1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
gtattaactctttgttgttttcgcttttttcttttatggcctacttatgttttttctccttacataaattttatgccccttacttttttctgagtactgaccctttggactttttttttttttgtacttagGCTGCTGAAAAGGCCCTTGGAAGTCTAAAGTCTATGCTTGGTCAATTTAGTCAGAAACGTCAGGGTTCCCCACG
species | Vitis vinifera |
transcript | Vv00s0370g00030.t01 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: AGGTCTTAGGGAAGGGAACTGGATCAACATGGGATGATGCTAAAATGCAG GCTGCTGAAAAGGCCCTTGGAAGTCTAAAGTCTATGCTTGGTCAATTTAGTEST: gi|161708801|gb|FC060073.1|FC060073
genomic: AGGTCTTAGGGAAGGGAACTGGATCAACATGGGATGATGCTAAAATGCAGgtattaactc ... ttgtacttagGCTGCTGAAAAGGCCCTTGGAAGTCTAAAGTCTATGCTTGGTCAATTTAGT
EST: AGGTCTTAGGGAAGGGAACTGGATCAACATGGGATGATGCTAAAATGCAG GCTGCTGAAAAGGCCCTTGGAAGTCTAAAGTCTATGCTTGGTCAATTTAGT
genomic: AGGTCTTAGGGAAGGGAACTGGATCAACATGGGATGATGCTAAAATGCAGgtattaactc ... ttgtacttagGCTGCTGAAAAGGCCCTTGGAAGTCTAAAGTCTATGCTTGGTCAATTTAGT
cccttacttttttctgagtactgaccctttggactttttttttttttgtacttagGCTGCTGAAAAGGCCCTTGGAAGTCTAAAGTCTATGCTTGGTCAATTTAGTCAGAAACGTCAGGGTTCCCCACG
tactgac putative branch site (score: 1)
ccctttggactttttt CT-rich tract
actttttttttttttg TA-rich tract