Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   
2  
 5'  3'   
3  
 5'  3'   
4  
 5'  3'   
5  
 5'  3'   
6  
 5'  3'   
7  
 5'  3'   
8  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

...ttttatagtgaagggagaggagtgttttaatgaaatgcaagtttaattttaaagtctctgatggttcttccacccacttttcatttgggaaaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTGGAATCGATAGCATGGGAGGTTTCAATCCATCTTTAGATGCGATTCTAGA

Basic information

species Vitis vinifera
transcript Vv02s0012g01220.t01
intron # 1
splice site 3'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|351035793|gb|FQ463638.1|FQ463638
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|351039055|gb|FQ457730.1|FQ457730
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|351039429|gb|FQ461296.1|FQ461296
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|351012152|gb|FQ426874.1|FQ426874
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCATTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|351020007|gb|FQ439824.1|FQ439824
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|351037683|gb|FQ464124.1|FQ464124
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|349819169|gb|FQ412063.1|FQ412063
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|349812393|gb|FQ406414.1|FQ406414
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGGGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|349810757|gb|FQ403000.1|FQ403000
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGGGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|349813577|gb|FQ413811.1|FQ413811
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGGGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|349814512|gb|FQ399152.1|FQ399152
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|110685965|gb|EE063144.1|EE063144
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|349828788|gb|FQ419121.1|FQ419121
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|351035834|gb|FQ463679.1|FQ463679
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCATCCATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|351052068|gb|FQ455361.1|FQ455361
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|349821894|gb|FQ413065.1|FQ413065
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|349813688|gb|FQ413922.1|FQ413922
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGGGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|352790554|gb|FQ478193.1|FQ478193
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|349815736|gb|FQ400892.1|FQ400892
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|349807711|gb|FQ402102.1|FQ402102
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGGGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|349812553|gb|FQ407172.1|FQ407172
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|349810791|gb|FQ403034.1|FQ403034
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|352790571|gb|FQ478210.1|FQ478210
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|349825785|gb|FQ421884.1|FQ421884
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|349813428|gb|FQ413662.1|FQ413662
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGGGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|349812472|gb|FQ407091.1|FQ407091
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|349813316|gb|FQ411556.1|FQ411556
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGGGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|351043486|gb|FQ428958.1|FQ428958
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|349815127|gb|FQ410350.1|FQ410350
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|351053710|gb|FQ441476.1|FQ441476
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|349824480|gb|FQ413147.1|FQ413147
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|351030960|gb|FQ438996.1|FQ438996
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|349808733|gb|FQ406583.1|FQ406583
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGGGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|352790718|gb|FQ478266.1|FQ478266
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|351044823|gb|FQ449077.1|FQ449077
EST:     CCCCGTTTGGGGGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|351035608|gb|FQ463453.1|FQ463453
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|351031946|gb|FQ460203.1|FQ460203
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|351036805|gb|FQ457518.1|FQ457518
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|156737157|gb|EV241278.1|EV241278
EST:     GAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATTGG-TTCG                         GTATATAT-GTGCCATGGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGAC
genomic: GAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTA-TGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAAT-GGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGAC
EST: gi|349807969|gb|FQ402360.1|FQ402360
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGGGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|349816831|gb|FQ399699.1|FQ399699
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGGGCCGTTGCGAGGCTTAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|351044490|gb|FQ443021.1|FQ443021
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|349827282|gb|FQ421555.1|FQ421555
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|349821455|gb|FQ411076.1|FQ411076
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGCGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|352769545|gb|FQ468473.1|FQ468473
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|351052314|gb|FQ455486.1|FQ455486
EST:     CCCCGTTTGGGGGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|351044617|gb|FQ443148.1|FQ443148
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|349809026|gb|FQ407475.1|FQ407475
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|351040122|gb|FQ425208.1|FQ425208
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|349820691|gb|FQ408520.1|FQ408520
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|349815052|gb|FQ410275.1|FQ410275
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|351027681|gb|FQ446848.1|FQ446848
