1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' |
gtaaaaccatatcatgatttttttcttgcctacctttttcccctcgcttgctttatttgatatttatatgttctgccttttgcttcaaaaatgtcagGAGCATACATGGGGCAACAAGTACCTGGTGCCATTCCACCTTCCAG
species | Vitis vinifera |
transcript | Vv11s0016g04210.t01 |
intron # | 11 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GTCGGGAATGCCTCCACAAGTACCGCCTTATGCATCGGGAATGCCTCCAA GAGCATACATGGGGCAACAAGTACCTGGTGCCATTCCAGATTCCAGEST: gi|110696912|gb|EE073450.1|EE073450
genomic: GTCGGGAATGCCTCCACAAGTACCGCCTTATGCGTCGGGAATGCCTCCAAgtaaaaccat ... aaaatgtcagGAGCATACATGGGGCAACAAGTACCTGGTGCCATTCCACCTTCCAG
EST: GTCGGGAATGCCTCCACAAGTACCGCCTTATGCGTCGGGAATGCCTCCAA GAGCATACATGGGGCAACAAGTACCTGGTGCCATTCCACCTTCCAGEST: gi|27584152|gb|CB006847.1|CB006847
genomic: GTCGGGAATGCCTCCACAAGTACCGCCTTATGCGTCGGGAATGCCTCCAAgtaaaaccat ... aaaatgtcagGAGCATACATGGGGCAACAAGTACCTGGTGCCATTCCACCTTCCAG
EST: GTCGGGAATGCCTCCACAAGTACCGCCTTATGCGTCGGGAATGCCTCCAA GAGCATACATGGGGCAACAAGTACCTGGTGCCATTCCACCTTCCAGEST: gi|34544915|gb|CF513147.1|CF513147
genomic: GTCGGGAATGCCTCCACAAGTACCGCCTTATGCGTCGGGAATGCCTCCAAgtaaaaccat ... aaaatgtcagGAGCATACATGGGGCAACAAGTACCTGGTGCCATTCCACCTTCCAG
EST: GTCGGGAATGCCTCCACAAGTACCGCCTTATGCATCGGGAATGCCTCCAA GAGCATACATGGGGCAACAAGTACCTGGTGCCATTCCACCTTCCAG
genomic: GTCGGGAATGCCTCCACAAGTACCGCCTTATGCGTCGGGAATGCCTCCAAgtaaaaccat ... aaaatgtcagGAGCATACATGGGGCAACAAGTACCTGGTGCCATTCCACCTTCCAG
ctcgcttgctttatttgatatttatatgttctgccttttgcttcaaaaatgtcagGAGCATACATGGGGCAACAAGTACCTGGTGCCATTCCACCTTCCAG
atttgat putative branch site (score: 5)
tttatttgatatttat TA-rich tract