1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' |
gtaggtcttcacacgcacaccagttctgtttctatttgttacttttctttgaattcccatttgtataggttgaaagagcactcttttaatatgtgaaatttgtgtttgggtattgctaaataatgttaaaaatttcctgagtcttttgagttaaaaatgtgcagATTTTGATGGGTGTGATTAATATCTACGATATTTCCTCTCTTTGTGTGGTCAAACACAATACTGATATTCACTTATTGGAACCCCGAGCACCCATTTGTT
species | Vitis vinifera |
transcript | Vv18s0072g00940.t01 |
intron # | 1 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GCCACCACCCATTGA ATTTTGATGGGTGTGATTAATATCTACGATATTTCCTCTCTTTGTGTGGTCEST: gi|71857670|gb|DT006725.1|DT006725
genomic: GCCACCACCCATTGAgtaggtcttc ... aaatgtgcagATTTTGATGGGTGTGATTAATATCTACGATATTTCCTCTCTTTGTGTGGTC
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EST: TTGATACGATTTTCATTTCTCACTGCTCTCTTGCTGCCACCACCCATTGA ATTTTGATGGGTGTGATTAATATCTACGATATTTCCTCTCTTTGTGTGGTC
genomic: TTTATACGATTTTCATTTCTCACTGCTCTCTTGCTGCCACCACCCATTGAgtaggtcttc ... aaatgtgcagATTTTGATGGGTGTGATTAATATCTACGATATTTCCTCTCTTTGTGTGGTC
gtattgctaaataatgttaaaaatttcctgagtcttttgagttaaaaatgtgcagATTTTGATGGGTGTGATTAATATCTACGATATTTCCTCTCTTTGTGTGGTCAAACACAATACTGATATTCACTTATTGGAACCCCGAGCACCCATTTGTT
tgctaaa putative branch site (score: 2)
taaataatgttaaaaa TA-rich tract