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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtgtgcaccactgctcttccttcctcagcctttctttagctttttctgttaaacactttactgggttgctctaagttcttcttcttcctttagccttctgatgtgggttgctcttagtgtgttttttagcatctgatggaagttttgtgtggtttgttgtctcagGAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGCTGTCTCTTACCAGGGCAATTTTCTACATCATAATGCAGTGCCTTGGTGC

Basic information

species Vitis vinifera
transcript Vv02s0025g03390.t01
intron # 1
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: Vv02s0025g03390.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 1
lower sequence: LOC_Os02g44630.3 (Oryza sativa), 3'ss of exon 1
gtgtgcaccactgctcttccttcctcagcctttctttagctttttctgttaaacactttactgggttgctctaagttcttcttcttcctttagccttctgatgtgggttgctcttagtgtgttttttagcatctgatggaagttttgtgtggtttgttgtctcagGAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGCTGTCTCTTACCAGGGCAATTTTCTACATCATAATGCAGTGCCTTGGTGC
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--------------------------------------------------------tatacagtcttacttcaa---ctgtcatgacaactgaccacaaaacaactacggcaattaagggcactactaatatccattata----ttgtctg--ttactgcaacagGAGGACACATCAACCCAGCAGTTACTTTTGGGCTGTTCTTGGCCAGGAAGCTGTCCCTGACCCGGGCCATCTTCTACATAGTGATGCAATGCCTAGGGGC

upper sequence: Vv02s0025g03390.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 1
lower sequence: GRMZM2G392975_T01 (Zea mays), 3'ss of exon 2
gtgtgcaccactgctcttccttcctcagcctttctttagctttttctgttaaacactttactgggttgctctaagttcttcttcttcctttagccttctgatgtgggtt---gctcttagtgtgttttttagcatctgatggaagttttgtgtggtttgttgtctcagGAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGCTGTCTCTTACCAGGGCAATTTTCTACATCATAATGCAGTGCCTTGGTGC
                                                                      | | | | |||  |      ||  |   | |   |  |    ||    |  |        | || || ||||  |||   ||  | | |      ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |  |||| ||||||||||| || || ||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||
------------------------------------------------------------------gaacccatgctattcagcaaagcataaaccaataacacgactacaagcaaccaagggccaccacacca-ctaatggttgttacctgctgct-gcaacaacagGAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTCGGGCTGTTCTTGGCCAGGAAGCTGTCCCTGACTAGGGCCATCTTCTACATTATCATGCAATGCCTGGGTGC

upper sequence: Vv02s0025g03390.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 1
lower sequence: AC209208.3_FGT002 (Zea mays), 3'ss of exon 1
gtgtgcaccactgctcttccttcctcagcctttctttagctttttctgttaaacactttactgggttgctctaagttcttcttcttcctttagccttctgatgtgggttgctcttagtgtgttttttagcat--ctgatggaagttttgtgtggtttgttgtctcagGAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGCTGTCTCTTACCAGGGCAATTTTCTACATCATAATGCAGTGCCTTGGTGC
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--------------------------------------------------------------gaactgtgaaagaatccatgcaattcagcaagcata-gaccaagaacacaactacaacaaccaaagacaccactaatggttgttacctgc----tactgcaacagGAGGACACATCAACCCAGCTGTGACTTTCGGGCTGTTCTTAGCCAGGAAGCTGTCCCTGACTAGGGCCCTCTTCTACATCATCATGCAATGCCTGGGTGC

upper sequence: Vv02s0025g03390.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 1
lower sequence: GRMZM2G174807_T01 (Zea mays), 3'ss of exon 1
gtgtgcaccactgctcttccttcctcagcctttctttagctt---tttctgttaaacactttactgggttgctctaagttcttcttcttcc--tttagccttctgatgtgggttgctcttagtgtgttttttagcatctgatggaagttttgtgtggtttgttgtct---------cagGAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGCTGTCTCTTACCAGGGCAATTTTCTACATCATAATGCAGTGCCTTGGTGC
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--gtaccgtac-acgccgcccgcccggccgcctctttggcttcgtcctctgtttctttcttcctctgcttgccttgcctcgtcgtttgtgcaaactggtttgctgatgtttctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctcttctcgcaactgcagGCGGGCACATCAACCCGGCGGTGACCTTCGGGCTGTTCCTGGCGAGGAAGTTGTCCCTCACCAGGGCGGTGTTTTACATCATCATGCAGTGCCTGGGCGC

