagctgtcacctacttgagctgtgacttgcgatggcaaaatggtttttactgaactgatgcctaatttttagCCTCAAGATGCCTATGGCCTGGAAAAACTCGCGACTGAGGAGCTGTGCAAGCACTATACAAAGGATTTTGGCATCGAGTGCCGGATTGGTCGCTTTCACA

upper sequence: Vv05s0020g04510.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 3
lower sequence: EDP09235 (Chlamydomonas reinhardtii), 3'ss of exon 5
gtttttcctctaatcttataaaaa-atatcagttctaaatatattcatttgaggattattggcataactgatg-----agctttt---tgcttttgttt--agCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAGCACTACACTAAGGACTTTGGAATTGAGTGTCGCATTGGACGGTTCCATA
    | |       | | |       | ||         |   | ||            || ||   |||||      | ||       |  || |     |||| |||||||| || ||| | |||||||| || || |||||| | |||||||||||||  |||||||| || |||||||| ||||| |  || ||||| |
---gtcctctcggccgtgtgtctgcgtgtcgccggctgcttgctgcaccgcgacgccgctgtcactgctgattcttacacctcccaaacgtcttcgcccgcagCCCCAAGATGCGTACGGCCTGGAGAAGCTGGCCACCGAGGAGCTGTGCAAGCACTACAACAAGGACTTCGGCATTGAGTGCCGCATCGCGCGCTTCCACA

upper sequence: Vv05s0020g04510.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 3
lower sequence: PP1S237_14V6.1 (Physcomitrella patens), 3'ss of exon 2
--gtttttcctctaatct-tataaaaaatatcagttctaaatat--attcatttgagga---ttattggcataactgatgagctttttgcttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAGCACTACACTAAGGACTTTGGAATTGAGTGTCGCATTGGACGGTTCCATA
  ||     | |   ||| | |    |  |         || ||  |||  |||    |   || ||||  |      |||    ||   |||     |||| |||||||| || ||  | || ||| | || || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || || || |
cagtcgccacgcagttctctgtggtgaccagtgtccgcgaacatccattgctttacataatttttttggattgggcattgataagttacttttctggcagCCCCAAGATGCTTACGGTCTTGAAAAGTTGGCCACCGAGGAGTTGTGCAAACATTACACGAAGGACTTTGGCATGGAGTGCCGCATTGGTCGCTTTCACA

upper sequence: Vv05s0020g04510.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 3
lower sequence: EFJ10353 (Selaginella moellendorffii), 3'ss of exon 2
gtttttcctctaatcttataaaaaatatcagttctaaatatattcatttgaggattattggcataactgatgagctttttgcttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAGCACTACACTAAGGACTTTGGAATTGAGTGTCGCATTGGACGGTTCCATA
                ||| ||||| |  |   | ||| |  ||| |||     ||   ||   | ||||  |  |||   |||   |  |||| ||||||||||||||  | ||||||||    ||||| ||| | |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |
---------------gtatgaaaaagaaaaaaacaaaaaagcttcttttct---tttgcggggaatctgaaaaaatttgcactt---tgcagCCCCAAGATGCCTATGGACTGGAGAAGCTATGCACTGAAGAGCTGTGCAAGCACTACACCAAGGATTTTGGGATCGAGTGCCGCATTGGACGATTCCACA

upper sequence: Vv05s0020g04510.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 3
lower sequence: EFJ37016 (Selaginella moellendorffii), 3'ss of exon 2
gtttttcctctaatcttataaaaaatatcagttctaaatatattcatttgaggattattggcataactgatgagctttttgcttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAGCACTACACTAAGGACTTTGGAATTGAGTGTCGCATTGGACGGTTCCATA
                        || | |     | | ||  |   ||   |||   ||| |   || |  | || ||   ||   |  |||| ||||||||||||||  | ||||||||    || || ||| | |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |
----------------------gtatgtgaaagaaagaaatcctttctttctgat--ctggaagttctaa--aactcttgttttccttgcagCCCCAAGATGCCTATGGGCTGGAGAAGCTGTGCACGGAAGAGCTGTGCAAGCACTACACCAAGGATTTTGGAATCGAGTGCCGGATTGGGCGCTTCCACA

