Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

...ttgtcattgtgagattttggatattctttccattttttctcaatttgtttttgctttttcttaattcatggctaatctaaacaaattgatatggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAGGATGAGGAAATACGGAGTTTCTTCTATGGGATGTCACCTTGGCAG

Basic information

species Vitis vinifera
transcript Vv02s0012g01220.t01
intron # 2
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: Vv02s0012g01220.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 2
lower sequence: LOC_Os03g01014.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 2
ttgtcattgtgagattttggatattctttccattttttctcaatttgtttttgctttttcttaattcatggctaatctaaacaaattgatatggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAGGATGAGGAAATACGGAGTTTCTTCTATGGGATGTCACCTTGGCAG
        ||  |  |||  ||||   |   ||||  |    | ||| | |  ||| |  |  |||  ||  ||||||             ||  | |||||||||||||| || |  ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | || || ||||||||||| |||||||| ||||||
--------gtacgtatttatatataaat---atttactaattacttgctct--cttctcttcgatt--tgattaatctc------------tgcctgcagGATGAAGTTGTCAAATATTCACCTCATGCTCGCGCCATCAGGGATGTCGAGGATGAGGAGCTTCGCAGCTTCTTCTATGGCATGTCACCATGGCAG

upper sequence: Vv02s0012g01220.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 2
lower sequence: GLYMA01G40650.1 (Glycine max), 3'ss of exon 2
--------------------------------------------------------------------------------------ttgtcattgtgagattttggatattctttccattttttctcaatttgtttttgctttttcttaa-ttcatggctaatctaaacaaattgatatggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAGGATGAGGAAATACGGAGTTTCTTCTATGGGATGTCACCTTGGCAG
                                                                                      |||| ||| |    | ||  ||    ||     ||  ||  |||    | |    |||| | ||  |  |   ||||  |  |    || ||   | | ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||| |  |||| || |||||||||||||| |||||||||
gtaagttcatttattcattttatttgtgcttcaacttttttgaaaccccatgattgttggggaaaaaatgtataaagggggaaaatttgtgatttttctttgttcaattgagttgagccttagtcaaaataaactctcctcttttgtaaagcttctaattaatg-agccggcatggta-attaatagGATGAAGTTGTGAAGCTATCACCCCATGCCCGTGCCATCAGAGATGTAGAGGATGAAGAACTGTGGAGCTTTTTCTATGGGATGTCCCCTTGGCAG

upper sequence: Vv02s0012g01220.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 2
lower sequence: GLYMA11G04660.1 (Glycine max), 3'ss of exon 2
--------------------------------------ttgtcattgtgagatttt---ggatattctttccattttttctcaatttgt--ttttgctttttcttaattcatggctaatc-taaacaaattgatatggtt----acagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAGGATGAGGAAATACGGAGTTTCTTCTATGGGATGTCACCTTGGCAG
                                      |||  |    | ||||     | ||||   |   |         |||||||   ||| |||| | | |||| |  |||  |  | ||  |  ||| |||||     | ||||||||||||||||| |||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||| |  |||| || |||||||||||||| |||||||||
gtaagttcgtttattcgttttatttgtgtttcaactttttgaaaccccgtgattgctgggaatatatatagaaaaggggggaaatttgtgactttactttgt-tcaattgaaagcttctaattaatgagctgacatggtaattaatagGATGAAGTTGTGAAGCTATCGCCCCATGCCCGTGCTATCAGAGATGTAGAGGATGAAGAACTGTGGAGCTTTTTCTATGGGATGTCTCCTTGGCAG

upper sequence: Vv02s0012g01220.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 2
lower sequence: AT2G35260.1 (Arabidopsis thaliana), 3'ss of exon 2
ttgtcattgtgagattttggatattctttccattttttctcaatttgtttttgctttttcttaattcatggctaatctaaacaaattgatatg-gttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAGGATGAGGAAATACGGAGTTTCTTCTATGGGATGTCACCTTGGCAG
             |      ||| ||| |  ||  | | |  |||   | | | || ||   ||||  |    ||   |    | ||  | || |||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||| || | || || ||||  || ||||| || ||||||
-----------gtaaccaatataatctcttaatcatcttttgattc-ctctggtttctttagaattggttttaaaagaattatattttttctgtgttttagGATGAAGTTGTGAAGCTATCACCGCATGCTCGGGCCATTAGAGATGTGGAAGATGAAGAACTAAGAAGCTTTTTCTTCGGAATGTCCCCATGGCAG

