1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
gtacacatactattacagcaacctaggcatctgccattctaatcaaattatggataaaatttaagagtactaattcacaattccttttgggttcagGAGGATAGCCAGGCATGGAAGGGCATGAGGAAGAGCTATGGCGCAGTATGGGACATGGCTAACCCACCGAAGGGTCCTGTAAGCCTGAGGTTCCAAGTGA
species | Vitis vinifera |
transcript | Vv00s0309g00090.t01 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TGTTGTACCAAGCTGGCCTAAGCGACATCACAGCAGTGGACATATGGCAG GAGGATAGCCAGGCATGGAAGGGCATGAGGAAGAGCTATGGCGCAGTATGGEST: gi|161713869|gb|FC062854.1|FC062854
genomic: TGTTGTACCAAGCTGGCCTAAGCGACATCACAGCAGTGGACATATGGCAGgtacacatac ... ttgggttcagGAGGATAGCCAGGCATGGAAGGGCATGAGGAAGAGCTATGGCGCAGTATGG
EST: TGTTGTACCAAGCTGGCCTAAGCGACATCACAGCAGTGGACATATGGCAG GAGGATAGCCAGGCATGGAAGGGCATGAGGAAGAGCTATGGCGCAGTATGG
genomic: TGTTGTACCAAGCTGGCCTAAGCGACATCACAGCAGTGGACATATGGCAGgtacacatac ... ttgggttcagGAGGATAGCCAGGCATGGAAGGGCATGAGGAAGAGCTATGGCGCAGTATGG
atcaaattatggataaaatttaagagtactaattcacaattccttttgggttcagGAGGATAGCCAGGCATGGAAGGGCATGAGGAAGAGCTATGGCGCAGTATGGGACATGGCTAACCCACCGAAGGGTCCTGTAAGCCTGAGGTTCCAAGTGA
tactaat putative branch site (score: 1)
ttcctttt putative PPT
ataaaatttaagagta TA-rich tract