upper sequence: Vv05s0020g04510.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 3
lower sequence: EFJ34003 (Selaginella moellendorffii), 3'ss of exon 2
gtttttcctctaatcttataaaaaatatcagttctaaatatattcatttgaggattattggcataactgatgagctttttgcttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAGCACTACACTAAGGACTTTGGAATTGAGTGTCGCATTGGACGGTTCCATA
                |||   ||| |  |   ||   | |  | || |||   ||          || |  | || ||   ||   |  |||| ||||||||||||||  | ||||||||    || || ||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| |
---------------gtatgtgaaagaagaaccctttct-ttctgatctgaaagtt----------ctaa--aactcttgttttccttgcagCCCCAAGATGCCTATGGGCTGGAGAAGCTGTGCACCGAAGAGCTGTGCAAGCACTACACCAAGGACTTTGGAATCGAGTGCCGGATTGGGCGCTTCCACA

upper sequence: Vv05s0020g04510.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 3
lower sequence: EFJ33664 (Selaginella moellendorffii), 3'ss of exon 2
gtttttcctctaatcttataaaaaatatcagttctaaatatattcatttgaggattattggcataactgatgagctttttgcttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAGCACTACACTAAGGACTTTGGAATTGAGTGTCGCATTGGACGGTTCCATA
                        || | |     | | ||  |   ||   |||   ||| |   || |  | || ||   ||   |  |||| ||||||||||||||  | ||||||||    || || ||| | |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |
----------------------gtatgtgaaagaaagaaatcctttctttctgat--ctggaagttctaa--aactcttgttttccttgcagCCCCAAGATGCCTATGGGCTGGAGAAGCTGTGCACCGAAGAGCTGTGCAAGCACTACACCAAGGATTTTGGAATCGAGTGCCGGATTGGGCGCTTCCACA

upper sequence: Vv05s0020g04510.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 3
lower sequence: EFJ37510 (Selaginella moellendorffii), 3'ss of exon 2
gtttttcctctaatcttataaaaaatatcagttctaaatatattcatttgaggattattggcataactgatgagctttttgcttttgtt-tagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAGCACTACACTAAGGACTTTGGAATTGAGTGTCGCATTGGACGGTTCCATA
                         |||  |  | ||  |   |   ||   |||   |||   || |  | |   | ||| |||  ||  |||| ||||||||||||||  | ||||||||    || || ||| | |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |
------------------------gtatgtgaacgaagaaccctttctttctgat--ctgg---aagttgtaaaactcttgttttccttgcagCCCCAAGATGCCTATGGGCTGGAGAAGCTGTGCACCGAAGAGCTGTGCAAGCACTACACCAAGGATTTTGGAATCGAGTGCCGGATTGGGCGCTTCCACA

upper sequence: Vv05s0020g04510.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 3
lower sequence: EFJ18599 (Selaginella moellendorffii), 3'ss of exon 2
gtttttcctctaatcttataaaaaatatcagttctaaatatattcatttgaggattattggcataactgatgagctttttgcttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAGCACTACACTAAGGACTTTGGAATTGAGTGTCGCATTGGACGGTTCCATA
                ||| ||||| |  |     ||| | |    ||      || |  |   ||   |  | |   ||||  || |  |||| ||||||||||||||  | ||||||||    ||||| ||| | |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |
---------------gtatgaaaaagaaaaaaaaaaaaaaaaaaggttcttttcttttgtggggaatctaaaaacaaattgcactt-tgcagCCCCAAGATGCCTATGGACTGGAGAAGCTGTGCACTGAAGAGCTGTGCAAGCACTACACCAAGGATTTTGGGATCGAGTGCCGCATTGGACGATTCCACA

