1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' |
gtgactttgttaaacctcactctgttgcaagcaattaatttattgctgtttggtttttagATGGCTTTGGCTGCGAGAAGTGCAAATGGTCATGGCTGGCTTCGGCCTGCTTTGGGAGTAATGGACTTGTCTCAAAGCTTCTTTCAG
species | Selaginella moellendorffii |
transcript | EFJ37559 |
intron # | 7 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TTGCACGTATTATCCAGCTTACGCCACGCCTCCTTGAAGAGCTGATGAAG ATGGCTTTGGCTGCGAGAAGTGCAAATGGTCATGGCTGGCTTCTACCTGCTEST: gi|169060098|gb|FE468084.1|FE468084
genomic: TTGCACGTATTATCCAGCTTACGCCACGCCTCCTTGAAGAGCTGATGAAGgtgactttgt ... tggtttttagATGGCTTTGGCTGCGAGAAGTGCAAATGGTCATGGCTGGCTTCGGCCTGCT
EST: TTGCACGTATTATCCAGCTTACGCCACGCCTCCTTGAACAGCTGATGAAG ATGGCTTTGGCTGCGAGAAGTGCACATGGTCATGGNCTGGCTTCEST: gi|169020381|gb|FE431628.1|FE431628
genomic: TTGCACGTATTATCCAGCTTACGCCACGCCTCCTTGAAGAGCTGATGAAGgtgactttgt ... tggtttttagATGGCTTTGGCTGCGAGAAGTGCAAATGGTCATGG-CTGGCTTC
EST: TTGCACGTATTATCCAGCTTACGCCACGCCTCCTTGAAGAGCTGATGAAG ATGGCTTTGGCTGCGAGAAGTGCAAATGGTCATGGCTGGCTTCGGCCTGCT
genomic: TTGCACGTATTATCCAGCTTACGCCACGCCTCCTTGAAGAGCTGATGAAGgtgactttgt ... tggtttttagATGGCTTTGGCTGCGAGAAGTGCAAATGGTCATGGCTGGCTTCGGCCTGCT
tttgttaaacctcactctgttgcaagcaattaatttattgctgtttggtttttagATGGCTTTGGCTGCGAGAAGTGCAAATGGTCATGGCTGGCTTCGGCCTGCTTTGGGAGTAATGGACTTGTCTCAAAGCTTCTTTCAG
aattaat putative branch site (score: 11)
ttttt putative PPT
aagcaattaatttatt TA-rich tract