1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' | 15 5' 3' | 16 5' 3' | 17 5' 3' | 18 5' 3' | 19 5' 3' | 20 5' 3' |
21 5' 3' | 22 5' 3' | 23 5' 3' | 24 5' 3' |
gtatttgttcttttgctactatgactatgagtccatttcatttgctagatttttgcatgtcgtcttctgctgtcattgatttgcaggcttcacattgttgttctttgttgtagGGCATGATCCTGTTATGGGATGTTGACTCTGGACTTGCTCAAATTGACAAGTATTTTCACAGCAATGACAACCATGTCATTGCTGGTGCACTATTAGGGG
species | Vitis vinifera |
transcript | Vv12s0028g03130.t01 |
intron # | 14 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GGCTTTTTAAGAATAAAGAACATGGGAAAGCCAGTGCTGCAGCAAGTCTG GGCATGATCCTGTTATGGGATGTTGACTCTGGACTTGCTCAAATTGACAAGEST: gi|71864029|gb|DT013084.1|DT013084
genomic: GGCTTTTTAAGAATAAAGAACATGGGAAAGCCAGTGCTGCAGCAAGTCTGgtatttgttc ... tttgttgtagGGCATGATCCTGTTATGGGATGTTGACTCTGGACTTGCTCAAATTGACAAG
EST: GGCTTTTTAAGAATAAAGAACATGGGAAAGCCAGTGCTGCAGCAAGTCTG GGCACGATCCTGTTATGGGATGTTGACTCTGGACTTGCTCAAATTGACAAGEST: gi|30304206|gb|CB981000.1|CB981000
genomic: GGCTTTTTAAGAATAAAGAACATGGGAAAGCCAGTGCTGCAGCAAGTCTGgtatttgttc ... tttgttgtagGGCATGATCCTGTTATGGGATGTTGACTCTGGACTTGCTCAAATTGACAAG
EST: GGCTTTTTAAGAATAAAGAACATGGGAAAGCCAGTGCTGCAGCAAGTCTG GGCATGATCCTGTTATGGGATGTTGACTCTGGACTTGCTCAAATTGACAAGEST: gi|110707945|gb|EE084922.1|EE084922
genomic: GGCTTTTTAAGAATAAAGAACATGGGAAAGCCAGTGCTGCAGCAAGTCTGgtatttgttc ... tttgttgtagGGCATGATCCTGTTATGGGATGTTGACTCTGGACTTGCTCAAATTGACAAG
EST: GGCTTTTTAAGAATAAAGAACATGGGAAAGCCAGTGCTGCAGCAAGTCTG GGCATGATCCTGTTATGGGATGTTGACTCTGGACTTGCTCAAATTGACAAGEST: gi|71860625|gb|DT009680.1|DT009680
genomic: GGCTTTTTAAGAATAAAGAACATGGGAAAGCCAGTGCTGCAGCAAGTCTGgtatttgttc ... tttgttgtagGGCATGATCCTGTTATGGGATGTTGACTCTGGACTTGCTCAAATTGACAAG
EST: GGCTTTTTAAGAATAAAGAACATGGGAAAGCCAGTGCTGCAGCAAGTCTG GGCACGATCCTGTTATGGGATGTTGACTCTGGACTTGCTCAAATTGACAAGEST: gi|71863903|gb|DT012958.1|DT012958
genomic: GGCTTTTTAAGAATAAAGAACATGGGAAAGCCAGTGCTGCAGCAAGTCTGgtatttgttc ... tttgttgtagGGCATGATCCTGTTATGGGATGTTGACTCTGGACTTGCTCAAATTGACAAG
EST: GGCTTTTTAAGAATAAAGAACATGGGAAAGCCAGTGCTGCAGCAAGTCTG GGCACGATCCTGTTATGGGATGTTGACTCTGGACTTGCTCAAATTGACAAG
genomic: GGCTTTTTAAGAATAAAGAACATGGGAAAGCCAGTGCTGCAGCAAGTCTGgtatttgttc ... tttgttgtagGGCATGATCCTGTTATGGGATGTTGACTCTGGACTTGCTCAAATTGACAAG
gtcgtcttctgctgtcattgatttgcaggcttcacattgttgttctttgttgtagGGCATGATCCTGTTATGGGATGTTGACTCTGGACTTGCTCAAATTGACAAGTATTTTCACAGCAATGACAACCATGTCATTGCTGGTGCACTATTAGGGG
cattgat putative branch site (score: 4)
ttgttcttt putative PPT
attgattt TA-rich tract