1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
gtatggtttccaagacttttatgtttggttctgatgtacatatcattggctggcctgtctgtagTGGTGCGAGCGACGAGTCTTCGGTGCCTTTGCCTTCGGTCCAAACAAGTGCTCTCGGCTATGGTGCTTTCCTTGGCTTATCCGGAAACTTGAGATACCAG
species | Selaginella moellendorffii |
transcript | EFJ23824 |
intron # | 6 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GCTGCTGGAGCGGGATTGTCAAAGGCTTGCATTACTTTGAGAAAGCAGCG TGGTGCGAGCGACGAGTCTTCGGTGCCTTTGCCTTCGGTCCAAACAAGTGCEST: gi|169053376|gb|FE460467.1|FE460467
genomic: GCTGCTGGAGCGGGATTGTCAAAGGCTTGCATTACTTTGAGAAAGCAGCGgtatggtttc ... ctgtctgtagTGGTGCGAGCGACGAGTCTTCGGTGCCTTTGCCTTCGGTCCAAACAAGTGC
EST: GCTGCTGGAGCGGGATTGTCAAAGGCTTGCATTACTTTGAGAAAGCAGCG TGGTGCGAGCGACGAGTCTTCGGTGCCTTTGCCTTCGGTCCAAACAAGTGC
genomic: GCTGCTGGAGCGGGATTGTCAAAGGCTTGCATTACTTTGAGAAAGCAGCGgtatggtttc ... ctgtctgtagTGGTGCGAGCGACGAGTCTTCGGTGCCTTTGCCTTCGGTCCAAACAAGTGC
ccaagacttttatgtttggttctgatgtacatatcattggctggcctgtctgtagTGGTGCGAGCGACGAGTCTTCGGTGCCTTTGCCTTCGGTCCAAACAAGTGCTCTCGGCTATGGTGCTTTCCTTGGCTTATCCGGAAACTTGAGATACCAG
ttctgat putative branch site (score: 48)
cctgtct putative PPT
ttttatgttt TA-rich tract