1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' | 15 5' 3' | 16 5' 3' | 17 5' 3' | 18 5' 3' | 19 5' 3' | 20 5' 3' |
...ctcaattaatagcaaatttaaataacatcttgtgctctccattctcatggtaaatagattcagacttatcaagtagatggtttctgatacacatgtgcagGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCACTGAAGCCCTTGAATATGGACTGGTTGGTGTCAATGAAGGATTGGTTTC
species | Vitis vinifera |
transcript | Vv19s0085g00880.t01 |
intron # | 17 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTG GTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCAEST: gi|351040417|gb|FQ434550.1|FQ434550
genomic: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTGgtttgtttcc ... acatgtgcagGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCA
EST: CTTTAAAACCGGGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTG GTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCAEST: gi|110360909|gb|EC924352.1|EC924352
genomic: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTGgtttgtttcc ... acatgtgcagGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCA
EST: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCGCTGCTG GTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCAEST: gi|30302041|gb|CB978835.1|CB978835
genomic: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTGgtttgtttcc ... acatgtgcagGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCA
EST: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCGCTGCTG GTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCAEST: gi|32245740|gb|CD711559.1|CD711559
genomic: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTGgtttgtttcc ... acatgtgcagGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCA
EST: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTG GTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCAEST: gi|30128391|gb|CB913730.1|CB913730
genomic: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTGgtttgtttcc ... acatgtgcagGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCA
EST: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTG GTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCAEST: gi|29785203|gb|CB341997.2|CB341997
genomic: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTGgtttgtttcc ... acatgtgcagGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCA
EST: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCGCTGCTG GTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCAEST: gi|352765000|gb|FQ473648.1|FQ473648
genomic: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTGgtttgtttcc ... acatgtgcagGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCA
EST: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTG GTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCAEST: gi|77586300|gb|DV222253.1|DV222253
genomic: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTGgtttgtttcc ... acatgtgcagGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCA
EST: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCGCTGCTG GTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCAEST: gi|351018416|gb|FQ439228.1|FQ439228
genomic: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTGgtttgtttcc ... acatgtgcagGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCA
EST: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTG GTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCAEST: gi|349820783|gb|FQ404157.1|FQ404157
genomic: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTGgtttgtttcc ... acatgtgcagGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCA
EST: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTG GTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCAEST: gi|34320384|gb|CF373138.1|CF373138
genomic: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTGgtttgtttcc ... acatgtgcagGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCA
EST: GGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCGCTGCTG GTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCAEST: gi|77580016|gb|DV218890.1|DV218890
genomic: GGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTGgtttgtttcc ... acatgtgcagGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCA
EST: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCGCTGCTG GTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCAEST: gi|33407655|gb|CF213282.1|CF213282
genomic: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTGgtttgtttcc ... acatgtgcagGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCA
EST: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCGCTGCTG GTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCAEST: gi|110373835|gb|EC938222.1|EC938222
genomic: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTGgtttgtttcc ... acatgtgcagGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCA
EST: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCGCTGCTG GTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCAEST: gi|110395231|gb|EC960880.1|EC960880
genomic: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTGgtttgtttcc ... acatgtgcagGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCA
EST: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCGCTGCTG GTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCAEST: gi|110384512|gb|EC948953.1|EC948953
genomic: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTGgtttgtttcc ... acatgtgcagGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCA
EST: CTTTAAAACCCAGTAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCGCTGCTG GTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCAEST: gi|110363491|gb|EC927084.1|EC927084
genomic: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTGgtttgtttcc ... acatgtgcagGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCA
EST: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCGCTGCTG GTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCAEST: gi|110378892|gb|EC944048.1|EC944048
genomic: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTGgtttgtttcc ... acatgtgcagGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCA
EST: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCGCTGCTG GTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCAEST: gi|110393201|gb|EC958271.1|EC958271
genomic: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTGgtttgtttcc ... acatgtgcagGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCA
EST: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCGCTGCTG GTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCAEST: gi|110714572|gb|EE091629.1|EE091629
genomic: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTGgtttgtttcc ... acatgtgcagGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCA
EST: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTG GTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCAEST: gi|110420827|gb|EC987109.1|EC987109
genomic: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTGgtttgtttcc ... acatgtgcagGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCA
EST: TAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTG GTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCAEST: gi|110418290|gb|EC984428.1|EC984428
genomic: TAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTGgtttgtttcc ... acatgtgcagGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCA
EST: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTG GTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCAEST: gi|110728458|gb|EE104042.1|EE104042