upper sequence: Vv02s0025g03390.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 1
lower sequence: GRMZM2G174807_T03 (Zea mays), 3'ss of exon 1
gtgtgcaccactgctcttccttcctcagcctttctttagctttttctgttaaacactttactgggttgctctaagttcttcttcttcctttagccttctgatgtgggttgctcttagtgtgttttttagcatctgatggaagttttgtgtggtttgttgtctcag-
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-------------------------------------cgcaactgcaggcgggcacatcaacccg--gcggtgaccttcgggctgttcctggcgaggaagttgtccctcaccagggcggtgttttacatcatcatgcagTGCCTGGGCGCCATCTGCGGCGCGGGCGTCGTCAAGGGGTTCCAGCAGGGGCTGTACATGGGCAAC-GGCGGCGGCGCCAAC----GTCGTGGCGCCCGGCTACA----------------------

upper sequence: Vv02s0025g03390.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 1
lower sequence: GLYMA08G01860.1 (Glycine max), 3'ss of exon 1
gtgtgcaccactgctcttccttcctcagcctttctttagctttttctgttaaacactttactgggttgctctaagttcttcttcttcctttagccttctgatgtgggttgctcttagtgtgttttttagcatctgatggaagttttgtgtggtttgttgtctcagGAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGCTGTCTCTTACCAGGGCAATTTTCTACATCATAATGCAGTGCCTTGGTGC
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-----------------------------gtatacatattttttaccatattatggctcgatgt-ctgatctgaaacacatttttttttttgtttaaaggttttgaactaagccagatctgtgttt----gtttgttg---------------ttgttgttgcagGGGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGTTTTTGGCAAGGAAGCTGTCCCTAACAAGGGCACTGTTCTACATTATCATGCAGTGTCTTGGAGC

upper sequence: Vv02s0025g03390.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 1
lower sequence: GLYMA05G37730.1 (Glycine max), 3'ss of exon 1
gtgtgcaccactgctcttccttcctcagcctttctttagctttttctgttaaacactttactgggttgctctaagttcttcttcttcctt-tagccttctgatgtgggttgctcttagtgtgttttttagcatctgatggaagttttgtgtg-gtttgttgtctcagGAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGCTGTCTCTTACCAGGGCAATTTTCTACATCATAATGCAGTGCCTTGGTGC
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-------------------gtacccctccttttccttagaattttaggttg--tctttcacttatatacataatttttaccattttacttgtggatgtgggatctgaaacaaattt--ttttgttgaaaggttttgaactaagccagatctgtgtttgttgtttcagGGGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTCTTTTTGGCAAGGAAGCTGTCCCTCACAAGGGCGCTGTTCTACATTATCATGCAGTGTCTTGGAGC

