Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   
2  
 5'  3'   
3  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

...atgttttattgttttgatacccatcttttctaatagcagaaacagtatttgtgccttttatcttccttgcactctagattaaacttgttttcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCAAGGCTCTGAAATCAGGTACAGCCACTTTTAAGAAGAAAGCTAAGAAGAT

Basic information

species Vitis vinifera
transcript Vv13s0019g00250.t01
intron # 2
splice site 3'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|110688462|gb|EE067038.1|EE067038
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGTCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|110424953|gb|EC991328.1|EC991328
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|351026570|gb|FQ432468.1|FQ432468
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|71872518|gb|DT021573.1|DT021573
EST:     GCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|110385983|gb|EC950550.1|EC950550
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|33407650|gb|CF213277.1|CF213277
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAACGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|32268037|gb|CD717196.1|CD717196
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|110401007|gb|EC967598.1|EC967598
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|71872467|gb|DT021522.1|DT021522
EST:     GCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|87584424|gb|DY473607.1|DY473607
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|351024094|gb|FQ423517.1|FQ423517
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|351019485|gb|FQ429620.1|FQ429620
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|110706331|gb|EE081763.1|EE081763
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|351015356|gb|FQ445640.1|FQ445640
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|71874223|gb|DT023278.1|DT023278
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|351022551|gb|FQ447073.1|FQ447073
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|71866219|gb|DT015274.1|DT015274
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|352798732|gb|FQ478367.1|FQ478367
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|34545157|gb|CF513389.1|CF513389
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|77585769|gb|DV221981.1|DV221981
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|71866855|gb|DT015910.1|DT015910
EST:     GCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|110358012|gb|EC921923.1|EC921923
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|351031276|gb|FQ445301.1|FQ445301
EST:     GAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GAAGTGCTTTAAGCAGAG-TTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|37188705|gb|CF608054.1|CF608054
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|352794786|gb|FQ475281.1|FQ475281
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTGCAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|110397454|gb|EC963194.1|EC963194
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|110705535|gb|EE082493.1|EE082493
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|351022935|gb|FQ428844.1|FQ428844
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|110389202|gb|EC954022.1|EC954022
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|351017294|gb|FQ435646.1|FQ435646
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|351041471|gb|FQ431497.1|FQ431497
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|351025316|gb|FQ434329.1|FQ434329
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCATATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|34546152|gb|CF514384.1|CF514384
EST:     GGAAGTGCTCTATGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|351034464|gb|FQ463277.1|FQ463277
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|110375486|gb|EC940475.1|EC940475
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|351040253|gb|FQ425339.1|FQ425339
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCG
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|110427033|gb|EC993464.1|EC993464
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|77581490|gb|DV219684.1|DV219684
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|33407736|gb|CF213363.1|CF213363
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAACGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|110690452|gb|EE067565.1|EE067565
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|351040059|gb|FQ425145.1|FQ425145
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|110691014|gb|EE068628.1|EE068628
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|110378352|gb|EC943479.1|EC943479
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|37188762|gb|CF608111.1|CF608111
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|351049057|gb|FQ431601.1|FQ431601
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|351040964|gb|FQ443740.1|FQ443740
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|351015928|gb|FQ431883.1|FQ431883
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGTTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|351025380|gb|FQ435072.1|FQ435072
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|110732209|gb|EE107294.1|EE107294
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|110367031|gb|EC930951.1|EC930951
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|37187755|gb|CF607108.1|CF607108
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|33409901|gb|CF215528.1|CF215528
EST:     GGAAGTGCTTTAAGGATCNTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|77581308|gb|DV219585.1|DV219585
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|110398202|gb|EC964392.1|EC964392
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|110413785|gb|EC979596.1|EC979596
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|110689642|gb|EE066055.1|EE066055
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|71865911|gb|DT014966.1|DT014966
EST:     GCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|110693455|gb|EE069699.1|EE069699
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|110730192|gb|EE106988.1|EE106988
EST:     GCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|30135975|gb|CB921313.1|CB921313
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|349826876|gb|FQ418967.1|FQ418967
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCATATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|351029071|gb|FQ435271.1|FQ435271
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|349831052|gb|FQ420722.1|FQ420722
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|110731174|gb|EE109098.1|EE109098
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|110405089|gb|EC970622.1|EC970622
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|349828347|gb|FQ416300.1|FQ416300
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCGATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|110701169|gb|EE078463.1|EE078463
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAATACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|351045311|gb|FQ451759.1|FQ451759
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|110703496|gb|EE080395.1|EE080395
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|351030992|gb|FQ439028.1|FQ439028
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTGAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|352787182|gb|FQ477802.1|FQ477802
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCACGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|110394508|gb|EC959611.1|EC959611
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|110381495|gb|EC934618.1|EC934618
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|110361115|gb|EC924568.1|EC924568
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|110702091|gb|EE080407.1|EE080407
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|33410131|gb|CF215758.1|CF215758
EST:     GAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATNCTGCAATGGCTATC-GCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCT-CCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|351014099|gb|FQ434251.1|FQ434251
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|110397173|gb|EC962897.1|EC962897
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|26265272|gb|CA816335.1|CA816335
EST:     TAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCCCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: TAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|110363300|gb|EC926877.1|EC926877
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|110702263|gb|EE080779.1|EE080779
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
EST: gi|349830993|gb|FQ418277.1|FQ418277
EST:     GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAG                         TTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA
genomic: GGAAGTGCTTTAAGCAGAGTTTTTGCATCCTGCAATGGCTCCTGCTAAAGgtatattgtt ... tcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCA


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

tatttgtgccttttatcttccttgcactctagattaaacttgttttcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCAAGGCTCTGAAATCAGGTACAGCCACTTTTAAGAAGAAAGCTAAGAAGAT
                                      cttgttttcctttgc  CT-rich tract
 attaaacttgtttt  TA-rich tract
















Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
atgttttattgttttgatacccatcttttctaatagcagaaacagtatttgtgccttttatcttccttgcactctagattaaacttgttttcctttgcagTTGATCCTACAAAAAAGGCAGATCCTAAGACTCATGCTGCTAAGACTGCCAAGGCTCTGAAATCAGGTACAGCCACTTTTAAGAAGAAAGCTAAGAAGAT

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGAAA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGAAG
- - - - - - - - - acccatc
- - - - - - - - - - - - - - - - - - cagaaac