Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

...tttcatattaggatttctgcctttgcctttttacatctattcaattctatttatttcctttaagagtatgtttttgtctgaattgttgttatatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCATCTTTGCTGAAGCTCTTGCCCTGTATGGACTTATTGTTGGCATCATCCTA

Basic information

species Vitis vinifera
transcript Vv18s0001g13630.t01
intron # 2
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: Vv18s0001g13630.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 2
lower sequence: LOC_Os05g01560.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 2
----tttcatattaggatttctgcctttgcctttttacatctattcaattctatttatttcctttaagagtatgtttttgtctgaattgttgttatatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCATCTTTGCTGAAGCTCTTGCCCTGTATGGACTTATTGTTGGCATCATCCTA
    |  || || ||  |||||  || |   ||  ||     | | ||      || ||| |   ||    |  |||   ||||  ||         | ||||| |||||||| |||||||||||| | ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| 
aaaatagcagat-agagtttctttctatctgttactattgtaagtaaagcactcttgtttgcaggaaattgacatttggttctggtttacctcc---tctgcagGGCCAATGCGCAGCAGCCAAAGTTGTTCGTGGGCATGATCCTCATCCTTATCTTTGCAGAAGCTCTTGCTCTGTATGGCCTGATTGTTGGTATCATCCTC

upper sequence: Vv18s0001g13630.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 2
lower sequence: LOC_Os11g06890.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 2
-tttcatatt-aggatttctgcctttgcctttttacatctattcaattct--atttatttcctttaagagtatgtttttg-tctgaattgttgttatatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCATCTTTGCTGAAGCTCTTGCCCTGTATGGACTTATTGTTGGCATCATCCTA
  |   | || | || | |  ||||||  ||   |  |  |  | | ||   |  |   | ||||  || ||   || || | |   ||||||   | || |||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| 
cctcggtgttcatgactac--cctttgtgttgagagcttgaggctactcctaagctgcctactttg-gattacaattctgatatctcttgttg--gtgttggcagGGCAAATGCACAGCAACCAAAGCTTTTCGTGGGCATGATCCTCATCCTCATTTTCGCAGAAGCGCTTGCCCTGTATGGTCTCATTGTGGGCATCATCCTC

upper sequence: Vv18s0001g13630.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 2
lower sequence: LOC_Os02g34510.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 1
-tttcatattaggatttctgcctttgccttt-ttacatctattcaattctatttatttcctttaagagtatgtttttgtctgaattgttgttatatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCATCTTTGCTGAAGCTCTTGCCCTGTATGGACTTATTGTTGGCATCATCCTA
 ||||||   |   | |    |||          |||   |||    | | | |  ||   ||       |||| |    | |  |  | ||    |  ||| || |||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||| || |||||||| |||||| | 
atttcatgacactttgtgcagcttgattggaaccacaggaattttgatttttatgctttgcttggtgcgctgttctaacataatctacttttgctct--cagGGCAAATGCTCAACAGCCAAAACTGTTTGTGGGTATGATCCTCATCCTTATCTTTGCGGAAGCGCTTGCACTCTATGGTCTCATTGTTGGTATCATCTTG

upper sequence: Vv18s0001g13630.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 2
lower sequence: GRMZM2G177005_T01 (Zea mays), 3'ss of exon 2
tttcatattaggatttctgcctttgcctttttacatctattcaattctatttatttcctttaagagtatgtttttgtctgaattgttgttatat------ttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCATCTTTGCTGAAGCTCTTGCCCTGTATGGACTTATTGTTGGCATCATCCTA
      | |||      |||   |  ||  |  | | | |||  ||  |       | |   |    |  |||| || ||| |  || ||          || ||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||| || |||||||| || ||||| 
------agtagctcacatgcaactttctcctggcgtttcttcttttacagaggaggcatgggaattgaaattttagtttgactaatttttgggccaccgatttcagGGCAAATGCGCAACAGCCAAAGCTTTTCGTTGGCATGATCCTCATCCTCATTTTCGCAGAAGCGCTTGCTCTCTATGGTCTAATTGTTGGAATTATCCTT

upper sequence: Vv18s0001g13630.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 2
lower sequence: GRMZM2G028432_T01 (Zea mays), 3'ss of exon 1
tttcatattaggatttctgcctttgcctttttacatctattcaattctatttatttcctttaaga--gtatgtttttgtctgaattgttgttatatt-tgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCATCTTTGCTGAAGCTCTTGCCCTGTATGGACTTATTGTTGGCATCATCCTA
   ||  | |  | || | |   |         |   |  ||||      |   | |||  | |     || |  |  ||   |   ||||| | ||  |||| || || ||||||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || || || || || ||||||||||| 
---cacttaaacacttgtcctacttgggaaaatcggattgtcaaccgggctggctgcctagacggcgacatctcctcatcctgacacttgttcttttgcgcagGGCGAACGCTCAGCAGCCAAAGCTGTTTGTGGGCATGATCCTCATCCTCATCTTCGCTGAAGCGCTCGCCCTATACGGTCTCATCGTCGGCATCATCCTC

