Sequence
atgc intronic sequence ATGC exonic sequence...caaatagcttcatggatgggcataaagtctcctacaccatatagatatagaaaactaaggtccataaaatatggaatgaattttgcttatggagggacagGCGTCTTCAACACACTGGTTGATGCACCAAACAAGACAAAACAAATCGATTTGTTTGAACAACTCCTTAAAGAGAAACTCTATACCAAAGATGGCCTTAA
Basic information
atgc intronic sequence ATGC exonic sequenceIntronic sequence truncated to 55 bases.tatagaaaactaaggtccataaaatatggaatgaattttgcttatggagggacagGCGTCTTCAACACACTGGTTGATGCACCAAACAAGACAAAACAAATCGATTTGTTTGAACAACTCCTTAAAGAGAAACTCTATACCAAAGATGGCCTTAA
ataaaatatggaatga TA-rich tract
Putative cis-regulatory sequences
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
| | ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|
caaatagcttcatggatgggcataaagtctcctacaccatatagatatagaaaactaaggtccataaaatatggaatgaattttgcttatggagggacagGCGTCTTCAACACACTGGTTGATGCACCAAACAAGACAAAACAAATCGATTTGTTTGAACAACTCCTTAAAGAGAAACTCTATACCAAAGATGGCCTTAA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGATG
-aaatagc
- - - - - - -ggatggg
- - - - - - - - - - cataaag
- - - - - - - - - - - - - - - -ctacacc
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -aaactaa
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -ccataaa
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - ggaatga