Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtgaaaaaccttgttagaattcgggttttttcccaaatttttgttcataatctgttgtttgattgattcttatgtgtgtgaaaattcgacattcttattatgcagTTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTGCAGGGATTAACAATTGGTTGGTTCATATTGAG

Basic information

species Vitis vinifera
transcript Vv02s0087g00400.t01
intron # 2
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: Vv02s0087g00400.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 2
lower sequence: GLYMA01G35480.3 (Glycine max), 3'ss of exon 2
-gtgaaaaaccttgttaga--attcgggttttttcccaaatttttg--ttcataatctgttgtttgattgattcttatg-tgtgtgaaaattcgacattct---tattatgcagTTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTGCAGGGATTAACAATTGGTTGGTTCATATTGAG
  |   ||   ||| |      ||     | ||   ||  || ||    ||||  |   |  ||| | ||||  ||||  | | ||  || | || ||||    |||| ||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||  | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    |||||
gttaggaatttttgctgtgtcctttcatatattaatcatcttcttaatctcatgcttattattttcaatgatgtttatactatttgggaaattgaaattcaaaatattttgcagTTTGTTTGGATGGGAGTCCACCAGCTTACCATTTTGATAAGGGATTTGGATCAGGGATTAACAATTGGTTGGTTGCATTTGAG

upper sequence: Vv02s0087g00400.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 2
lower sequence: GLYMA09G35050.1 (Glycine max), 3'ss of exon 2
gtgaaaaaccttgttagaattcgggttttttcccaaatttttgttcataatctgttgtttgattgattcttatg-tgtgtgaaaattcgacatt---cttattatgcagTTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTGCAGGGATTAACAATTGGTTGGTTCATATTGAG
|| |  ||  ||    |  |       | |    ||  |  ||||| ||||||  || || |||  ||   ||| | | ||  |  | || |||   | |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||  | |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    |||||
gtaaggaatttttgctgtgtcttttcatatatttaa--tcatgttcttaatctaatgctt-attattttcaatgatatttgggatattgaaattcaacatattatgcagTTTGTTTGGATGGGAGTCCACCAGCTTATCATTTTGATAGGGGATTTGGATCAGGGATTAACAATTGGTTGGTTGCATTTGAG

upper sequence: Vv02s0087g00400.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 2
lower sequence: GLYMA16G08230.1 (Glycine max), 3'ss of exon 1
gtgaaaaaccttgttagaattcgggttttttcccaaatttttgttcataatctgttgtttgattgattcttatg-tgtgtgaaaattcgacatt---cttattatgcagTTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTGCAGGGATTAACAATTGGTTGGTTCATATTGAG
|||| |||  ||  | |   |    |        || | |   ||  |  ||| || || |    |||  |||  | | | | || | ||   |   | | | |||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||   |||||||||||| ||| | ||||| ||||||
gtgagaaatttttgttgtgatatcatggaactttaattctccattgct--tctatttttagtaatatttatataatatataataaattgaagcttaacgtgtcatgcagTTTGTTTGGATGGAAGTCCACCAGCTTACCACTTTGATAAGGGATTTGGAAAAGGGATTAACAACTGGATTGTTCACATTGAG

upper sequence: Vv02s0087g00400.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 2
lower sequence: GLYMA16G08240.1 (Glycine max), 3'ss of exon 2
gtgaaaaaccttgttagaattcgggttttttcccaaatttttgttcataatctgttgtttgattgattcttatg-tgtgtgaaaattcgacatt---cttattatgcagTTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTGCAGGGATTAACAATTGGTTGGTTCATATTGAG
|||| |||  ||  | |   |    |        || | |   ||  |  ||| || || |    |||  |||  | | ||| || | ||   |   | | | ||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||||||| |||| ||| | ||||| ||||||
gtgagaaatttttgttgtgatattatggaactttaattctccattgtt--tctatttttagtaatatttatataatatatgataaattgaagcttaacgtgtcatgcagTATGTTTGGATGGAAGTCCACCAGCTTACCACTTTGATAAGGGATTTGGAGAAGGGATTGACAACTGGATTGTTCACATTGAG