upper sequence: Vv18s0001g13630.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 2
lower sequence: GRMZM2G101020_T01 (Zea mays), 3'ss of exon 2
tttcatattaggatttctgcctttgcctttttacatctattcaattctatttatttcctttaagagtatgtttttgtctgaattgttgttatatt-tgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCATCTTTGCTGAAGCTCTTGCCCTGTATGGACTTATTGTTGGCATCATCCTA
 |||| |      |    |        || |   ||| | |  |  || | || |         |  || | |  |||  ||   ||||| | || ||||| || || ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||||| 
-ttcaaagagttgtcctagttcgaaaattatattatcaactggaacctgtctactctagaccgcaacatctctccgtcctaacacttgttcttttgtgcagGGCGAACGCTCAGCAGCCGAAGTTGTTTGTTGGCATGATCCTCATCCTTATTTTTGCTGAAGCACTTGCCCTCTATGGTCTCATCGTCGGCATTATCCTC

upper sequence: Vv18s0001g13630.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 2
lower sequence: AC216067.3_FGT002 (Zea mays), 3'ss of exon 2
tttcatattaggatttctgcctttgcctttttacatctattcaattc-tatttatttcctttaagagtatgtttttgtctgaattgttgttatatt---tgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCATCTTTGCTGAAGCTCTTGCCCTGTATGGACTTATTGTTGGCATCATCCTA
    |   |    | | ||    |  ||| ||  |   |  || | | |  ||||||       ||  || || ||| || | ||  ||    | |   | ||| || ||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| 
---taatctcctttctttgagcgtttcttcttttaaggaggcagtacatgcttatttgggaattgaa-attttattgacttattttctgggccactgatttcagGGCGAATGCACAACAGCCGAAGCTTTTTGTGGGCATGATCCTCATCCTCATTTTCGCAGAAGCGCTTGCTCTGTACGGTCTCATTGTTGGAATTATCCTT

upper sequence: Vv18s0001g13630.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 2
lower sequence: PP1S1_66V6.1 (Physcomitrella patens), 3'ss of exon 2
-----------------------------------------------------------------------------tttcatattaggatttctgcctt--------tgcctttttacatctattcaattctatttatttcctttaagagtatgtttttgtctgaattgttgttata--tttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCATCTTTGCTGAAGCTCTTGCCCTGTATGGACTTATTGTTGGCATCATCCTA
                                                                             |||| ||||    | | |   ||        |||| || | |||| ||   || | |||| | |    | |  |||| | |||| | | ||| | ||||||  | || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||  | || ||||| ||||| || || |||||  ||||||||||||| || ||||||||| | 
gtagtaatcccgtctctacgtttttctgcatttagtatttttctttttttcttcttttttttttctgcttgatatgatttcctattgctttatttattttctgtgaattgccattatgcatc-atgtgatgcaatttttgttacctgat-gtat-tctttgaccggattatggttatacgtctgtagAGCGAATGCCCAGCAGCCCAAGCTCTTCGTTGGTATGATTTTGATCCTCATTTTTGCCGAGGCGCTTGCTTTGTATGGACTTATCGTCGGCATCATCTTG

upper sequence: Vv18s0001g13630.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 2
lower sequence: PP1S45_100V6.1 (Physcomitrella patens), 3'ss of exon 2
------------------------------------------------------------------------------------tttcatattaggatttctgcctttgcctt----ttt----acatctattcaattcta-------tttatttcctttaagagtatgtttttgtctgaattgttgttatatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCATCTTTGCTGAAGCTCTTGCCCTGTATGGACTTATTGTTGGCATCATCCTA
                                                                                     |||  |   || |  | |   | | | |    |||    |     | | | || |        ||  | |  | |    ||   | ||    || |   | |     ||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||| || ||||| || |||||| |||||||||| || || ||||| ||| | 
gtagcggacgaacccttgcaatgtggtgatgtatgggaatacgtagtgaagttggaaagagagatgtaatcgggattgaaatggattcgcagagggttcacggtgatggacatgaggtttgaggatgcagagtgagttatgggagggtttggtgtgttgtggatgtggttgttaacgtggaggatggcatcgtttgcagGGCGAATGCTCAGCAGCCGAAGCTGTTCGTGGGGATGATCCTGATCCTCATTTTCGCTGAGGCGCTTGCCTTGTATGGACTGATCGTCGGCATTATCTTG

