Mapped EST sequences
Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments
ATGC EST sequence
ATGC genomic sequence (exon)
ATGC genomic sequence (truncated intron)
EST:
gi|32249457|gb|CD715276.1|CD715276EST: TGCCCTTGTTTCACCAAATTGCTCGTTGCTTGAACAGCTCACACTTCCAG GTGGCAGAGAGAGCTTTGTTCCTATGGAATAATGGTCACATTGAGAACTTA
genomic: TGCCCTTGTTTCACCAAATTGCTCGTTGCTTGAACAGCTCACACTTCCAGgtatcatgtt ... gttttttcagGTGGCAGAGAGAGCTTTGTTCCTATGGAATAATGGTCACATTGAGAACTTA
EST:
gi|30324324|gb|CD007586.1|CD007586EST: TGCCCTTGTTTCACCAAATTGCTCGTTGCTTGAACAGCTCACACTTCCAG GTGGCAGAGAGAGCTTTGTTCCTATGGAATAATGGTCACATTGAGAACTTA
genomic: TGCCCTTGTTTCACCAAATTGCTCGTTGCTTGAACAGCTCACACTTCCAGgtatcatgtt ... gttttttcagGTGGCAGAGAGAGCTTTGTTCCTATGGAATAATGGTCACATTGAGAACTTA
EST:
gi|110722778|gb|EE099336.1|EE099336EST: TGCCCTTGTTTCACCAAATTGCTCGTTGCTTGAACAGCTCACACTTCCAG GTGGCAGAGAGAGCTTTGTTCCTATGGAATAATGGTCACATTGAGAACTTA
genomic: TGCCCTTGTTTCACCAAATTGCTCGTTGCTTGAACAGCTCACACTTCCAGgtatcatgtt ... gttttttcagGTGGCAGAGAGAGCTTTGTTCCTATGGAATAATGGTCACATTGAGAACTTA
EST:
gi|32248274|gb|CD714093.1|CD714093EST: TGCCCTTGTTTCACCAAATTGCTCGTTGCTTGAACAGCTCACACTTCCAG GTGGCAGAGAGAGCTTTGTTCCTATGGAATAATGGTCACATTGAGAACTTA
genomic: TGCCCTTGTTTCACCAAATTGCTCGTTGCTTGAACAGCTCACACTTCCAGgtatcatgtt ... gttttttcagGTGGCAGAGAGAGCTTTGTTCCTATGGAATAATGGTCACATTGAGAACTTA
EST:
gi|32269112|gb|CD718271.1|CD718271EST: TGCCCTTGTTTCACCAAATTGCTCGTTGCTTGAACAGCTCACACTTCCAG GTGGCAGAGAGAGCTTTGTTCCTATGGAATAATGGTCACATTGAGAACTTA
genomic: TGCCCTTGTTTCACCAAATTGCTCGTTGCTTGAACAGCTCACACTTCCAGgtatcatgtt ... gttttttcagGTGGCAGAGAGAGCTTTGTTCCTATGGAATAATGGTCACATTGAGAACTTA
EST:
gi|110703768|gb|EE080905.1|EE080905EST: TGCCCTTGTTTCACCAAATTGCTCGTTGCTTGAACAGCTCACACTTCCAG GTGGCAGAGAGAGCTTTGTTCCTATGGAATAATGGTCACATTGAGAACTTA
genomic: TGCCCTTGTTTCACCAAATTGCTCGTTGCTTGAACAGCTCACACTTCCAGgtatcatgtt ... gttttttcagGTGGCAGAGAGAGCTTTGTTCCTATGGAATAATGGTCACATTGAGAACTTA
atgc intronic sequence ATGC exonic sequenceIntronic sequence truncated to 55 bases.atgttgtctttaatttctgaatcacactccttgaaactgatgcttgttttttcagGTGGCAGAGAGAGCTTTGTTCCTATGGAATAATGGTCACATTGAGAACTTAATCAAACAAAATCGCGGTATTATATTGCCCATCATCTTCCCTGCCTTGG
aactgat putative branch site (score: 3)
cttgttttttc CT-rich tract
tttaatttctgaat TA-rich tract