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|352769121|gb|FQ471069.1|FQ471069
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGTAGATTCATATGGTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|349820471|gb|FQ407027.1|FQ407027
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGGATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|351053126|gb|FQ455583.1|FQ455583
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|352790486|gb|FQ478126.1|FQ478126
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATACATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|349810548|gb|FQ402791.1|FQ402791
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGGGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCGTATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|351038381|gb|FQ461073.1|FQ461073
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|349824550|gb|FQ413217.1|FQ413217
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGGGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|351012567|gb|FQ430131.1|FQ430131
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|352794475|gb|FQ481708.1|FQ481708
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|349824314|gb|FQ417725.1|FQ417725
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|349828983|gb|FQ419515.1|FQ419515
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|351041784|gb|FQ455994.1|FQ455994
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|349816518|gb|FQ399507.1|FQ399507
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGGATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|349819433|gb|FQ412327.1|FQ412327
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|351036042|gb|FQ463887.1|FQ463887
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|351024867|gb|FQ430692.1|FQ430692
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|349821615|gb|FQ411115.1|FQ411115
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|349829230|gb|FQ419762.1|FQ419762
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|349813685|gb|FQ413919.1|FQ413919
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGTTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|351032974|gb|FQ461863.1|FQ461863
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|349810521|gb|FQ402764.1|FQ402764
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|349814106|gb|FQ414340.1|FQ414340
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|349813522|gb|FQ413756.1|FQ413756
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGCGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|349813221|gb|FQ411461.1|FQ411461
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGGGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|351041820|gb|FQ456030.1|FQ456030
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|351056059|gb|FQ453520.1|FQ453520
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|351042406|gb|FQ442873.1|FQ442873
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|349807185|gb|FQ401177.1|FQ401177
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGGGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|351051668|gb|FQ449482.1|FQ449482
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|349819478|gb|FQ413362.1|FQ413362
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGGGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|351053531|gb|FQ459278.1|FQ459278
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|351035812|gb|FQ463657.1|FQ463657
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCCATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|351048131|gb|FQ442101.1|FQ442101
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|349811864|gb|FQ410661.1|FQ410661
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|351042283|gb|FQ442750.1|FQ442750
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|351049340|gb|FQ429083.1|FQ429083
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|351046414|gb|FQ453030.1|FQ453030
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|351029667|gb|FQ427507.1|FQ427507
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTTAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|349816147|gb|FQ399378.1|FQ399378
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGGGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|351054597|gb|FQ456794.1|FQ456794
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|349810664|gb|FQ402907.1|FQ402907
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGCGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|352790569|gb|FQ478208.1|FQ478208
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|351044334|gb|FQ452886.1|FQ452886
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|349810251|gb|FQ401697.1|FQ401697
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGGGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|352798910|gb|FQ480759.1|FQ480759
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|351037645|gb|FQ462629.1|FQ462629
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|349820112|gb|FQ404834.1|FQ404834
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
EST: gi|349819332|gb|FQ412226.1|FQ412226
EST:     CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCG                         GTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG
genomic: CCCCGTTTGGGAGAAGATCGGAGCCGTTGTGAGGCTCAGCTATGGAATCGgtattgctct ... aaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTG


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

attttaaagtctctgatggttcttccacccacttttcatttgggaaaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTGGAATCGATAGCATGGGAGGTTTCAATCCATCTTTAGATGCGATTCTAGA
          ctctgat  putative branch site (score: 4)
 ttttt  putative PPT
 aaaattttta  TA-rich tract
















Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
ttttatagtgaagggagaggagtgttttaatgaaatgcaagtttaattttaaagtctctgatggttcttccacccacttttcatttgggaaaatttttagGTATATATGGTGCAATGGCTTTAGCGGGAAGATTCATATGCTCAATGACTGGAATCGATAGCATGGGAGGTTTCAATCCATCTTTAGATGCGATTCTAGA

- - - - - - - - - - - - - - aatgaaa
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -ctgatgg