upper sequence: Vv18s0001g13630.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 2
lower sequence: PP1S45_97V6.1 (Physcomitrella patens), 3'ss of exon 2
------------------------------------------------------------------------------------tttcatattaggatttctgcctttgcctt----ttt----acatctattcaattcta-------tttatttcctttaagagtatgtttttgtctgaattgttgttatatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCATCTTTGCTGAAGCTCTTGCCCTGTATGGACTTATTGTTGGCATCATCCTA
                                                                                     |||  |   || |  | |   | | | |    |||    |     | | | || |        ||  | |  | |    ||   | ||    || |   | |     ||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||| || ||||| || |||||| |||||||||| || || ||||| ||| | 
gtagcggacgaacccttgcaatgtggtgatgtatgggaatacgtagtgaagttggaaagagagatgtaatcgggattgaaatggattcgcagagggttcacggtgatggacatgaggtttgaggatgcagagtgagttgtgggagggtttggtgtgttgtggatgtggttgttaacgtggaggatggcatcgtttgcagGGCGAATGCTCAGCAGCCGAAGCTGTTCGTGGGGATGATCCTGATCCTCATTTTCGCTGAGGCGCTTGCCTTGTATGGACTGATCGTCGGCATTATCTTG

upper sequence: Vv18s0001g13630.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 2
lower sequence: PP1S2_120V6.1 (Physcomitrella patens), 3'ss of exon 2
-------------------------------------------------------------------------tttcatattaggatttctgcctttgcctttttacatctattcaattctatttatttcctttaagagtatgtttttgtctgaattgttgttatatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCATCTTTGCTGAAGCTCTTGCCCTGTATGGACTTATTGTTGGCATCATCCTA
                                                                         ||      |   | ||| |   |  | |||  |     |   |    |  | | | | |  | | |  | |    |   |  || || || | |  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||| || ||||| ||||||||| | || || || ||||| ||||||||  | 
gtaataattcaagatctgagcacatctataagaaatgtgtaacacataggttgaatggtgaatcttgtctcttttcttcgattcaaattcagagctgacttttggatcataacctaccattggtaaatacatgcacgggggtttgaccggagggtttatttttttgtgcgcagAGCCAATGCCCAGCAGCCGAAGCTTTTCGTGGGAATGATCTTGATTCTCATTTTCGCTGAGGCTCTTGCCTTATACGGGCTGATTGTGGGCATCATTTTG

upper sequence: Vv18s0001g13630.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 2
lower sequence: EFJ14420 (Selaginella moellendorffii), 3'ss of exon 2
tttcatattaggatttctgcctttgcctttttacatctattcaattctatttatttcctttaagagtatgttt-ttgtctgaattgttgttatatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCATCTTTGCTGAAGCTCTTGCCCTGTATGGACTTATTGTTGGCATCATCCTA
                        |    ||   ||| ||  ||  | || | |||| |  |    ||| |   |||  ||  ||||| ||   ||||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | || || || || || ||||| || |||||||| 
------------------------gtaagttcg-atcgatcaaaagccatctttttcttcga----tatctccattgattggtttgtttttc--tttgcagGGCGAATGCGCAGCAACCCAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCATCTTTGCCGAGGCTTTGGCTCTATACGGTCTCATTGTGGGAATCATCCTG

upper sequence: Vv18s0001g13630.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 2
lower sequence: EFJ26016 (Selaginella moellendorffii), 3'ss of exon 2
tttcatattaggatttctgcctttgcctttttacatctattcaattctatttatttcctttaagagtatgttt-ttgtctgaattgttgttatatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCATCTTTGCTGAAGCTCTTGCCCTGTATGGACTTATTGTTGGCATCATCCTA
                        |    ||   ||| ||  ||  | || | |||| |  |    ||| |   |||  ||  ||||| ||   ||||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | || || || || || ||||| || |||||||| 
------------------------gtaagttcg-atcgatcaaaaaccatctttttcttcga----tatctccattgattggtttgtttttc--tttgcagGGCGAATGCGCAGCAACCCAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTGATTCTCATCTTTGCCGAGGCTTTGGCTCTATACGGTCTCATTGTGGGAATCATCCTG

