1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
gtaagtaacctattattttagatttggttgtcatcattttatttataggtttttctttcttagatttgatgttttgtgtgggcagTGAATGGGCGGTGAATATCCAGCGTGATAGCTATGCATCATATGTTGGCCACTACCCCTTACTGGCGTATTTTGCTATTGCTGAAAACGAATCAATTGGA
species | Vitis vinifera |
transcript | Vv05s0049g01230.t01 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CATCTGCAAGCAAAATATGTTGGAACTGGTCATGCTGACTTGAATAGATT TGAATGGGCGGTGAATATCCAGCGTGATAGCTATGCATCATATGTTGGCCAEST: gi|110686941|gb|EE063919.1|EE063919
genomic: CATCTGCAAGCAAAATATGTTGGAACTGGTCATGCTGACTTGAATAGATTgtaagtaacc ... gtgtgggcagTGAATGGGCGGTGAATATCCAGCGTGATAGCTATGCATCATATGTTGGCCA
EST: CATCTGCAAGCAAAATATGTTGGAACTGGTCATGCTGACTTGAATAGATT TGAATGGGCGGTGAATATCCAGCGTGATAGCTATGCATCATATGTTGGCCAEST: gi|32459229|gb|CD800403.1|CD800403
genomic: CATCTGCAAGCAAAATATGTTGGAACTGGTCATGCTGACTTGAATAGATTgtaagtaacc ... gtgtgggcagTGAATGGGCGGTGAATATCCAGCGTGATAGCTATGCATCATATGTTGGCCA
EST: TCTGCAAGCAAAATATGTTGGAACTGGTCACATGCTGACTTGAATAGATT TGAATGGGCGGTGAATATCCAGCGTGATAGCTATGCATCATATGTTGGCCAEST: gi|110687101|gb|EE064219.1|EE064219
genomic: TCTGCAAGCAAAATATGTTGGAACTGGT--CATGCTGACTTGAATAGATTgtaagtaacc ... gtgtgggcagTGAATGGGCGGTGAATATCCAGCGTGATAGCTATGCATCATATGTTGGCCA
EST: CATCTGCAAGCAAAATATGTTGGAACTGGTCATGCTGACTTGAATAGATT TGAATGGGCGGTGAATATCCAGCGTGATAGCTATGCATCATATGTTGGCCAEST: gi|110394837|gb|EC960188.1|EC960188
genomic: CATCTGCAAGCAAAATATGTTGGAACTGGTCATGCTGACTTGAATAGATTgtaagtaacc ... gtgtgggcagTGAATGGGCGGTGAATATCCAGCGTGATAGCTATGCATCATATGTTGGCCA
EST: CATCTGCAAGCAAAATATGTTGGAACTGGTCATGCTGACTTGAATAGATT TGAATGGGCGGTGAATATCCAGCGTGATAGCTATGCATCATATGTTGGCCAEST: gi|110731061|gb|EE108849.1|EE108849
genomic: CATCTGCAAGCAAAATATGTTGGAACTGGTCATGCTGACTTGAATAGATTgtaagtaacc ... gtgtgggcagTGAATGGGCGGTGAATATCCAGCGTGATAGCTATGCATCATATGTTGGCCA
EST: CATCTGCAAGCAAAATATGTTGGAACTGGTCATGCTGACTTGAATAGATT TGAATGGGCGGTGAATATCCAGCGTGATAGCTATGCATCATATGTTGGCCAEST: gi|110419282|gb|EC985499.1|EC985499
genomic: CATCTGCAAGCAAAATATGTTGGAACTGGTCATGCTGACTTGAATAGATTgtaagtaacc ... gtgtgggcagTGAATGGGCGGTGAATATCCAGCGTGATAGCTATGCATCATATGTTGGCCA
EST: CATCTGCATGCAAAATATGTTGGAACTGGTCATGCTGACTTGAATAGATT TGAATGGGCGGTGAATATCCAGCGTGATAGCTATGCATCATATGTTGGCCAEST: gi|110695800|gb|EE074233.1|EE074233
genomic: CATCTGCAAGCAAAATATGTTGGAACTGGTCATGCTGACTTGAATAGATTgtaagtaacc ... gtgtgggcagTGAATGGGCGGTGAATATCCAGCGTGATAGCTATGCATCATATGTTGGCCA
EST: CATCTGCAAGCAAAATATGTTGGAACTGGTCATGCTGACTTGAATAGATT TGAATGGGCGGTGAATATCCAGCGTGATAGCTATGCATCATATGTTGGCCA
genomic: CATCTGCAAGCAAAATATGTTGGAACTGGTCATGCTGACTTGAATAGATTgtaagtaacc ... gtgtgggcagTGAATGGGCGGTGAATATCCAGCGTGATAGCTATGCATCATATGTTGGCCA
tcatcattttatttataggtttttctttcttagatttgatgttttgtgtgggcagTGAATGGGCGGTGAATATCCAGCGTGATAGCTATGCATCATATGTTGGCCACTACCCCTTACTGGCGTATTTTGCTATTGCTGAAAACGAATCAATTGGA
atttgat putative branch site (score: 5)
attttatttataggtt TA-rich tract