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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtaagtgcttcagatactttcagggttgacagtctgatgcccccacgttacatgctagtatttccttctaaatgtgatatctttcatcatttacagAGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACAATGTTCTCATTTCAACTTCGTGATGGTCAACATCCCTTTAGCTTGTCAA

Basic information

species Vitis vinifera
transcript Vv02s0025g04580.t01
intron # 10
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: Vv02s0025g04580.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 10
lower sequence: GLYMA09G27380.1 (Glycine max), 3'ss of exon 10
gtaag---tgcttcagatactttcagggttgacagtctg-------atgcccccacgttacat---gctagtatttccttctaaatgtgatatc-------tttcatcatttacagAGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACAATGTTCTCATTTCAACTTCGTGATGGTCAACATCCCTTTAGCTTGTCAA
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gtaaggtttccctcacttatattctttgtttattttccctttatgcatgactgcatctttcatatggacaatggctgattctaaatttctcatcagaattgtctttcaatgtgcagGTAGGTAAACGGGTAGTTATGTTTTCATATGGAAGTGGTTTAACAGCTACAATGTTCTCCTTCCACCTTCAAGAGGGTCAACATCCTTTTAACTTGTCAA

upper sequence: Vv02s0025g04580.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 10
lower sequence: GLYMA16G32480.1 (Glycine max), 3'ss of exon 10
gtaagtgcttcag-------atactttcagggttgacagtctg---atgcccccacgttacatgct---agtatttccttctaaatgtgatatc-------tttcatcatttacagAGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACAATGTTCTCATTTCAACTTCGTGATGGTCAACATCCCTTTAGCTTGTCAA
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gtaaggttttccacacttgtattcttcgtttattttccctttgtccatgactgcatctttcatacggagaatggctgattctaaatttctcatcaggattgtctttctatatgcagGTAGGTAAACGGGTAGTTATGTTTTCATATGGAAGTGGTTTAACAGCTACAATGTTCTCCTTCCAGCTTCAAGAGGGTCAACATCCGTTTAACTTGTCAA
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|30134727|gb|CB920065.1|CB920065
EST:     CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTG                         AGTGGCAAACGGGTTGTAATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
genomic: CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTGgtaagtgctt ... tcatttacagAGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
EST: gi|33403076|gb|CF208703.1|CF208703
EST:     CTCTTTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTG                         AGTGGCAAACGGGTTGTAATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
genomic: CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTGgtaagtgctt ... tcatttacagAGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
EST: gi|110696550|gb|EE072775.1|EE072775
EST:     CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTG                         AGTGGCAAACGGGTTGTAATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
genomic: CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTGgtaagtgctt ... tcatttacagAGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
EST: gi|110362550|gb|EC926093.1|EC926093
EST:     CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTG                         AGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
genomic: CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTGgtaagtgctt ... tcatttacagAGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
EST: gi|32457010|gb|CD798184.1|CD798184
EST:     ATAAACATAGTGAGTTG                         AGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
genomic: ATAAACATAGTGAGTTGgtaagtgctt ... tcatttacagAGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
EST: gi|32456926|gb|CD798100.1|CD798100
EST:     CATAGTGAGTTG                         AGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGTGGTTTAACTGCAA
genomic: CATAGTGAGTTGgtaagtgctt ... tcatttacagAGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAA--GTGGTTTAACTGCAA
EST: gi|110390437|gb|EC955346.1|EC955346
EST:     CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTG                         AGTGGCAAACGGGTTGTAATGTTCTCA
genomic: CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTGgtaagtgctt ... tcatttacagAGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCA
EST: gi|71864507|gb|DT013562.1|DT013562
EST:     CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTG                         AGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
genomic: CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTGgtaagtgctt ... tcatttacagAGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
EST: gi|110412104|gb|EC977839.1|EC977839
EST:     CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTG                         AGTGGCAAACGGGTTGTAATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
genomic: CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTGgtaagtgctt ... tcatttacagAGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
EST: gi|32457034|gb|CD798208.1|CD798208
EST:     ATAAACATAGTGAGTTG                         AGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
genomic: ATAAACATAGTGAGTTGgtaagtgctt ... tcatttacagAGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
EST: gi|110697826|gb|EE075245.1|EE075245
EST:     CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTG                         AGTGGCAAACGGGTTGTAATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
genomic: CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTGgtaagtgctt ... tcatttacagAGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
EST: gi|110359996|gb|EC922449.1|EC922449
EST:     CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTG                         AGTGGCAAACGGGTTGTAATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
genomic: CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTGgtaagtgctt ... tcatttacagAGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
EST: gi|33403214|gb|CF208841.1|CF208841
EST:     CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTG                         AGTGGCAAACGGGTTGTAATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
genomic: CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTGgtaagtgctt ... tcatttacagAGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
EST: gi|110374042|gb|EC938533.1|EC938533
EST:     CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTG                         AGTGGCAAACGGGTTGTAATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
genomic: CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTGgtaagtgctt ... tcatttacagAGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
EST: gi|352777935|gb|FQ466988.1|FQ466988
EST:     CTCTCTATGCAGCATTGGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTG                         AGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
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EST: gi|87584077|gb|DY473370.1|DY473370
EST:     CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTG                         AGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
genomic: CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTGgtaagtgctt ... tcatttacagAGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
EST: gi|110718761|gb|EE095962.1|EE095962
EST:     CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTG                         AGTGGCAAACGGGT-GATAATGTTCTCATATGGAAATGGGTTTAACTGCAA
genomic: CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTGgtaagtgctt ... tcatttacagAGTGGCAAACGGGTTG-TGATGTTCTCATATGGAAGTGG-TTTAACTGCAA
EST: gi|110357879|gb|EC921692.1|EC921692
EST:     CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTG                         AGTGGCAAACGGGTTGTAATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
genomic: CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTGgtaagtgctt ... tcatttacagAGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
EST: gi|22008404|gb|BQ793438.1|BQ793438
EST:     CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTG                         AGTGGCAAACGGGTTGTAATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
genomic: CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTGgtaagtgctt ... tcatttacagAGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
EST: gi|110696636|gb|EE072924.1|EE072924