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|110369523|gb|EC933686.1|EC933686
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCGCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|110389501|gb|EC954343.1|EC954343
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCGCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|34320659|gb|CF373413.1|CF373413
EST:     GTCGGTGATCCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCGCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|110415084|gb|EC980958.1|EC980958
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|34363258|gb|CF404843.1|CF404843
EST:     GTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCGCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|110383540|gb|EC947918.1|EC947918
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCGCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|110420550|gb|EC986825.1|EC986825
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|110403249|gb|EC964653.1|EC964653
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCGCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|30135070|gb|CB920408.1|CB920408
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|26261663|gb|CA812726.1|CA812726
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|29783068|gb|CB348963.2|CB348963
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGCGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAACGCGCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|110704405|gb|EE081519.1|EE081519
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|71867976|gb|DT017031.1|DT017031
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCGCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|83274945|gb|DV939041.1|DV939041
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCGCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|77586905|gb|DV222602.1|DV222602
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCGCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|30127536|gb|CB912875.1|CB912875
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|110381300|gb|EC946624.1|EC946624
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|34319316|gb|CF372070.1|CF372070
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCGCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|71872511|gb|DT021566.1|DT021566
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCGCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|77587011|gb|DV222645.1|DV222645
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCGCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|22012673|gb|BQ797707.1|BQ797707
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|110394256|gb|EC958927.1|EC958927
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|56409387|gb|CX017639.1|CX017639
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|83274825|gb|DV938921.1|DV938921
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCGCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|56409668|gb|CX017920.1|CX017920
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|30306067|gb|CB982861.1|CB982861
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|71865504|gb|DT014559.1|DT014559
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|161717775|gb|FC068164.1|FC068164
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCGCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|110393665|gb|EC959069.1|EC959069
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCGCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|55778220|gb|AJ862991.1|AJ862991
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCGCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|110373761|gb|EC938092.1|EC938092
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|77581801|gb|DV219856.1|DV219856
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|30130307|gb|CB915646.1|CB915646
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|77583874|gb|DV220974.1|DV220974
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCGCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|110412012|gb|EC977744.1|EC977744
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|110696258|gb|EE075211.1|EE075211
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGCGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|110379159|gb|EC944336.1|EC944336
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCGCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|110383300|gb|EC947665.1|EC947665
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|22011899|gb|BQ796933.1|BQ796933
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|110400596|gb|EC967162.1|EC967162
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCGCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|110380457|gb|EC945725.1|EC945725
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|71887874|gb|DT036929.1|DT036929
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCGCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|51051663|gb|CO819169.1|CO819169
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCGCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|34416511|gb|CF415265.1|CF415265
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCGCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|71874541|gb|DT023596.1|DT023596
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCGCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|77585328|gb|DV221756.1|DV221756
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCGCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|110394339|gb|EC959137.1|EC959137
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|71884301|gb|DT033356.1|DT033356
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCGCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|110401333|gb|EC967941.1|EC967941
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|29783105|gb|CB349050.2|CB349050
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAACGCGCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|30127489|gb|CB912828.1|CB912828
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|110405082|gb|EC970614.1|EC970614
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|71890776|gb|DT039831.1|DT039831
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCGCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|352781816|gb|FQ469114.1|FQ469114
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|110401131|gb|EC967726.1|EC967726
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|110710661|gb|EE087001.1|EE087001
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|110368803|gb|EC932886.1|EC932886
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|22014921|gb|BQ799955.1|BQ799955
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|22015292|gb|BQ800326.1|BQ800326
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|71865757|gb|DT014812.1|DT014812
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|37190400|gb|CF609749.1|CF609749
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|77587861|gb|DV223130.1|DV223130
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCGCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|110397837|gb|EC963769.1|EC963769
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCGCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|110731004|gb|EE108728.1|EE108728
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|110706781|gb|EE082605.1|EE082605
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|22012831|gb|BQ797865.1|BQ797865
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|110715655|gb|EE093952.1|EE093952
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|110419096|gb|EC985291.1|EC985291
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|110702710|gb|EE078917.1|EE078917
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|110373123|gb|EC937335.1|EC937335
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|71873694|gb|DT022749.1|DT022749
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|351025407|gb|FQ435099.1|FQ435099
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|110703879|gb|EE081211.1|EE081211
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|110390546|gb|EC955463.1|EC955463
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCGCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|71881254|gb|DT030309.1|DT030309
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCGCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|110366744|gb|EC930662.1|EC930662
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|110370305|gb|EC929358.1|EC929358
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
EST: gi|22012552|gb|BQ797586.1|BQ797586
EST:     GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATCGTCGGTGATGCTGGTGTGAG                         AGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTTGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT
genomic: GGCCTTTCTGCTGGAATGGCCATTGGGATAGTCGGTGATGCTGGTGTGAGgtatattgct ... atatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCAT


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

tctatttatttcctttaagagtatgtttttgtctgaattgttgttatatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCATCTTTGCTGAAGCTCTTGCCCTGTATGGACTTATTGTTGGCATCATCCTA
                                   aattgttgttatattt  TA-rich tract
















Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
tttcatattaggatttctgcctttgcctttttacatctattcaattctatttatttcctttaagagtatgtttttgtctgaattgttgttatatttgcagAGCCAATGCTCAGCAGCCAAAGCTTTTCGTTGGAATGATCCTCATTCTCATCTTTGCTGAAGCTCTTGCCCTGTATGGACTTATTGTTGGCATCATCCTA

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CTGAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  TGAAGC
- - - - - - - -tctgcct
- - - - - - - - -tgccttt
- - - - - - - - - - - - - - - - - - ctattca
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - tgtctga