upper sequence: Vv02s0087g00400.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 2
lower sequence: GLYMA16G17120.1 (Glycine max), 3'ss of exon 1
gtgaaaaacctt-gttagaa--ttcgggtttt----ttcccaaatttttgttcataatctgttgtttgattgattcttatgtgtgtgaaaattcgacattcttattatgcagTTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTGCAGGGATTAACAATTGGTTGGTTCATATTGAG
|||| ||   || |||   |  || |||   |    ||| | | |  || |   |       | |||   | ||   |   | | |  ||  |  || |     | |||||||||| |||||||| || || || ||||||||| | |||||||||||||| | ||| ||||| |  ||| | ||||| ||||||
gtgagaattttttgttgtgacattagggaactataattctccagtgcttctatttttagcaatatttatataatagatg-atatattgaagcttaacgt----gtcatgcagTTTGTTTGGATGGAAGTCCCCCAGCTTACCACTTTGATAAGGGATTTGGGGAAGGTATTAATAGCTGGATTGTTCACATTGAG

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|37184751|gb|CF604105.1|CF604105
EST:     CTTCTATGTGGGAATTACGTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAG                         TTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
genomic: CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAGgtgaaaaacc ... tattatgcagTTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
EST: gi|71856065|gb|DT005120.1|DT005120
EST:     CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAG                         TTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
genomic: CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAGgtgaaaaacc ... tattatgcagTTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
EST: gi|110719772|gb|EE095190.1|EE095190
EST:     CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAG                         TTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
genomic: CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAGgtgaaaaacc ... tattatgcagTTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
EST: gi|22010091|gb|BQ795125.1|BQ795125
EST:     TTCTATGTGGGAATTACNTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAG                         TTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
genomic: TTCTATGTGGGAATTAC-TTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAGgtgaaaaacc ... tattatgcagTTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
EST: gi|294964082|gb|GW837885.1|GW837885
EST:     CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAG                         TTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
genomic: CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAGgtgaaaaacc ... tattatgcagTTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
EST: gi|352768101|gb|FQ467240.1|FQ467240
EST:     CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAG                         TTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
genomic: CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAGgtgaaaaacc ... tattatgcagTTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
EST: gi|110698014|gb|EE075544.1|EE075544
EST:     CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAG                         TTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
genomic: CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAGgtgaaaaacc ... tattatgcagTTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
EST: gi|110685994|gb|EE063201.1|EE063201
EST:     CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAG                         TTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
genomic: CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAGgtgaaaaacc ... tattatgcagTTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
EST: gi|110687331|gb|EE064646.1|EE064646
EST:     CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAG                         TTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
genomic: CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAGgtgaaaaacc ... tattatgcagTTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
EST: gi|110701053|gb|EE078256.1|EE078256
EST:     CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAG                         TTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
genomic: CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAGgtgaaaaacc ... tattatgcagTTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
EST: gi|28968205|gb|CB347238.1|CB347238
EST:     CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAG                         TTTGCTTGGAAGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
genomic: CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAGgtgaaaaacc ... tattatgcagTTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
EST: gi|30322666|gb|CD005928.1|CD005928
EST:     CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAG                         TTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
genomic: CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAGgtgaaaaacc ... tattatgcagTTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
EST: gi|110698866|gb|EE076852.1|EE076852
EST:     CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAG                         TTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
genomic: CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAGgtgaaaaacc ... tattatgcagTTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
EST: gi|33410293|gb|CF215920.1|CF215920
EST:     CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAG                         TTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
genomic: CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAGgtgaaaaacc ... tattatgcagTTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
EST: gi|37183780|gb|CF603134.1|CF603134
EST:     CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAG                         TTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
genomic: CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAGgtgaaaaacc ... tattatgcagTTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
EST: gi|352782414|gb|FQ470317.1|FQ470317
EST:     CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAG                         TTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
genomic: CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAGgtgaaaaacc ... tattatgcagTTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
EST: gi|352767915|gb|FQ466124.1|FQ466124
EST:     CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAG                         TTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
genomic: CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAGgtgaaaaacc ... tattatgcagTTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
EST: gi|110720782|gb|EE097004.1|EE097004
EST:     CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAG                         TTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
genomic: CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAGgtgaaaaacc ... tattatgcagTTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
EST: gi|30322537|gb|CD005799.1|CD005799
EST:     CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAG                         TTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
genomic: CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAGgtgaaaaacc ... tattatgcagTTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
EST: gi|110728091|gb|EE103366.1|EE103366
EST:     CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAG                         TTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