genomic: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTGgtttgtttcc ... acatgtgcagGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCA
EST: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCGCTGCTG GTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCAEST: gi|34543207|gb|CF511439.1|CF511439
genomic: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTGgtttgtttcc ... acatgtgcagGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCA
EST: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCGCTGCTG GTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCAEST: gi|30128422|gb|CB913761.1|CB913761
genomic: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTGgtttgtttcc ... acatgtgcagGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCA
EST: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTG GTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCAEST: gi|161716149|gb|FC069492.1|FC069492
genomic: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTGgtttgtttcc ... acatgtgcagGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCA
EST: CTTTAAAACCGAGGATGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCGCTGCTG GTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCAEST: gi|33407050|gb|CF212677.1|CF212677
genomic: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTGgtttgtttcc ... acatgtgcagGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCA
EST: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCGCTGCTG GTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCAEST: gi|352763958|gb|FQ465408.1|FQ465408
genomic: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTGgtttgtttcc ... acatgtgcagGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCA
EST: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTG GTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCAEST: gi|30134739|gb|CB920077.1|CB920077
genomic: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTGgtttgtttcc ... acatgtgcagGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCA
EST: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTG GTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCAEST: gi|351029837|gb|FQ427677.1|FQ427677
genomic: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTGgtttgtttcc ... acatgtgcagGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCA
EST: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTG GTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCAEST: gi|110430209|gb|EC996749.1|EC996749
genomic: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTGgtttgtttcc ... acatgtgcagGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCA
EST: CCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTG GTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCAEST: gi|110686641|gb|EE064513.1|EE064513
genomic: CCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTGgtttgtttcc ... acatgtgcagGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCA
EST: CTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTG GTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCAEST: gi|352769124|gb|FQ471072.1|FQ471072
genomic: CTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTGgtttgtttcc ... acatgtgcagGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCA
EST: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTG GTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCAEST: gi|110693458|gb|EE069709.1|EE069709
genomic: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTGgtttgtttcc ... acatgtgcagGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCA
EST: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTG GTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCAEST: gi|110371647|gb|EC935762.1|EC935762
genomic: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTGgtttgtttcc ... acatgtgcagGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCA
EST: TAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCGCTGCTG GTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCAEST: gi|110375935|gb|EC940965.1|EC940965
genomic: TAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTGgtttgtttcc ... acatgtgcagGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCA
EST: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCGCTGCTG GTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCAEST: gi|32459450|gb|CD800624.1|CD800624
genomic: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTGgtttgtttcc ... acatgtgcagGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCA
EST: CCGCATTGCAAATGACACCAATGCTG GTTTAGCTGCTTTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGGGTGTEST: gi|29781739|gb|CB346445.2|CB346445
genomic: CCGCATTGCAAATGACACCAATGCTGgtttgtttcc ... acatgtgcagGTTTAGCTGC--TTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGT
EST: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCGCTGCTG GTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCAEST: gi|27586231|gb|CB008926.1|CB008926
genomic: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTGgtttgtttcc ... acatgtgcagGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCA
EST: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTG GTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCAEST: gi|30251721|gb|CB969454.1|CB969454
genomic: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTGgtttgtttcc ... acatgtgcagGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCA
EST: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCGCTGCTG GTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGGTGGTGTGTCEST: gi|37190549|gb|CF609898.1|CF609898
genomic: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTGgtttgtttcc ... acatgtgcagGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATG-TGGCGTGTC
EST: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCACCGCTG GTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCAEST: gi|351040173|gb|FQ425259.1|FQ425259
genomic: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTGgtttgtttcc ... acatgtgcagGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCA
EST: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTG GTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCAEST: gi|110688619|gb|EE067379.1|EE067379
genomic: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTGgtttgtttcc ... acatgtgcagGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCA
EST: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTG GTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCA
genomic: CTTTAAAACCGAGGAGGAAGCTATCCGCATTGCAAATGACACCAATGCTGgtttgtttcc ... acatgtgcagGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCA
catggtaaatagattcagacttatcaagtagatggtttctgatacacatgtgcagGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCACTGAAGCCCTTGAATATGGACTGGTTGGTGTCAATGAAGGATTGGTTTC
ttctgat putative branch site (score: 3)
taaatagatt TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| ctcaattaatagcaaatttaaataacatcttgtgctctccattctcatggtaaatagattcagacttatcaagtagatggtttctgatacacatgtgcagGTTTAGCTGCTTATGTATTCACTGAAAACGTGCAACGTATGTGGCGTGTCACTGAAGCCCTTGAATATGGACTGGTTGGTGTCAATGAAGGATTGGTTTC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CTGAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGAAGC
- - - -aatagcaa
- - - - - - - - - -aaataac
- - - - - - - - - - - - - - - - - ctctcca
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -aaataga
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - tcaagta
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -ctgatac