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|351035793|gb|FQ463638.1|FQ463638
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GACGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|351039055|gb|FQ457730.1|FQ457730
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|351039429|gb|FQ461296.1|FQ461296
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTGGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|351012152|gb|FQ426874.1|FQ426874
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|351020007|gb|FQ439824.1|FQ439824
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|351037683|gb|FQ464124.1|FQ464124
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349819169|gb|FQ412063.1|FQ412063
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349812393|gb|FQ406414.1|FQ406414
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349810757|gb|FQ403000.1|FQ403000
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349813577|gb|FQ413811.1|FQ413811
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349814512|gb|FQ399152.1|FQ399152
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|110685965|gb|EE063144.1|EE063144
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349828788|gb|FQ419121.1|FQ419121
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|351035834|gb|FQ463679.1|FQ463679
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCGAGG-ATGTAGA
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATC-AGGGATGTAGA
EST: gi|351052068|gb|FQ455361.1|FQ455361
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349821894|gb|FQ413065.1|FQ413065
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATTACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349813688|gb|FQ413922.1|FQ413922
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|352790554|gb|FQ478193.1|FQ478193
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCCCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349815736|gb|FQ400892.1|FQ400892
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATTACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349807711|gb|FQ402102.1|FQ402102
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCGCCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349812553|gb|FQ407172.1|FQ407172
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349810791|gb|FQ403034.1|FQ403034
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|352790571|gb|FQ478210.1|FQ478210
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GACGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349825785|gb|FQ421884.1|FQ421884
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATTACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349813428|gb|FQ413662.1|FQ413662
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349812472|gb|FQ407091.1|FQ407091
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349813316|gb|FQ411556.1|FQ411556
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCACCAGGGATGTAAAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|351043486|gb|FQ428958.1|FQ428958
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349815127|gb|FQ410350.1|FQ410350
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|351053710|gb|FQ441476.1|FQ441476
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349824480|gb|FQ413147.1|FQ413147
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|351030960|gb|FQ438996.1|FQ438996
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349808733|gb|FQ406583.1|FQ406583
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|352790718|gb|FQ478266.1|FQ478266
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GACGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCCTGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|351044823|gb|FQ449077.1|FQ449077
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|351035608|gb|FQ463453.1|FQ463453
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|351031946|gb|FQ460203.1|FQ460203
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|351036805|gb|FQ457518.1|FQ457518
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCACGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|156737157|gb|EV241278.1|EV241278
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349807969|gb|FQ402360.1|FQ402360
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349816831|gb|FQ399699.1|FQ399699
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCACCCCGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|351044490|gb|FQ443021.1|FQ443021
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349827282|gb|FQ421555.1|FQ421555
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|110363320|gb|EC926898.1|EC926898
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349821455|gb|FQ411076.1|FQ411076
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|352769545|gb|FQ468473.1|FQ468473
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTGTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATG
EST: gi|351052314|gb|FQ455486.1|FQ455486
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|351044617|gb|FQ443148.1|FQ443148
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GACGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349809026|gb|FQ407475.1|FQ407475
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATTACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|351040122|gb|FQ425208.1|FQ425208
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349820691|gb|FQ408520.1|FQ408520
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATTACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349815052|gb|FQ410275.1|FQ410275
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|351027681|gb|FQ446848.1|FQ446848
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349820471|gb|FQ407027.1|FQ407027
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|351053126|gb|FQ455583.1|FQ455583