genomic: CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAGgtgaaaaacc ... tattatgcagTTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
EST: gi|71858006|gb|DT007061.1|DT007061
EST:     CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAG                         TTTGCTTGGATGGTAGTCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
genomic: CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAGgtgaaaaacc ... tattatgcagTTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
EST: gi|352764078|gb|FQ467648.1|FQ467648
EST:     CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAG                         TTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACTACATGGATAAGGGATTTGGTG
genomic: CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAGgtgaaaaacc ... tattatgcagTTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
EST: gi|352763755|gb|FQ473458.1|FQ473458
EST:     CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAG                         TTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
genomic: CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAGgtgaaaaacc ... tattatgcagTTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
EST: gi|110698827|gb|EE076773.1|EE076773
EST:     CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAG                         TTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
genomic: CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAGgtgaaaaacc ... tattatgcagTTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
EST: gi|352781577|gb|FQ468875.1|FQ468875
EST:     CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAG                         TTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
genomic: CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAGgtgaaaaacc ... tattatgcagTTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
EST: gi|110698396|gb|EE075846.1|EE075846
EST:     CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAG                         TTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
genomic: CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAGgtgaaaaacc ... tattatgcagTTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
EST: gi|110710999|gb|EE087696.1|EE087696
EST:     CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAG                         TTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
genomic: CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAGgtgaaaaacc ... tattatgcagTTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
EST: gi|71856420|gb|DT005475.1|DT005475
EST:     CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAG                         TTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
genomic: CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAGgtgaaaaacc ... tattatgcagTTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
EST: gi|32458466|gb|CD799640.1|CD799640
EST:     CTTCCATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAG                         TTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
genomic: CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAGgtgaaaaacc ... tattatgcagTTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
EST: gi|37188407|gb|CF607756.1|CF607756
EST:     CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAG                         TTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
genomic: CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAGgtgaaaaacc ... tattatgcagTTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
EST: gi|33408383|gb|CF214010.1|CF214010
EST:     CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAG                         TTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
genomic: CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAGgtgaaaaacc ... tattatgcagTTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
EST: gi|294964094|gb|GW837897.1|GW837897
EST:     CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAG                         TTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
genomic: CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAGgtgaaaaacc ... tattatgcagTTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
EST: gi|161714707|gb|FC062675.1|FC062675
EST:     CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAG                         TTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
genomic: CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAGgtgaaaaacc ... tattatgcagTTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
EST: gi|110698242|gb|EE075557.1|EE075557
EST:     CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAG                         TTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
genomic: CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAGgtgaaaaacc ... tattatgcagTTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
EST: gi|110721907|gb|EE097675.1|EE097675
EST:     CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAG                         TTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
genomic: CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAGgtgaaaaacc ... tattatgcagTTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
EST: gi|110730159|gb|EE106923.1|EE106923
EST:     CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAG                         TTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
genomic: CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAGgtgaaaaacc ... tattatgcagTTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
EST: gi|34548179|gb|CF516411.1|CF516411
EST:     CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAG                         TTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
genomic: CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAGgtgaaaaacc ... tattatgcagTTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
EST: gi|71857920|gb|DT006975.1|DT006975
EST:     CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAG                         TTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
genomic: CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAGgtgaaaaacc ... tattatgcagTTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
EST: gi|110690730|gb|EE068155.1|EE068155
EST:     CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAG                         TTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
genomic: CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAGgtgaaaaacc ... tattatgcagTTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
EST: gi|352778255|gb|FQ465565.1|FQ465565
EST:     CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAG                         TTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG
genomic: CTTCTATGTGGGAATTACTTATGTGGATAGTGCAGTAGCAAAAGGAGCAGgtgaaaaacc ... tattatgcagTTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTG


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

tctgttgtttgattgattcttatgtgtgtgaaaattcgacattcttattatgcagTTTGCTTGGATGGTAGCCCACCTGCTTACCACATGGATAAGGGATTTGGTGCAGGGATTAACAATTGGTTGGTTCATATTGAG
          gattgat  putative branch site (score: 4)
                                         ttcttatt  putative PPT
                                        attcttattat  TA-rich tract