EST:     CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTG                         AGTGGCAAACGGGTTGTAATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
genomic: CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTGgtaagtgctt ... tcatttacagAGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
EST: gi|83275967|gb|DV939975.1|DV939975
EST:     CTCTNTATGCAGCATTNGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTG                         AGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
genomic: CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTGgtaagtgctt ... tcatttacagAGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
EST: gi|45770667|gb|CN006519.1|CN006519
EST:     CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTG                         AGTGGCAAACGGGTTGTAATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
genomic: CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTGgtaagtgctt ... tcatttacagAGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
EST: gi|30137225|gb|CB922563.1|CB922563
EST:     CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTG                         AGTGGCAAACGGGTTGTAATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
genomic: CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTGgtaagtgctt ... tcatttacagAGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
EST: gi|110377475|gb|EC942541.1|EC942541
EST:     CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTG                         AGTGGCAAACGGGTTGTAATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
genomic: CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTGgtaagtgctt ... tcatttacagAGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
EST: gi|30251146|gb|CB968879.1|CB968879
EST:     CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTG                         AGTGGCAAACGGGTTGTAATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
genomic: CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTGgtaagtgctt ... tcatttacagAGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
EST: gi|110376736|gb|EC941809.1|EC941809
EST:     CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTG                         AGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
genomic: CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTGgtaagtgctt ... tcatttacagAGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
EST: gi|352794808|gb|FQ475303.1|FQ475303
EST:     CTCTATGCAGCATTGGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTG                         AGTGGCAAACGGGTTGTAATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
genomic: CTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTGgtaagtgctt ... tcatttacagAGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
EST: gi|45770657|gb|CN006509.1|CN006509
EST:     CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTG                         AGTGGCAAACGGGTTGTAATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
genomic: CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTGgtaagtgctt ... tcatttacagAGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
EST: gi|34545354|gb|CF513586.1|CF513586
EST:     CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTG                         AGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
genomic: CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTGgtaagtgctt ... tcatttacagAGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
EST: gi|30255490|gb|CB971622.1|CB971622
EST:     CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTG                         AGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
genomic: CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTGgtaagtgctt ... tcatttacagAGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
EST: gi|22011733|gb|BQ796767.1|BQ796767
EST:     CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTG                         AGTGGCAAACGGGTTGTAATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
genomic: CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTGgtaagtgctt ... tcatttacagAGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
EST: gi|22009851|gb|BQ794885.1|BQ794885
EST:     CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTG                         AGTGGCAAACGGGTTGTAATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
genomic: CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTGgtaagtgctt ... tcatttacagAGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
EST: gi|33401561|gb|CF207188.1|CF207188
EST:     CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTATTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTG                         AGTGGCAAACGGGTTGTAATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
genomic: CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTGgtaagtgctt ... tcatttacagAGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
EST: gi|33405731|gb|CF211358.1|CF211358
EST:     CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTG                         AGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
genomic: CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTGgtaagtgctt ... tcatttacagAGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
EST: gi|22007493|gb|BQ792527.1|BQ792527
EST:     CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTG                         AGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
genomic: CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTGgtaagtgctt ... tcatttacagAGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
EST: gi|110369148|gb|EC933295.1|EC933295
EST:     CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTG                         AGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
genomic: CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTGgtaagtgctt ... tcatttacagAGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
EST: gi|110699075|gb|EE077301.1|EE077301
EST:     ATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTG                         AGTGGCAAACGGGTTGTAATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
genomic: ATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTGgtaagtgctt ... tcatttacagAGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
EST: gi|110361435|gb|EC924904.1|EC924904
EST:     CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTG                         AGTGGCAAACGGGTTGTAATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
genomic: CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTGgtaagtgctt ... tcatttacagAGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
EST: gi|110730120|gb|EE106836.1|EE106836
EST:     TCTCTATGGCA-CATTTGTATCTGTTCTTCAAAATAAACATATTGAGTTG                         AGTGGCAAAAGGGTTGTAATGT
genomic: TCTCTATG-CAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTGgtaagtgctt ... tcatttacagAGTGGCAAACGGGTTGTGATGT
EST: gi|30251503|gb|CB969236.1|CB969236
EST:     CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTG                         AGTGGCAAACGGGTTGTAATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
genomic: CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTGgtaagtgctt ... tcatttacagAGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
EST: gi|352777480|gb|FQ474108.1|FQ474108
EST:     CTCTCTTTGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTG                         AGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
genomic: CTCTCTATGCAGCATTTGTATCTGTTCTTCACAATAAACATAGTGAGTTGgtaagtgctt ... tcatttacagAGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACA
EST: gi|110357104|gb|EC920414.1|EC920414
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 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

cccacgttacatgctagtatttccttctaaatgtgatatctttcatcatttacagAGTGGCAAACGGGTTGTGATGTTCTCATATGGAAGTGGTTTAACTGCAACAATGTTCTCATTTCAACTTCGTGATGGTCAACATCCCTTTAGCTTGTCAA
                        ttctaaa  putative branch site (score: 2)
                                      tctttcatc  putative PPT
              tagtattt  TA-rich tract