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|77579610|gb|DV218654.1|DV218654
EST:     TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAG                         GAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
genomic: TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAGgtgtgcacca ... gttgtctcagGAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
EST: gi|110708782|gb|EE086719.1|EE086719
EST:     TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAA                         GAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
genomic: TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAGgtgtgcacca ... gttgtctcagGAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
EST: gi|110723264|gb|EE100374.1|EE100374
EST:     TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAG                         GAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
genomic: TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAGgtgtgcacca ... gttgtctcagGAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
EST: gi|110699602|gb|EE076742.1|EE076742
EST:     TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAG                         GAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
genomic: TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAGgtgtgcacca ... gttgtctcagGAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
EST: gi|110699335|gb|EE076243.1|EE076243
EST:     TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAG                         GAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
genomic: TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAGgtgtgcacca ... gttgtctcagGAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
EST: gi|110689831|gb|EE066398.1|EE066398
EST:     TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAG                         GAGGGCACATCAACCCAGCTGTTACCTTTGGTCTGCTGCTGGCAAGGAAGC
genomic: TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAGgtgtgcacca ... gttgtctcagGAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
EST: gi|110720668|gb|EE096792.1|EE096792
EST:     TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAG                         GAGGGCACATCAACCCAGCTGTTACCTTTGGTCTGCTGCTGGCAAGGAAGC
genomic: TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAGgtgtgcacca ... gttgtctcagGAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
EST: gi|352791310|gb|FQ475000.1|FQ475000
EST:     TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAG                         GAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
genomic: TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAGgtgtgcacca ... gttgtctcagGAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
EST: gi|110393386|gb|EC958589.1|EC958589
EST:     TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAG                         GAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
genomic: TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAGgtgtgcacca ... gttgtctcagGAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
EST: gi|110393439|gb|EC958679.1|EC958679
EST:     TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAG                         GAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
genomic: TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAGgtgtgcacca ... gttgtctcagGAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
EST: gi|71870234|gb|DT019289.1|DT019289
EST:     TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAG                         GAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
genomic: TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAGgtgtgcacca ... gttgtctcagGAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
EST: gi|33405135|gb|CF210762.1|CF210762
EST:     CTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAG                         GAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
genomic: TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAGgtgtgcacca ... gttgtctcagGAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
EST: gi|110700581|gb|EE077371.1|EE077371
EST:     TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAA                         GAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
genomic: TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAGgtgtgcacca ... gttgtctcagGAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
EST: gi|110707469|gb|EE083902.1|EE083902
EST:     TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAG                         GAGGGCACATCAACCCAGCTGTTACCTTTGGTCTGCTGCTGGCAAGGAAGC
genomic: TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAGgtgtgcacca ... gttgtctcagGAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
EST: gi|349829353|gb|FQ419885.1|FQ419885
EST:     TTTTGGTGGTACGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAG                         GAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
genomic: TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAGgtgtgcacca ... gttgtctcagGAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
EST: gi|110732981|gb|EE108745.1|EE108745
EST:     TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAG                         GAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
genomic: TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAGgtgtgcacca ... gttgtctcagGAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
EST: gi|87586384|gb|DY474671.1|DY474671
EST:     TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAG                         GAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
genomic: TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAGgtgtgcacca ... gttgtctcagGAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
EST: gi|110721648|gb|EE098886.1|EE098886
EST:     TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAG                         GAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
genomic: TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAGgtgtgcacca ... gttgtctcagGAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
EST: gi|110368183|gb|EC932152.1|EC932152
EST:     TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAG                         GAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
genomic: TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAGgtgtgcacca ... gttgtctcagGAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
EST: gi|110372544|gb|EC936722.1|EC936722
EST:     TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAG                         GAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
genomic: TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAGgtgtgcacca ... gttgtctcagGAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
EST: gi|352769085|gb|FQ471033.1|FQ471033
EST:     TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAG                         GAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
genomic: TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAGgtgtgcacca ... gttgtctcagGAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
EST: gi|110690792|gb|EE068272.1|EE068272
EST:     TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAG                         GAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
genomic: TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAGgtgtgcacca ... gttgtctcagGAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
EST: gi|71872140|gb|DT021195.1|DT021195
EST:     TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAG                         GAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
genomic: TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAGgtgtgcacca ... gttgtctcagGAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
EST: gi|71869347|gb|DT018402.1|DT018402
EST:     TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAG                         GAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
genomic: TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAGgtgtgcacca ... gttgtctcagGAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
EST: gi|71856238|gb|DT005293.1|DT005293
EST:     TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAG                         GAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
genomic: TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAGgtgtgcacca ... gttgtctcagGAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
EST: gi|29781752|gb|CB346481.2|CB346481
EST:     TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAG                         GAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
genomic: TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAGgtgtgcacca ... gttgtctcagGAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
EST: gi|34545199|gb|CF513431.1|CF513431
EST:     TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAG                         GAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
genomic: TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAGgtgtgcacca ... gttgtctcagGAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
EST: gi|351053538|gb|FQ459285.1|FQ459285
EST:     TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAG                         GAGGGCACATCAACCCAGCTGTTACCTTTGGTCTGCTGCTGGCAAGGAAGC
genomic: TTTTGGTGGTATGATCTTTGCCCTTGTCTACTGCACTGCTGGTATCTCAGgtgtgcacca ... gttgtctcagGAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGC
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 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

ctcttagtgtgttttttagcatctgatggaagttttgtgtggtttgttgtctcagGAGGACACATCAACCCAGCTGTGACCTTTGGTCTGCTACTGGCGAGGAAGCTGTCTCTTACCAGGGCAATTTTCTACATCATAATGCAGTGCCTTGGTGC
                    atctgat  putative branch site (score: 4)
                                              ttgtctc  putative PPT
         tgtttttta  TA-rich tract