upper sequence: Vv05s0020g04510.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 3
lower sequence: EFJ36458 (Selaginella moellendorffii), 3'ss of exon 2
gtttttcctctaatcttataaaaaatatcagttctaaatatattcatttgaggattattggcataactgatgagctttttgcttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAGCACTACACTAAGGACTTTGGAATTGAGTGTCGCATTGGACGGTTCCATA
                ||| ||||  |  |     ||| |  ||| |||     ||   ||   | ||||  |    ||    ||||   |||| ||||||||||||||  | ||||||||    ||||| ||| | |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |
---------------gtatgaaaacgaaaaa----aaaaagcttcttttct---tttgcggggaatctgaaaaaaaattgcactttgc--agCCCCAAGATGCCTATGGACTGGAGAAGCTGTGCACTGAAGAGCTGTGCAAGCACTACACCAAGGATTTTGGGATCGAGTGCCGCATTGGACGATTCCACA

upper sequence: Vv05s0020g04510.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 3
lower sequence: EFJ12864 (Selaginella moellendorffii), 3'ss of exon 2
gtttttcctctaatcttataaaaaatatcagttctaaatatattcatttgaggattattggcataactgatgagctttttgcttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAGCACTACACTAAGGACTTTGGAATTGAGTGTCGCATTGGACGGTTCCATA
                        ||      |   || | |   |      | || |     |   || |   | | ||||| || | |||||||||||||| |||||  |||||||||||   | ||| ||| | |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||| | || || |
----------------------gtatgctgtcttccaagaaaaaaacaacttgtttctcaaactttttgtttttcatgttgctctt-tctagCCTCAAGATGCTTATGGACTAGAGAAGCTCTGCAGTGAAGAGCTGTGCAAGCACTACACCAAGGATTTTGGAATCGAGTGCCGGATTGGAAGATTTCACA

upper sequence: Vv05s0020g04510.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 3
lower sequence: EFJ19598 (Selaginella moellendorffii), 3'ss of exon 2
gtttttcctctaatcttataaaaaatatcagttctaaatatattcatttgaggattattggcataactgatgagctttttgcttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAGCACTACACTAAGGACTTTGGAATTGAGTGTCGCATTGGACGGTTCCATA
                ||| ||||| |  |     ||| | | |  ||      ||  |||   | ||||  |  |||   |||   |  |||| ||||||||||||||  | ||||||||    ||||| ||| | |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |
---------------gtatgaaaaagaaaaaaaaaaaaaaaacttcttctct--tttgtggggaatctgaaaaaatttgcactt---tgcagCCCCAAGATGCCTATGGACTGGAGAAGCTGTGCACTGAAGAGCTGTGCAAGCACTACACCAAGGATTTTGGGATCGAGTGCCGCATTGGACGATTCCACA

