1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
gtgggtttgtgtttttcttgattgatttcttgatgggttttggttttctttggaaaattttttgatgggtgtttatctgtggtgcatggtgtggtgatggatagGTGCTTTCTTTGATTTTGGCTCGGTCTGTCAATCCGGATGTCTTGAATGGGCAGAAACAG
species | Vitis vinifera |
transcript | Vv08s0007g00200.t01 |
intron # | 1 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: ATGGGAGGCTCCCTGCGCTTCATTTGGCAGCTGCCAAAGGTCGGATCGAG GTGCTTTCTTTGATTTTGGCTCGGTCTGTCAATCCGGATGTCTTGAATGGGEST: gi|71855125|gb|DT004180.1|DT004180
genomic: ATGGGAGGCTCCCTGCGCTTCATTTGGCAGCTGCCAAAGGTCGGATCGAGgtgggtttgt ... tgatggatagGTGCTTTCTTTGATTTTGGCTCGGTCTGTCAATCCGGATGTCTTGAATGGG
EST: ATGGGAGGCTCCCTGCGCTTCATTTGGCAGCTGCCAAAGGTCGGATCGAG GTGCTTTCTTTGATTTTGGCTCGGTCTGTCAATCCGGATGTCTTGAATGGGEST: gi|110413263|gb|EC979042.1|EC979042
genomic: ATGGGAGGCTCCCTGCGCTTCATTTGGCAGCTGCCAAAGGTCGGATCGAGgtgggtttgt ... tgatggatagGTGCTTTCTTTGATTTTGGCTCGGTCTGTCAATCCGGATGTCTTGAATGGG
EST: ATGGGAGGCTCCCTGCGCTTCATTTGGCAGCTGCCAAAGGTCGGATCGAG GTGCTTTCTTTGATTTTGGCTCGGTCTGTCAATCCGGATGTCTTGAATGGGEST: gi|27583732|gb|CB006427.1|CB006427
genomic: ATGGGAGGCTCCCTGCGCTTCATTTGGCAGCTGCCAAAGGTCGGATCGAGgtgggtttgt ... tgatggatagGTGCTTTCTTTGATTTTGGCTCGGTCTGTCAATCCGGATGTCTTGAATGGG
EST: ATGGGAGGCTCCCTGCGCTTCATTTGGCAGCTGCCAAAGGTCGGATCGAG GTGCTTTCTTTGATTTTGGCTCGGTCTGTCAATCCGGATGTCTTGAATGGGEST: gi|161721280|gb|FC070033.1|FC070033
genomic: ATGGGAGGCTCCCTGCGCTTCATTTGGCAGCTGCCAAAGGTCGGATCGAGgtgggtttgt ... tgatggatagGTGCTTTCTTTGATTTTGGCTCGGTCTGTCAATCCGGATGTCTTGAATGGG
EST: ATGGGAGGCTCCCTGCGCTTCATTTGGCAGCTGCCAAAGGTCGGATCGAG GTGCTTTCTTTGATTTTGGCTCGGTCTGTCAATCCGGATGTCTTGAATGGGEST: gi|110412439|gb|EC978189.1|EC978189
genomic: ATGGGAGGCTCCCTGCGCTTCATTTGGCAGCTGCCAAAGGTCGGATCGAGgtgggtttgt ... tgatggatagGTGCTTTCTTTGATTTTGGCTCGGTCTGTCAATCCGGATGTCTTGAATGGG
EST: ATGGGAGGCTCCCTGCGCTTCATTTGGCAGCTGCCAAAGGTCGGATCGAG GTGCTTTCTTTGATTTTGGCTCGGTCTGTCAATCCGGATGTCTTGAATGGGEST: gi|30125105|gb|CB910444.1|CB910444
genomic: ATGGGAGGCTCCCTGCGCTTCATTTGGCAGCTGCCAAAGGTCGGATCGAGgtgggtttgt ... tgatggatagGTGCTTTCTTTGATTTTGGCTCGGTCTGTCAATCCGGATGTCTTGAATGGG
EST: ATGGGAGGCTCCCTGCGCTTCATTTGGCAGCTGCCAAAGGTCGGATCGAG GAGCTTTCTTTGATTTTGGCTCGGTCTGTCAATCCGGATGTCTTGAATGGG
genomic: ATGGGAGGCTCCCTGCGCTTCATTTGGCAGCTGCCAAAGGTCGGATCGAGgtgggtttgt ... tgatggatagGTGCTTTCTTTGATTTTGGCTCGGTCTGTCAATCCGGATGTCTTGAATGGG
ttggaaaattttttgatgggtgtttatctgtggtgcatggtgtggtgatggatagGTGCTTTCTTTGATTTTGGCTCGGTCTGTCAATCCGGATGTCTTGAATGGGCAGAAACAG
ttttgat putative branch site (score: 4)
aaattttttgat TA-rich tract