Mapped EST sequences
Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments
ATGC EST sequence
ATGC genomic sequence (exon)
ATGC genomic sequence (truncated intron)
EST:
gi|110411387|gb|EC977098.1|EC977098EST: GGAGCTTCCATGGTTGAGCCTTGGTTGGCGGCTCATGGCGATCCTTCCAG GTGTGTTCTCCTTGGGGTGAGCTGTGGTGCAAATATTGCAGACTATGTGGC
genomic: GGAGCTTCCATGGTTGAGCCTTGGTTGGCGGCTCATGGCGATCCTTCCAGgtattgcatt ... attgaaacagGTGTGTTCTCCTTGGGGTGAGCTGTGGTGCAAATATTGCAGACTATGTGGC
EST:
gi|71884839|gb|DT033894.1|DT033894EST: GGAGCTTCCATGGTTGAGCCTTGGTTGGCGGCTCATGGCGATCCTTCCAG GTGTGTTCTCCTTGGGGTGAGCTGTGGTGCAAATATTGCAGACTATGTGGC
genomic: GGAGCTTCCATGGTTGAGCCTTGGTTGGCGGCTCATGGCGATCCTTCCAGgtattgcatt ... attgaaacagGTGTGTTCTCCTTGGGGTGAGCTGTGGTGCAAATATTGCAGACTATGTGGC
EST:
gi|110406133|gb|EC971694.1|EC971694EST: GGAGCTTCCAGGGTTGAGCCTTGGTTGGCGGCTCATGGCGATCCTTCCAG GTGTGTTCTCCTTGGGGTGAGCTGTGGTGCAAATATTGCAGACTATGTGGC
genomic: GGAGCTTCCATGGTTGAGCCTTGGTTGGCGGCTCATGGCGATCCTTCCAGgtattgcatt ... attgaaacagGTGTGTTCTCCTTGGGGTGAGCTGTGGTGCAAATATTGCAGACTATGTGGC
EST:
gi|71887067|gb|DT036122.1|DT036122EST: GGAGCTTCCATGGTTGAGCCTTGGTTGGCGGCTCATGGCGATCCTTCCAG GTGTGTTCTCCTTGGGGTGAGCTGTGGTGCAAATATTGCAGACTATGTGGC
genomic: GGAGCTTCCATGGTTGAGCCTTGGTTGGCGGCTCATGGCGATCCTTCCAGgtattgcatt ... attgaaacagGTGTGTTCTCCTTGGGGTGAGCTGTGGTGCAAATATTGCAGACTATGTGGC
EST:
gi|71890263|gb|DT039318.1|DT039318EST: GGAGCTTCCATGGTTGAGCCTTGGTTGGCGGCTCATGGCGATCCTTCCAG GTGTGTTCTCCTTGGGGTGAGCTGTGGTGCAAATATTGCAGACTATGTGGC
genomic: GGAGCTTCCATGGTTGAGCCTTGGTTGGCGGCTCATGGCGATCCTTCCAGgtattgcatt ... attgaaacagGTGTGTTCTCCTTGGGGTGAGCTGTGGTGCAAATATTGCAGACTATGTGGC
EST:
gi|77588777|gb|DV223608.1|DV223608EST: GGAGCTTCCATGGTTGAGCCTTGGTTGGCGGCTCATGGCGATCCTTCCAG GTGTGTTCTCCTTGGGGTGAGCTGTGGTGCAAATATTGCAGACTATGTGGC
genomic: GGAGCTTCCATGGTTGAGCCTTGGTTGGCGGCTCATGGCGATCCTTCCAGgtattgcatt ... attgaaacagGTGTGTTCTCCTTGGGGTGAGCTGTGGTGCAAATATTGCAGACTATGTGGC
EST:
gi|71889359|gb|DT038414.1|DT038414EST: GGAGCTTCCATGGTTGAGCCTTGGTTGGCGGCTCATGGCGATCCTTCCAG GTGTGTTCTCCTTGGGGTGAGCTGTGGTGCAAATATTGCAGACTATGTGGC
genomic: GGAGCTTCCATGGTTGAGCCTTGGTTGGCGGCTCATGGCGATCCTTCCAGgtattgcatt ... attgaaacagGTGTGTTCTCCTTGGGGTGAGCTGTGGTGCAAATATTGCAGACTATGTGGC
EST:
gi|77588991|gb|DV223750.1|DV223750EST: GGAGCTTCCATGGTTGAGCCTTGGTTGGCGGCTCATGGCGATCCTTCCAG GTGTGTTCTCCTTGGGGTGAGCTGTGGTGCAAATATTGCAGACTATGTGGC
genomic: GGAGCTTCCATGGTTGAGCCTTGGTTGGCGGCTCATGGCGATCCTTCCAGgtattgcatt ... attgaaacagGTGTGTTCTCCTTGGGGTGAGCTGTGGTGCAAATATTGCAGACTATGTGGC
atgc intronic sequence ATGC exonic sequenceIntronic sequence truncated to 55 bases.tttacgtgtaacaatgcatcttgaagatcactaacccagcctgctattgaaacagGTGTGTTCTCCTTGGGGTGAGCTGTGGTGCAAATATTGCAGACTATGTGGCTCGGAGGTCTGTAGAGGCAGGCAAGCTTTTAGACCCTGTTAAGGTGGTG
cactaac putative branch site (score: 1)
tattgaaa TA-rich tract