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|110690520|gb|EE067689.1|EE067689
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTANAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|351056646|gb|FQ443273.1|FQ443273
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|349823754|gb|FQ415165.1|FQ415165
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|77584261|gb|DV221202.1|DV221202
EST:     TTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: TTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|161715726|gb|FC068393.1|FC068393
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110724254|gb|EE099931.1|EE099931
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110712339|gb|EE089844.1|EE089844
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTANAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110697772|gb|EE075142.1|EE075142
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|351039352|gb|FQ461219.1|FQ461219
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGATGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|71870290|gb|DT019345.1|DT019345
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110713058|gb|EE088647.1|EE088647
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTANAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110710946|gb|EE087579.1|EE087579
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTANAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|351053527|gb|FQ459274.1|FQ459274
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110711807|gb|EE088704.1|EE088704
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTANAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|351023083|gb|FQ430958.1|FQ430958
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110429041|gb|EC995528.1|EC995528
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|37188406|gb|CF607755.1|CF607755
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|30296895|gb|CB973689.1|CB973689
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|161717618|gb|FC066267.1|FC066267
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110710842|gb|EE087363.1|EE087363
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|77587013|gb|DV222647.1|DV222647
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110688673|gb|EE067497.1|EE067497
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110688752|gb|EE067664.1|EE067664
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110709756|gb|EE085496.1|EE085496
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTANAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|161717025|gb|FC068457.1|FC068457
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110727892|gb|EE105171.1|EE105171
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTANAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|77588003|gb|DV223206.1|DV223206
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|161716416|gb|FC068414.1|FC068414
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTTATGCA-
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTT-ATGCAA
EST: gi|110699656|gb|EE076844.1|EE076844
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|77586407|gb|DV222325.1|DV222325
EST:     GCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGGAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: GCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110711660|gb|EE088389.1|EE088389
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110701564|gb|EE079280.1|EE079280
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|351056774|gb|FQ443401.1|FQ443401
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|30136809|gb|CB922147.1|CB922147
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCNAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|349826666|gb|FQ418757.1|FQ418757
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110712020|gb|EE089165.1|EE089165
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTANAGAAGCTCGCAACTGANGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110711140|gb|EE087341.1|EE087341
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110711116|gb|EE087296.1|EE087296
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAAAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110718172|gb|EE094701.1|EE094701
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTANAGAAGCTCGCAACTGANGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|351055373|gb|FQ441971.1|FQ441971
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|30133677|gb|CB919016.1|CB919016
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|71862707|gb|DT011762.1|DT011762
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110708471|gb|EE086048.1|EE086048
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTANAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110692467|gb|EE071745.1|EE071745
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110713774|gb|EE089987.1|EE089987
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110691490|gb|EE069648.1|EE069648
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|352789795|gb|FQ478610.1|FQ478610
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|351035857|gb|FQ463702.1|FQ463702
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110690440|gb|EE067539.1|EE067539
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTANAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110397943|gb|EC963950.1|EC963950
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110689288|gb|EE065379.1|EE065379
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|71867732|gb|DT016787.1|DT016787
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110690011|gb|EE066739.1|EE066739
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTANAGAAGCTCGCAACTGANGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|351046356|gb|FQ452972.1|FQ452972
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110706385|gb|EE081866.1|EE081866
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110730002|gb|EE106582.1|EE106582
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAAAGAAGCTCGCAACTGAAGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110689401|gb|EE065591.1|EE065591
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|22013933|gb|BQ798967.1|BQ798967
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|87586940|gb|DY475007.1|DY475007
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|30134831|gb|CB920169.1|CB920169
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGNCA-CTGAGGAGTTATGCAA
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCG-CAACTGAGGAGTTATGCAA
EST: gi|30251726|gb|CB969459.1|CB969459
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110710487|gb|EE086864.1|EE086864
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110712797|gb|EE088155.1|EE088155
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAANGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGANGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|351030340|gb|FQ432278.1|FQ432278
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110702753|gb|EE079001.1|EE079001
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTANAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110703437|gb|EE080280.1|EE080280
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTANAGAAGCTCGCAACTGANGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110690995|gb|EE068593.1|EE068593
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110711219|gb|EE087490.1|EE087490
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110711728|gb|EE088537.1|EE088537
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCCCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAAGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|30135108|gb|CB920446.1|CB920446
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGNCA-CTGAGGAGTTATGCAA
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCG-CAACTGAGGAGTTATGCAA
EST: gi|110701563|gb|EE079279.1|EE079279
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110700929|gb|EE078013.1|EE078013
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|351048894|gb|FQ449737.1|FQ449737
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110710987|gb|EE087668.1|EE087668
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAAAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
EST: gi|110720679|gb|EE096810.1|EE096810
EST:     AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCCGAG                         CCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG
genomic: AGTTGGAAACTAATGTGAGCTTGAAGGAGTCTGATGCTTGGCCTGCTGAGgtttttcctc ... ttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAG


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

atatattcatttgaggattattggcataactgatgagctttttgcttttgtttagCCTCAAGATGCCTATGGCTTAGAGAAGCTCGCAACTGAGGAGTTATGCAAGCACTACACTAAGGACTTTGGAATTGAGTGTCGCATTGGACGGTTCCATA
                           aactgat  putative branch site (score: 3)
                                     ctttttgcttttgttt  putative PPT
                                             ttttgttta  TA-rich tract