Sequence
atgc intronic sequence ATGC exonic sequence...ttttatggaaagaatagggagaaaatggaagacttccaagaaattggtgagaaaatagcagacaaatgcaagggcttgccactcgctataaaaactttagGGAATCTCATGCGTTCAAAACATAATAGGGAAGAATGGGAGAATGTTTTGTGTAGTGAAGTATGGAAGCTGGATGTGTTTGGAAGAGATATTTCCCCTGC
Basic information
atgc intronic sequence ATGC exonic sequenceIntronic sequence truncated to 55 bases.ggtgagaaaatagcagacaaatgcaagggcttgccactcgctataaaaactttagGGAATCTCATGCGTTCAAAACATAATAGGGAAGAATGGGAGAATGTTTTGTGTAGTGAAGTATGGAAGCTGGATGTGTTTGGAAGAGATATTTCCCCTGC
tataaaaacttta TA-rich tract
Putative cis-regulatory sequences
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
| | ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|
ttttatggaaagaatagggagaaaatggaagacttccaagaaattggtgagaaaatagcagacaaatgcaagggcttgccactcgctataaaaactttagGGAATCTCATGCGTTCAAAACATAATAGGGAAGAATGGGAGAATGTTTTGTGTAGTGAAGTATGGAAGCTGGATGTGTTTGGAAGAGATATTTCCCCTGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGCTG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGAGA
- - - ggaaaga
- - - - - - - - -ggagaaa
- - - - - - - - - -agaaaat
- - - - - - - - - - - - - ggaagac
- - - - - - - - - - - - - - - - - -ccaagaa
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -gcagaca
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - aatgcaa
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - cttgcca