1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' |
gtgttgctccaccacaattacaatttcatagttttgtctttggatatatgctctgtttggtgtatttacttggttgacctttgctttttttttttttgttttttttgctctcacttgacagGAGCAAAAGTTTTTGATCGGAGTCATCTTAATGGTTCCTTGCTATGCAATTGAATCG
species | Vitis vinifera |
transcript | Vv03s0038g03670.t01 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TCTCAATGTACCTTCTATTTGAGCACCTTTCTTCATACAAGAATCCCGAG GAGCAAAAGTTTTTGATCGGAGTCATCTTAATGGTTCCTTGCTATGCAATTEST: gi|161714620|gb|FC064217.1|FC064217
genomic: TCTCAATGTACCTTCTATTTGAGCACCTTTCTTCATACAAGAATCCCGAGgtgttgctcc ... cacttgacagGAGCAAAAGTTTTTGATCGGAGTCATCTTAATGGTTCCTTGCTATGCAATT
EST: TCTCAATGTACCTTCTATTTGAGCACCTTTCTTCATACAAGAATCCCGAG GAGCAAAAGTTTTTGATCGGAGTCATCTTAATGGTTCCTTGCTATGCAATT
genomic: TCTCAATGTACCTTCTATTTGAGCACCTTTCTTCATACAAGAATCCCGAGgtgttgctcc ... cacttgacagGAGCAAAAGTTTTTGATCGGAGTCATCTTAATGGTTCCTTGCTATGCAATT
tacttggttgacctttgctttttttttttttgttttttttgctctcacttgacagGAGCAAAAGTTTTTGATCGGAGTCATCTTAATGGTTCCTTGCTATGCAATTGAATCG
ctctcac putative branch site (score: 3)
cctttgcttttttttt CT-rich tract
tttgcttttttttttt TA-rich tract