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GACGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|352790486|gb|FQ478126.1|FQ478126
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349810548|gb|FQ402791.1|FQ402791
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCACCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|351038381|gb|FQ461073.1|FQ461073
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349824550|gb|FQ413217.1|FQ413217
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|351012567|gb|FQ430131.1|FQ430131
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|352794475|gb|FQ481708.1|FQ481708
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349824314|gb|FQ417725.1|FQ417725
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349828983|gb|FQ419515.1|FQ419515
EST:     GCCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|351041784|gb|FQ455994.1|FQ455994
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349816518|gb|FQ399507.1|FQ399507
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349819433|gb|FQ412327.1|FQ412327
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|351036042|gb|FQ463887.1|FQ463887
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GACGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|351024867|gb|FQ430692.1|FQ430692
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349821615|gb|FQ411115.1|FQ411115
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349829230|gb|FQ419762.1|FQ419762
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCGCCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349813685|gb|FQ413919.1|FQ413919
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|351032974|gb|FQ461863.1|FQ461863
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349810521|gb|FQ402764.1|FQ402764
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCCTCATACCCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTCGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349814106|gb|FQ414340.1|FQ414340
EST:     GTCTTGGATATGCAGCACCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349813522|gb|FQ413756.1|FQ413756
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349813221|gb|FQ411461.1|FQ411461
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|351041820|gb|FQ456030.1|FQ456030
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GACGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|351056059|gb|FQ453520.1|FQ453520
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|351042406|gb|FQ442873.1|FQ442873
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATTACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349807185|gb|FQ401177.1|FQ401177
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|351051668|gb|FQ449482.1|FQ449482
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349819478|gb|FQ413362.1|FQ413362
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|351053531|gb|FQ459278.1|FQ459278
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GACGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|351035812|gb|FQ463657.1|FQ463657
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|351048131|gb|FQ442101.1|FQ442101
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GACGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349811864|gb|FQ410661.1|FQ410661
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|351042283|gb|FQ442750.1|FQ442750
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|351049340|gb|FQ429083.1|FQ429083
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|351046414|gb|FQ453030.1|FQ453030
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GACGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|351029667|gb|FQ427507.1|FQ427507
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349816147|gb|FQ399378.1|FQ399378
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|351054597|gb|FQ456794.1|FQ456794
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAAGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349810664|gb|FQ402907.1|FQ402907
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|352790569|gb|FQ478208.1|FQ478208
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATTACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|351044334|gb|FQ452886.1|FQ452886
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GACGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349810251|gb|FQ401697.1|FQ401697
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|352798910|gb|FQ480759.1|FQ480759
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|351037645|gb|FQ462629.1|FQ462629
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATTACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349820112|gb|FQ404834.1|FQ404834
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAG
EST: gi|349819332|gb|FQ412226.1|FQ412226
EST:     GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGAT                         GATGAAGTTGTGAAGTTAT-ACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGGA-GTAGA
genomic: GTCTTGGATATGCAGCGCCACCAATCATGGCCCTTCTCTTCATACTCGATgtatgttaat ... atggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGG-ATGTAGA


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

tgtttttgctttttcttaattcatggctaatctaaacaaattgatatggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAGGATGAGGAAATACGGAGTTTCTTCTATGGGATGTCACCTTGGCAG
         tttttcttaattcat  TA-rich tract
















Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
ttgtcattgtgagattttggatattctttccattttttctcaatttgtttttgctttttcttaattcatggctaatctaaacaaattgatatggttacagGATGAAGTTGTGAAGTTATCACCCCATGCTCGGGCCATCAGGGATGTAGAGGATGAGGAAATACGGAGTTTCTTCTATGGGATGTCACCTTGGCAG

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  AGAGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGGAT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  AGGATG
- - - - - - - - - - - - - - -ccatttt
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -tcatggc
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - aaacaaa