1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
gtacataaaagagaacaacacaagctttgtacaggtctctgatgcttgttattgttttgggtgttttaactctttatgtgtttgcacttgaatttgcagAGGCTGGGCATGCATTGGTCGGTGCACTTATGCCTGAATATGACCCTGTGGCCAAGATATCCATCATTCCCCGTGGCCAAGCAGGTGGTCTTACCTTTTT
species | Vitis vinifera |
transcript | Vv18s0001g00190.t01 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GAAAAATGCTGTGGTCTCAGACGAGAAGAAGAAATTAGTTGCCTATCATG AGGCTGGGCATGCATTGGTCGGTGCACTTATGCCTGAATATGACCCTGTGGEST: gi|110717414|gb|EE093251.1|EE093251
genomic: GAAAAATGCTGTGGTCTCAGACGAGAAGAAGAAATTAGTTGCCTATCATGgtacataaaa ... gaatttgcagAGGCTGGGCATGCATTGGTCGGTGCACTTATGCCTGAATATGACCCTGTGG
EST: GAAAAATGCTGTGGTCTCAGACGAGAAGAAGAAATTAGTTGCCTATCATG AGGCTGGGCATGCATTGGTCGGTGCACTTATGCCTGAATATGACCCTGTGGEST: gi|110383931|gb|EC948337.1|EC948337
genomic: GAAAAATGCTGTGGTCTCAGACGAGAAGAAGAAATTAGTTGCCTATCATGgtacataaaa ... gaatttgcagAGGCTGGGCATGCATTGGTCGGTGCACTTATGCCTGAATATGACCCTGTGG
EST: GAAAAATGCTGTGGTCTCAGACGAGAAGAAGAAATTAGTTGCCTATCATG AGGCTGGGCATGCATTGGTCGGTGCACTTATGCCTGAATATGACCCTGTGGEST: gi|110378764|gb|EC943912.1|EC943912
genomic: GAAAAATGCTGTGGTCTCAGACGAGAAGAAGAAATTAGTTGCCTATCATGgtacataaaa ... gaatttgcagAGGCTGGGCATGCATTGGTCGGTGCACTTATGCCTGAATATGACCCTGTGG
EST: GAAAAATGCTGTGGTCTCAGACGAGAAGAAGAAATTAGTTGCCTATCATG AGGCTGGGCATGCATTGGTTGGTGCACTTATGCCTGAATATGACCCTGTGGEST: gi|26262505|gb|CA813568.1|CA813568
genomic: GAAAAATGCTGTGGTCTCAGACGAGAAGAAGAAATTAGTTGCCTATCATGgtacataaaa ... gaatttgcagAGGCTGGGCATGCATTGGTCGGTGCACTTATGCCTGAATATGACCCTGTGG
EST: GAAAAATGCTGTGGTCTCAGACGAGAAGAAGAAATTAGTTGCCTATCATG TGGCTGGGCATGCATAGGTCGGTGCACTTATGCCTGAATATGACCCTGTGGEST: gi|26262506|gb|CA813569.1|CA813569
genomic: GAAAAATGCTGTGGTCTCAGACGAGAAGAAGAAATTAGTTGCCTATCATGgtacataaaa ... gaatttgcagAGGCTGGGCATGCATTGGTCGGTGCACTTATGCCTGAATATGACCCTGTGG
EST: GAAAAATGCTGTGGTCTCAGACGAGAAGAAGAAATTAGTTGCCTATCATG TGGCTGGGCATGCATNGGTCGGTGCACTTATGCCTGAATATGACCCTGTGGEST: gi|352790761|gb|FQ478309.1|FQ478309
genomic: GAAAAATGCTGTGGTCTCAGACGAGAAGAAGAAATTAGTTGCCTATCATGgtacataaaa ... gaatttgcagAGGCTGGGCATGCATTGGTCGGTGCACTTATGCCTGAATATGACCCTGTGG
EST: GAAAAATGCTGTGGTCTCAGACGAGAAGAAGAAATTAGTTGCCTATCATG AGGCTGGGCATGCATTGGTTGGTGCACTTATGCCTGAATATGACCCTGCGGEST: gi|352794299|gb|FQ481530.1|FQ481530
genomic: GAAAAATGCTGTGGTCTCAGACGAGAAGAAGAAATTAGTTGCCTATCATGgtacataaaa ... gaatttgcagAGGCTGGGCATGCATTGGTCGGTGCACTTATGCCTGAATATGACCCTGTGG
EST: GAAAAATGCTGTGGTCTCAGACGAGAAGAAGAAATTAGTTGCCTATCATG AGGCTGGGCATGCATTGGTTGGTGCACTTATGCCTGAATATGACCCTGTGGEST: gi|37183867|gb|CF603221.1|CF603221
genomic: GAAAAATGCTGTGGTCTCAGACGAGAAGAAGAAATTAGTTGCCTATCATGgtacataaaa ... gaatttgcagAGGCTGGGCATGCATTGGTCGGTGCACTTATGCCTGAATATGACCCTGTGG
EST: GAAAAATGCTGTGGTCTCAGACGAGAAGAAGAAATTAGTTGCCTATCATG AGGCTGGGCATGCATTGGTTGGTGCACTTATGCCTGAATATGACCCTGTGGEST: gi|30320659|gb|CD003921.1|CD003921
genomic: GAAAAATGCTGTGGTCTCAGACGAGAAGAAGAAATTAGTTGCCTATCATGgtacataaaa ... gaatttgcagAGGCTGGGCATGCATTGGTCGGTGCACTTATGCCTGAATATGACCCTGTGG
EST: GAAAAATGCTGTGGTCTCAGACGAGAAGAAGAAATTAGTTGCCTATCATG AGGCTGGGCATGCATTGGTTGGTGCACTTATGCCTGAATATGACCCTGTGGEST: gi|352798544|gb|FQ480569.1|FQ480569
genomic: GAAAAATGCTGTGGTCTCAGACGAGAAGAAGAAATTAGTTGCCTATCATGgtacataaaa ... gaatttgcagAGGCTGGGCATGCATTGGTCGGTGCACTTATGCCTGAATATGACCCTGTGG
EST: GAAAAATGCTGTGGTCTCAGACGAGAAGAAGAAATTAGTTGCCTATCATG AGGCTGGGCATGCATTGGTTGGTGCACTTATGCCTGAATATGACCCTGTGGEST: gi|110377726|gb|EC942808.1|EC942808
genomic: GAAAAATGCTGTGGTCTCAGACGAGAAGAAGAAATTAGTTGCCTATCATGgtacataaaa ... gaatttgcagAGGCTGGGCATGCATTGGTCGGTGCACTTATGCCTGAATATGACCCTGTGG
EST: GAAAAATGCTGTGGTCTCAGACGAGAAGAAGAAATTAGTTGCCTATCATG AGGCTGGGCATGCATTGGTTGGTGCACTTATGCCTGAATATGACCCTGTGG
genomic: GAAAAATGCTGTGGTCTCAGACGAGAAGAAGAAATTAGTTGCCTATCATGgtacataaaa ... gaatttgcagAGGCTGGGCATGCATTGGTCGGTGCACTTATGCCTGAATATGACCCTGTGG
cttgttattgttttgggtgttttaactctttatgtgtttgcacttgaatttgcagAGGCTGGGCATGCATTGGTCGGTGCACTTATGCCTGAATATGACCCTGTGGCCAAGATATCCATCATTCCCCGTGGCCAAGCAGGTGGTCTTACCTTTTT
ttttaac putative branch site (score: 2)
ttttaactctttat TA-rich tract